Меню PUSHKAR

ПОДДЕРЖАНИЕ ЗДОРОВОГО МИКРОБИОМА. ПУТЕВОДИТЕЛЬ ПО ПРОБИОТИКАМ.

| 10 сентября 2020
ПОДДЕРЖАНИЕ ЗДОРОВОГО МИКРОБИОМА. ПУТЕВОДИТЕЛЬ ПО ПРОБИОТИКАМ.
Кишечная бактерия делится на две, превращаясь в две новые бактериальные клетки. / Фото: Centre For Infections/Science Photo Library/Corbis

1Обзор

РЕЗЮМЕ И КРАТКИЕ ФАКТЫ
  • Большинство людей знакомы с важностью микробиома для здоровья кишечника, но могут не знать, что микробиом может влиять на все, от настроения до здоровья сердца.
  • Этот протокол расскажет вам о широком влиянии микробиома и о том, что вы можете сделать, чтобы сохранить его здоровым.
  • Добавки с пробиотиками и диета с упором на необработанные продукты растительного происхождения могут иметь большое значение для улучшения здоровья микробиома и общего состояния здоровья.

Автор: доктор Шайна Сандхаус (Dr. Shayna Sandhaus), PhD (доктор наук).

Что такое микробиом?

Микробиом - это сообщество, окружающая среда и генетический материал микробов, обитающих в организме человека. По оценкам, в организме по крайней мере такое же количество микробных клеток, что и человеческих клеток. Люди часто связывают микробиом со здоровьем кишечника; однако исследования продемонстрировали роль микробиома во многих областях здоровья человека.

Изучение микробиома привело к поразительным открытиям: микробы в нашем организме участвуют в работе кишечника, мозга, полости рта, сердца и иммунитета, и это лишь некоторые из них. Мы только недавно открыли для себя влияние микробиома на общее состояние здоровья.

Естественные вмешательства, такие как пробиотики и улучшенная диета, могут помочь сбалансировать микробиом и улучшить многие аспекты здоровья.

Какие факторы способствуют развитию и нарушениям микробиома?

  • Вагинальные роды по сравнению с кесаревым сечением
  • Использование антибиотиков
  • Режимы питания
  • Гормональные циклы и многое другое

Какие последствия для здоровья связаны с несбалансированным микробиомом?

Сдвиг в микробиоме, который снижает количество полезных видов и/или увеличивает количество потенциально вредных видов, известен как дисбиоз (дисбактериоз). Дисбактериоз кишечника связан со многими хроническими заболеваниями и состояниями, включая:

  • Аллергии
  • Рак
  • Ожирение
  • Депрессия
  • Дырявый кишечник и хроническое воспаление
  • Избыточный бактериальный рост в тонком кишечнике (СИБР)
  • Сердечно-сосудистые заболевания и др.

Какие изменения в питании и образе жизни могут быть полезны для микробиома?

  • Включите в свой рацион больше клетчатки (цельнозерновые, бобовые, фрукты и овощи) и меньше животных белков и насыщенных жиров
  • Добавьте в свой рацион жирные кислоты омега-3 и ферментированные продукты, такие как йогурт, соевый соус и мисо
  • Избегайте чрезмерного употребления алкоголя
  • Высыпайтесь и старайтесь эффективно справляться со стрессом
  • Регулярно занимайтесь спортом

Какие существуют новые методы лечения для здоровья микробиома?

  • Трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ)
  • Фаговая терапия (вирусы атакуют вредоносные бактерии, оставляя нетронутыми полезные бактерии и человеческие клетки)

Что такое пробиотики?

Пробиотики - это живые микроорганизмы, такие как бактерии, которые могут способствовать укреплению здоровья при попадании в организм. Обычно используемые виды бактерий относятся к родам Lactobacillus и Bifidobacterium. Пробиотики в целом безопасны; однако люди в очень пожилом возрасте, очень молодой или с ослабленным иммунитетом (например, больные раком, пациенты, принимающие иммунодепрессанты и т.д.) должны проконсультироваться с врачом перед тем, как попробовать пробиотик.

Какие пробиотики могут быть полезны для здоровья?

  • Здоровье пищеварительной системы. L. reuteri, Saccharomyces boulardii и L. rhamnosus могут сократить продолжительность или предотвратить начало диареи. Другие штаммы могут быть эффективными для снятия вздутия живота, синдрома раздраженного кишечника, рефлюкса и многого другого.
  • Сердечно-сосудистое здоровье. L. casei и L. plantarum могут помочь уменьшить или предотвратить развитие гипертонии. L. acidophilus, L. reuteri и L. plantarum могут помочь снизить уровень холестерина.
  • Здоровье полости рта. L. reuteri может уменьшить образование зубного налета и улучшить здоровье полости рта у людей с заболеваниями пародонта. Другие штаммы могут улучшить здоровье полости рта и уменьшить образование кариеса.
  • Здоровье кожи. Ранние клинические исследования показали, что L. acidophilus и B. bifidum могут помочь уменьшить угри. Смесь штаммов видов Lactobacillus и Bifidobacterium может помочь улучшить или снизить риск экземы.
  • Здоровье влагалища и мочевыводящих путей. Комбинации пробиотиков Lactobacillus были эффективны в профилактике и лечении дисбактериоза влагалища, и недавние результаты показывают, что длительный прием добавок Lactobacillus также может помочь избавиться от генитальная ВПЧ-инфекция (HPV).
  • Респираторное и иммунное здоровье. Было показано, что специализированный высушенный дрожжевой ферментат из S. cerevisiae снижает сезонную аллергию, а L. rhamnosus, а также другие штаммы пробиотиков могут снижать возникновение инфекций верхних дыхательных путей.
  • Психическое здоровье. Было показано, что L. helveticus в сочетании с B. longum улучшает настроение и самочувствие.

2Введение

Человеческое тело находится в динамичных и взаимозависимых отношениях с микробами. Кожа, пищеварительный тракт, дыхательные пути, влагалище, глаза и уши имеют уникальные микробные экосистемы (Sender 2016; Proctor 2017; Thursby 2017; Huang 2011; Martin 2012; Dibb 1990; Lu, Liu 2016). Есть даже свидетельства того, что участки тела, которые долгое время считались стерильными, такие как плацента, мочевыводящие пути, матка, легкие, кровь и даже мозг, могут содержать сообщества микробов (Falana 2015; Potgieter 2015; Branton 2013; Whiteside 2015; O'Dwyer 2016; Chen 2017; Thomas-White 2016). У здоровых людей эти сложные экосистемы включают целый ряд микроорганизмов, от бактерий и вирусов до грибов и эукариотов (Lloyd-Price 2016). Эти сообщества микроорганизмов не рассматриваются исключительно как резервуар для инфекции, а теперь считаются важными для нашего здоровья как отдельных людей, так и видов (Davenport 2017; Turnbaugh 2007).

Исторически термин микробиом использовался для обозначения генетического материала микробов, тогда как микробиота относится к сообществу микробных видов (Knight 2017; D'Argenio 2015). Эти термины стали использоваться как синонимы. В этом протоколе микробиом будет использоваться для обозначения обеих групп микроорганизмов и их комбинированного генетического материала.

Количество микробных клеток, которые мы поддерживаем, оценивается как минимум эквивалентно количеству человеческих клеток в организме (Sender 2016; Knight 2017). Микробиом кишечника, который является самой большой подгруппой микробиома человека, включает более 1000 различных видов бактерий (у разных людей) (Koboziev, 2014; Lloyd-Price, 2016) и составляет около 2-4 фунтов (900-1800 граммов) массы тела на человека (D'Argenio 2015). Кроме того, в кишечнике было обнаружено около 5 миллионов микробных генов, что намного больше, чем примерно 22 000 генов, кодирующих белок, во всем геноме человека (Ursell 2012; D'Argenio 2015). Только недавно мы начали понимать и ценить важность наших эволюционных отношений с нашими микробными экосистемами (Davenport 2017).

Этот протокол описывает микробиом в целом и его региональные подмножества. Он представляет собой краткое изложение того, что ученые знают о том, как микробиом взаимодействует с нашими собственными клетками и влияет на наше здоровье. Этот протокол также суммирует, как микробиом формируется и поддерживается, и представляет стратегии питания и образа жизни для поддержки здоровых микробных сообществ, а также новые и появляющиеся технологии для управления микробиомом: трансплантация фекальной микробиоты и фаговая терапия. Наконец, в этом протоколе подробно описаны текущие и новые исследования по использованию пробиотиков - живых полезных микроорганизмов - для профилактики и лечения заболеваний.

3Предпосылки

Исследования микробиома

Проект «микробиом человека» (HMP) был запущен в 2008 году Национальными институтами здравоохранения (NIH) США как расширение проекта «Геном человека» (Turnbaugh 2007; Huse 2012; Peterson 2009). Это постоянное всемирное мероприятие, направленное на понимание микробных сообществ и их вариаций у здоровых людей и на них (Turnbaugh 2007), начиная с пяти основных частей тела: желудочно-кишечного тракта, кожи, влагалища, дыхательных путей и полости рта (Gevers 2012). Основная цель HMP - создать ресурс для определения того, как измененные микробные паттерны могут способствовать развитию болезни и как восстановить здоровый микробный баланс (Ursell 2012; Gevers 2012; Foxman 2010). Благодаря достижениям в технологиях секвенирования генов знания о микробиоме быстро расширяются (Knight 2017).

Микробиом человека чрезвычайно разнообразен и неожиданно изменчив: в то время как только около 0,5% генома человека варьируется от человека к человеку, микробиом может сильно отличаться от человека к человеку (Ursell 2012; Mayor 2007). Во многом эта вариабельность обусловлена различиями в диете, окружающей среде, генетике, использовании антибиотиков и воздействии микробов на раннем этапе жизни (Human Microbiome Project Consortium 2012; Lloyd-Price 2016; Wischmeyer 2016). Разнообразие и вариабельность микробиома человека делает его характеристику чрезвычайно сложной (Ursell 2012; Lloyd-Price 2016; Johnson 2016; Lozupone 2012).

Полезные микробы

Самый крупный и наиболее тщательно изученный компонент микробиома человека находится в кишечнике. Исследователи микробиома подсчитали, что каждый человек является хозяином около 160 различных видов кишечных бактерий (Lloyd-Price 2016). Виды Lactobacillus (Лактобациллы) и Bifidobacterium (Бифидобактерии), встречающиеся во время рождения и присутствующие в грудном молоке, являются одними из первых колонизаторов кишечника младенца и формируют последующую колонизацию с другими видами (Koboziev 2014). В то время как виды Lactobacillus и Bifidobacterium становятся менее многочисленными в кишечном микробиоме взрослых по сравнению с младенцами (Arboleya 2016; Sghir 2000), они были в центре внимания из-за их благотворного воздействия на здоровье, модуляции диетой и окружающей средой и возможных терапевтических эффектов при использовании в качестве пробиотических добавок (Evivie 2017; O'Callaghan 2016; Derrien 2015; Rodriguez 2015).

Функции здорового микробиома

Пищеварение

Микробы в кишечнике вырабатывают ферменты, которые могут расщеплять определенные пищевые компоненты, которые не под силу только пищеварительным механизмам человека (Thursby 2017; Kau 2011). Таким образом, здоровый микробиом позволяет нам воспринимать неперевариваемую растительную пищу и извлекать из нее недоступные в противном случае питательные вещества (Turnbaugh 2007; Krajmalnik-Brown 2012).

Микробные ферменты особенно важны для расщепления неперевариваемых и частично усваиваемых углеводов, включая некоторые крахмалы и волокна. Это увеличивает способность организма извлекать и поглощать моносахариды (единичные сахара), которые можно превратить в энергию (Flint 2012; Krajmalnik-Brown 2012). Кишечные бактерии метаболизируют и активируют многие растительные полифенолы и другие фитохимические вещества, что может иметь важные последствия для здоровья (Ozdal 2016; Tomas-Barberan 2016; Theilmann 2017; Swanson 2015). Например, некоторые кишечные бактерии превращают лигнаны и изофлавоны в активные соединения, связанные с улучшением передачи сигналов женских гормонов (Gaya 2016).

Микробиом кишечника также оснащен ферментами для переваривания пищевых белков. Некоторые микробы являются более эффективными переваривающими веществами, чем другие. Некоторые из побочных продуктов микробного переваривания белков могут иметь токсические эффекты, которые могут способствовать негативным последствиям для здоровья. Диета в западном стиле с высоким содержанием животного белка и низким содержанием неперевариваемых волокон оказывает значительное пагубное влияние на состав микробиома кишечника, поддерживая виды, которые могут лучше всего адаптироваться к среде с высоким содержанием белка (Montemurno 2014; Graf 2015; David 2014).

Микробные побочные продукты

Основным метаболическим путем, используемым кишечными микробами для производства энергии, является ферментация, которая представляет собой метаболический процесс, не требующий кислорода (Thursby 2017; Monda 2017). Основными побочными продуктами микробной ферментации, в первую очередь пищевых волокон, являются короткоцепочечные жирные кислоты, включая бутират, ацетат и пропионат. Короткоцепочечные жирные кислоты являются не только основным источником энергии для клеток, выстилающих толстую кишку, но также регулируют иммунную активность, предотвращают инфекции, уменьшают воспаление, улучшают усвоение минералов, таких как кальций, обладают противораковыми свойствами и могут влиять на уровни холестерина, аппетит и увеличение веса (Sharon 2014; Flint 2012; Krajmalnik-Brown 2012; Whisner 2017).

Побочные продукты белковой ферментации несколько отличаются от продуктов углеводной ферментации и включают ряд потенциально токсичных соединений. Считается, что некоторые из этих токсичных побочных продуктов способствуют возникновению проблем со здоровьем, связанных с диетами с высоким содержанием животного белка, таких как рак толстой кишки и некоторые хронические заболевания (Montemurno 2014).

Желчные кислоты являются основными компонентами желчи, которая выделяется из желчного пузыря в тонкий кишечник во время пищеварения (Taoka 2016). Микробные ферменты превращают желчные кислоты в широкий спектр побочных продуктов, некоторые из которых реабсорбируются (Ryan 2017). Помимо помощи в переваривании и усвоении жиров и жирных соединений, реабсорбированные желчные кислоты и их побочные продукты помогают регулировать метаболизм липидов и глюкозы и производство энергии (Taoka 2016; Ryan 2017). Как желчные кислоты модулируют кардио-метаболические состояния, такие как ожирение, диабет, ожирение печени и болезни сердца, все еще изучается (Ryan 2017; Chiang 2017).

Интересно, что желчные кислоты также способствуют формированию микробиома кишечника за счет антимикробных эффектов и взаимодействия с иммунной системой (Ramirez-Perez 2017; Chiang 2017; Ridlon 2014; Nie 2015). Желчные кислоты могут быть одним из способов связать диету, которая влияет на типы продуцируемых желчных кислот, с составом микробных популяций кишечника, который может поддерживаться или подавляться наличием определенных желчных кислот (Ridlon 2014; Islam 2011; Wahlstrom 2016).

К другим побочным продуктам микробной активности, которые приносят пользу человеку-хозяину, относятся витамины группы B, витамин K и аминокислоты, такие как триптофан (Jandhyala 2015; Etienne-Mesmin 2017; Conly 1992; Morowitz 2011; Paiva 1998). Некоторые соединения, производные триптофана, оказывают важное влияние на функции иммунной и нервной систем (Cervenka 2017; Jenkins 2016). Например, примерно 90% серотонина в организме вырабатывается в желудочно-кишечном тракте из триптофана (Sharon 2014; Kato 2013; Mawe 2013). Бактерии, которые колонизируют кишечник, могут также продуцировать другие нейротрансмиттеры, такие как ацетилхолин, норадреналин, дофамин и гамма-аминомасляная кислота (ГАМК) (Clark 2016; Galland 2014). Эти нейротрансмиттеры оказывают множество периферических эффектов, таких как модуляция реакции на стресс, которая в конечном итоге влияет на функцию мозга и настроение (Galland 2014; Jenkins 2016; Robson 2017).

Микробы кишечника играют важную роль в метаболизме некоторых лекарств, в некоторых случаях активируя их до абсорбции (всасывания) (Noh 2017). Некоторые из этих лекарств, такие как противодиабетический препарат метформин, по-видимому, по крайней мере частично зависят от изменения микробиома кишечника для достижения своего терапевтического эффекта (Wu 2017; Rena 2017). В одном отчете о случае нацеливание на рост полезных микробов с помощью пищевых добавок улучшило как переносимость, так и эффективность метформина (Greenway 2014). Основываясь на этом интригующем отчете о случае, исследователи провели небольшое клиническое исследование с участием 10 диабетиков. Они обнаружили, что добавление питательных веществ, нацеленных на микробиом, инулина агавы, бета-глюкана овса и полифенолов голубики, улучшило переносимость и эффективность метформина (Burton 2015). Кишечные микробы также помогают перерабатывать и выводить токсины из вредных соединений окружающей среды, таких как канцерогены (Turnbaugh 2007; Moon 2016).

Инфекционный контроль

Важнейшая функция микробиома - предотвращение чрезмерного роста вредных микробов. Вот некоторые механизмы, с помощью которых это достигается: поддержание кислотного pH; секретирование антимикробных веществ; подавление микробной токсичности; борьба за питательные вещества и ресурсы; предотвращение прилипания вредных организмов к поверхностным клеткам; и активация местных иммунных клеток (Tosh 2012; Surendran Nair 2017; Knaus 2017).

Иммунная регуляция

Микробиом играет важную роль в иммунной регуляции (Gulden 2017). Почти все ткани и органы, независимо от того, находятся ли они в прямом контакте с микробиотой или дальше от нее, находятся под влиянием микробиоты. Микробы и их продукты взаимодействуют с иммунной системой, способствуют ее развитию и созреванию, а также регулируют иммунный ответ (Brown 2017; Shi 2017; Correa-Oliveira 2016; Shibata 2017; Belkaid 2014).

Иммунорегулирующая роль микробиома также помогает предотвратить дисфункциональную иммунную активность, которая может привести к аллергии, аутоиммунным заболеваниям и хроническим воспалительным состояниям (Brown 2017; Fujimura 2015). Нарушения микробиома были связаны с хроническими воспалительными состояниями, такими как пародонтоз, бактериальный вагиноз, атопический дерматит, воспалительное заболевание кишечника, ревматоидный артрит и ожирение (Correa-Oliveira 2016; Yamazaki 2017). Кроме того, взаимодействия между микробиомом кишечника и иммунной системой важны для стимулирования обновления и восстановления клеток, выстилающих эпителий кишечника, где находится микробиом кишечника (Turnbaugh 2007).

Метаболизм

Микробиом, особенно в кишечнике, по-видимому, играет важную роль в регулировании метаболизма. Было показано, что с самого начала жизни факторы, формирующие микробиом, являются индикаторами риска ожирения или метаболических заболеваний. Например, роды с помощью кесарева сечения, диета на основе смесей, болезнь и использование антибиотиков в раннем возрасте коррелируют с более высокими показателями избыточного веса и ожирения у детей (Rosenbaum 2015; Mueller 2015; Korpela 2016; Li 2017). Использование антибиотиков матерью во время беременности или грудного вскармливания также влияет на микробиом младенца и коррелирует с риском детского ожирения (Cassidy-Bushrow 2017; Lemas 2016; Mor 2015).

Паттерны микробного дисбаланса кишечника наблюдались у взрослых с метаболическими заболеваниями, такими как ожирение, неалкогольная жировая болезнь печени и диабет 2 типа (Sedighi 2017; He 2017; Lippert 2017; Ma 2017). Определенные диетические изменения, такие как потребление большего количества клетчатки или капсаицина из перца чили, ограничение калорий и потеря веса, были связаны с полезными изменениями в микробиоме кишечника, которые могут способствовать улучшению метаболических нарушений. С другой стороны, диета с высоким содержанием жира, белка и сахара может нарушить здоровый микробиом (Vinke 2017; Rosenbaum 2015; Yang 2017; Ley 2006; Kang, Wang 2017; Singh 2017; Kang 2016; Turnbaugh 2009).

Циркадные ритмы

Состав кишечного микробиома ежедневно меняется, что отчасти обусловлено режимом питания. В модели на животных прерывания циркадных ритмов, призванные имитировать смену часовых поясов или работу в ночную смену, изменили нормальный цикл микробиома, что привело к метаболическим нарушениям (Thaiss 2014; Zarrinpar 2016). Новые данные также указывают на то, что взаимосвязь между циркадными ритмами и микробиомом может быть двунаправленной, так что дисбаланс в микробиоме может нарушать циркадные сигналы, что приводит к циклу неупорядоченных суточных биологических ритмов и метаболических пертурбаций (Thaiss 2014; Leone 2015; Wang, Kuang 2017).

4Создание и формирование микробиома

Микробиом младенца играет основополагающую роль в обучении иммунной системы и, следовательно, является важным фактором, определяющим здоровье на протяжении всей жизни (Dominguez-Bello 2016). Его состав определяется множеством факторов, включая способ рождения, генетические факторы человека, географию и культуру, диету и образ жизни, физиологию, болезни, окружающую среду и контакты с другими людьми и домашними животными (van der Meulen 2016; Turnbaugh 2007; Song 2013; Goodrich 2014; Yatsunenko 2012; Tasnim 2017). Кроме того, использование лекарств, таких как антибиотики и ингибиторы протонной помпы, может влиять на микробиом (van der Meulen 2016).

Наш первый контакт с микробиомом происходит при рождении (Falana 2015; Koboziev 2014). Во время родов через естественные родовые пути новорожденный колонизируется микроорганизмами, происходящими из родовых путей и кожи матери (Knight 2017; Krajmalnik-Brown 2012; Koboziev 2014). Было обнаружено, что по сравнению с младенцами, рожденными естественным путем, в микробиомах детей, рожденных посредством кесарева сечения, больше микробов, происходящих из кожи матери, и меньше микробов, происходящих из влагалищного канала (Krajmalnik-Brown 2012; Dominguez-Bello 2016; Rutayisire 2016). Бактерии Bifidobacterium, а также виды Lactobacillus являются особенно важными ранними колонизаторами кишечника младенцев, где они помогают направлять развитие здорового микробиома и созревание иммунной системы (Koboziev 2014; Mueller 2015).

Вагинальный микробиом матери имеет решающее значение для установления исходного микробиома кишечника у новорожденного во время родов, а также помогает формировать созревание иммунной системы и метаболизм (обмен веществ). Передача микробиома от матери к новорожденному происходит в критический период развития мозга новорожденного. Факторы окружающей среды, такие как материнский стресс во время беременности, могут изменить микробиом влагалища и его передачу младенцу, а также могут повлиять на неврологическое развитие ребенка в более позднем возрасте (Jasarevic, Rodgers 2015; Jasarevic, Howerton 2015; Jasarevic 2017).

Грудное вскармливание - еще одна возможность для передачи младенцу видов Lactobacillus и Bifidobacterium, а также других видов бактерий (Soto 2014; Mueller 2015; Urbaniak 2012). Кроме того, определенные пребиотические углеводы, содержащиеся в грудном молоке женщин (называемые олигосахаридами грудного молока), поддерживают рост видов Bifidobacterium, которые важны в кишечнике младенца, где они способствуют здоровому развитию и функционированию поверхности слизистой оболочки кишечника и иммунной системы (Knight 2017; Mueller 2015).

ОЛИГОСАХАРИДЫ ЖЕНСКОГО МОЛОКА

Грудное молоко содержит все питательные вещества, необходимые для здорового роста и развития новорожденного. Оно также содержит ряд биологически активных соединений, которые защищают и поддерживают новорожденного на ранних этапах иммунного, когнитивного и метаболического развития (Martin 2016; Kulinich 2016; Castanys-Munoz 2016). Хорошо известно, что они включают материнские иммунные компоненты, такие как антитела, иммунные клетки и цитокины - химические вещества, необходимые для передачи иммунных сигналов (Witkowska-Zimny 2017; Cabinian 2016). Лишь недавно была оценена важность специализированных олигосахаридов грудного молока в создании здорового микробиома кишечника и сбалансированной иммунной функции (Kulinich 2016; Donovan 2016).

Олигосахариды грудного молока представляют собой сложную смесь небольших неперевариваемых углеводов, которые способствуют росту полезных кишечных бактерий. В частности, виды Bifidobacterium, которых много в кишечнике здоровых младенцев, находящихся на грудном вскармливании, способны ферментировать эти олигосахариды (Donovan 2016; O'Callaghan 2016). Поддерживая присутствие полезных бактерий, олигосахариды грудного молока способствуют установлению нормальной функции кишечного барьера и иммунитета слизистой оболочки. Результаты лабораторных исследований и исследований на животных также предполагают, что олигосахариды грудного молока могут напрямую влиять на созревание и функцию слизистых оболочек и иммунитета, а также оказывать прямое противомикробное действие против вызывающих инфекцию микроорганизмов (Donovan 2016; Ackerman 2017).

Различия в составе микробиома у детей, рожденных естественным путем, и детей, рожденных в результате кесарева сечения, могут объяснить повышенный риск аллергии и астмы, ожирения, диабета 1 типа и нарушений нервного развития, связанных с рождением с помощью кесарева сечения (Ho 2015; Moya-Perez 2017). Предоставлять новорожденным, рожденных с помощью кесарева сечения, вагинальные микробы путем мазка с вагинальными жидкостями матери при рождении - это новая стратегия, которая изучается, чтобы помочь создать здоровый микробиом (Dominguez-Bello 2016). Детское питание в форме смесей также нарушает микробиом здорового младенца и связано с повышенным риском иммунологических и метаболических нарушений в более позднем возрасте. Даже небольшое количество таких смесей-добавок может изменить популяции кишечных микробов (Mueller 2015).

Микробиом кишечника младенца претерпевает изменения в первые два-четыре года жизни, а затем становится более похожим на микробиом, обнаруженный у взрослых (Chan 2013). Этому сдвигу микробного профиля способствуют изменения в диете и организме. Контакт с животными, такими как домашние животные, в эти молодые годы связан с более низким риском аллергии. Микробный состав также может быть изменен из-за употребления антибиотиков, микробов в окружающей среде и болезней (Xu 2015; Francino 2015; Ojima 2016).

После этого периода быстрой диверсификации и расширения микробиом становится относительно стабильным, а изменения более постепенными (Knight 2017; Krajmalnik-Brown 2012). Взаимосвязь между старением и микробиомом все еще изучается, но данные свидетельствуют о том, что микробные профили кишечника пожилых людей отличаются от таковых у молодых людей и коррелируют с показателями слабости, неправильного питания и проблем со здоровьем (Claesson 2011; Claesson 2012).

Хотя здоровый микробиом обычно устойчив к изменениям в окружающей среде и впоследствии возвращается к прежнему состоянию (Lloyd-Price 2016), он, тем не менее, подвержен определенным разрушающим факторам. Например, антибиотики могут оказывать сильнейшее влияние на микробиом, и способность восстанавливать микробный баланс до антибиотика различается у разных людей. Изменения в пищевых привычках также могут вызывать глубокие и быстрые изменения в микробиоме, которые могут быть кратковременными или стойкими. Гормональные циклы, путешествия, болезни и старение - другие примеры факторов, формирующих микробиом (Krajmalnik-Brown 2012; D'Argenio 2015; Xu 2015; Zapata 2015).

5Дисбактериоз

Сдвиг микробного баланса от паттерна, связанного со здоровьем, известен как дисбактериоз (Wischmeyer 2016; Lloyd-Price 2016; Chan 2013). Здоровый микробиом очень разнообразен и устойчив к физиологическому стрессу; с другой стороны, дисбиотический микробиом обычно характеризуется меньшим количеством полезных видов, наличием большего количества видов с потенциалом возникновения болезней и меньшим видовым разнообразием (Chan 2013).

Дисбактериоз кишечника увеличивает риск нарушений иммунной системы как внутри, так и за пределами пищеварительного тракта (Brown 2017). Кроме того, дисбактериоз кишечника был связан с растущим списком хронических заболеваний и состояний, который включает, помимо прочего, следующие (Lloyd-Price 2016; Wang, Du 2017; Morris 2016; Potgieter 2015; Knight 2017; Strati 2017; Marasco 2016; Chen 2018; Distrutti 2016; Flowers 2015):

  • аллергия
  • астма
  • аутизм
  • расстройства аутистического спектра (РАС)
  • аутоиммунные заболевания
  • рак
  • сердечно-сосудистые заболевания
  • глютеновая болезнь (целиакия)
  • синдром хронической усталости (СХУ)
  • депрессия
  • сахарный диабет 1 и 2 типа
  • воспалительное заболевание кишечника
  • синдром раздраженного кишечника
  • рассеянный склероз
  • неврологические заболевания
  • ожирение
  • остеопороз
  • когнитивное и эмоциональное здоровье

Дисбактериоз, повышенная кишечная проницаемость и системное воспаление

Несбалансированная микрофлора кишечника может вызвать хроническое воспаление слизистой оболочки, которое увеличивает проницаемость кишечника и создает состояние, известное как «дырявый кишечник» (van der Meulen 2016; Morris 2016; Nagpal 2017). Проницаемость кишечника контролируется взаимодействием между белками на поверхности соседних клеток, выстилающих стенку кишечника, которые образуют структуры, известные как плотные соединения. Зонулин (zonulin) - это белок, который модулирует эти плотные контакты, и считается, что повышенные уровни зонулина в кровотоке указывают на нарушение кишечного барьера (Ohlsson 2017; Fasano 2012; Moreno-Navarrete 2012).

«Дырявый кишечник» позволяет всасывать мелкие компоненты пищи и бактерии, которые затем могут вызвать системную иммунную активацию и воспаление (van der Meulen 2016). Кишечные микробы, микробные продукты и токсины также могут проникать через дырявый кишечник (Slyepchenko 2017; van der Meulen 2016). Это может привести к иммунной и воспалительной активации в отдаленных тканях и органах и считается важным механизмом в развитии аутоиммунных заболеваний и заболеваний, связанных с системным воспалением (Morris 2016; Slyepchenko 2017; Nagpal 2017; van der Meulen 2016).

Избыточный бактериальный рост тонкой кишки (SIBO, СИБР)

В то время как толстая кишка (часть кишика) имеет сложное и разнообразное микробное сообщество, включающее более 70% кишечных микробов (Ghoshal 2017), здоровая тонкая кишка имеет более ограниченный микробиом (Ponziani 2016). Избыточный бактериальный рост тонкой кишки (SIBO, СИБР) - это паттерн дисбактериоза, который все чаще признается причиной общих пищеварительных симптомов, таких как расстройство желудка, вздутие живота, метеоризм и нарушение функции кишечника, а также как возможный основной признак синдрома раздраженного кишечника (Ghoshal 2017; Thompson 2016; Sachdev 2013). Наиболее часто изучаемым антибиотиком для лечения пациентов с СИБР является рифаксимин (Ксифаксан, Xifaxan), неабсорбируемый антибиотик. Кроме того, предварительные данные свидетельствуют о том, что терапия пробиотиками, отдельно или в комбинации с рифаксимином, может быть полезной. Об обнадеживающих результатах сообщалось об испытаниях пробиотиков, содержащих Saccharomyces boulardii, или рифаксимина вместе с Lactobacillus casei (Ghoshal 2017; Chedid 2014).

6Стратегии диеты и образа жизни для поддержки здорового микробиома

Фундаментальная связь между микробиомом кишечника, диетой и физиологией становится все более очевидной (Amato 2015) и подчеркивает силу диеты как средства поддержания здорового микробиома и, следовательно, здорового тела. Микробиота кишечника находится в постоянном развитии, сильно различается у разных людей и модулирует метаболизм, открывая возможность прогнозировать индивидуальные реакции на определенные продукты в рамках персонализированных медицинских вмешательств (Xu 2015; Vanamala 2015; Davenport 2017).

Западная диета против диеты с высоким содержанием клетчатки

Было показано, что диета с высоким содержанием жиров, особенно такая, включающая большое количество насыщенных жирных кислот, вызывает дисбактериоз кишечника, кишечную проницаемость и воспаление (Araujo 2017; Yang 2017; Silva Figueiredo 2017). С другой стороны, диета с высоким содержанием сложных углеводов и клетчатки поддерживает рост микробных популяций, которые являются эффективными ферментерами углеводов. Эти бактерии производят жирные кислоты с короткой цепью и другие продукты ферментации, которые поддерживают здоровье слизистой оболочки кишечника и положительно влияют на иммунные и метаболические функции (Montemurno 2014; Yang 2017).

В частности, диета западного типа - с высоким содержанием животных белков и жиров и низким содержанием клетчатки - отбирает бактерии, которые эффективно метаболизируют белки, и те, которые лучше всего переносят желчные кислоты, выделяемые в ответ на пищу с высоким содержанием жиров. Микробный метаболизм белков и некоторых желчных кислот создает побочные продукты, которые, по-видимому, способствуют развитию заболеваний, которые, как известно, тесно связаны с западной диетой, включая рак толстой кишки, сердечно-сосудистые заболевания и нарушения обмена веществ (Montemurno 2014; Ridlon 2014). Напротив, в одном исследовании, диета в средиземноморском стиле с 35% калорий из жиров и диета с низким содержанием жиров (<30% общего жира) улучшали микробные сообщества кишечника у субъектов с ожирением и метаболической дисфункцией через два года (Haro 2017).

Пребиотики - это полностью или частично неперевариваемые углеводы, которые способствуют росту популяций полезных бактерий. К ним относятся небольшие углеводы, называемые пектин-олигосахаридами, большие и малые углеводы на основе фруктозы, известные как инулин, и резистентный крахмал (Ferrario 2017; Kelly 2008). Бобовые, фрукты и овощи, орехи и цельнозерновые продукты особенно богаты пребиотическими волокнами (Vinke 2017; Dahl 2015; Slavin 2013; Lamuel-Raventos 2017). Эти продукты давно признаны краеугольными камнями здоровой диеты с высоким содержанием клетчатки, в том числе средиземноморской диеты, которая, как известно, демонстрирует преимущества в отношении ряда метаболических и воспалительных проблем со здоровьем (Fabbiano 2017; Montemurno 2014).).

Омега-3 полиненасыщенные жирные кислоты

Хотя диета с высоким содержанием жиров обычно связана с негативными изменениями в микробиоме кишечника, разные типы жиров могут иметь разные эффекты. Например, полиненасыщенные жирные кислоты омега-3, такие как эйкозапентаеновая кислота (ЕПК, EPA) и докозагексаеновая кислота (ДГК, DHA), по-видимому, улучшают микробный баланс и повышают противовоспалительную иммунную активность в кишечнике и во всем организме (Watson 2017; Costantini 2017; Silva Figueiredo 2017). Это может быть связано с усилением положительного взаимодействия между иммунной системой и кишечными микробами, что приводит к более высокому микробному разнообразию, увеличению производства короткоцепочечных жирных кислот и улучшению барьерной функции кишечника (Candido 2017; Menni 2017; Costantini 2017).

Ферментированные продукты

Ферментация, в основном с помощью молочнокислых бактерий, использовалась для сохранения продуктов питания и улучшения вкуса на протяжении тысячелетий, а ферментированные продукты известны своей пробиотической и полезной для здоровья природой (Hill 2017). Ферментированные продукты являются источником витаминов, минералов, ферментов и ряда биологически активных, полезных для здоровья пептидов, вырабатываемых микробами во время ферментации. Употребление ферментированной пищи связано с пользой для здоровья, такой как улучшение состояний: высокого кровяного давления, высокого уровня холестерина, резистентности к инсулину, некоторых расстройств пищеварения, когнитивной функции и иммунной функции, а также может снизить риски сердечно-сосудистых заболеваний, диабета, остеопороза и некоторых видов рака (Tamang, Shin 2016). Кроме того, живые микробы, присутствующие в ферментированных продуктах, могут действовать как пробиотики при приеме внутрь (Sanlier 2017; Stanton 2005; Tamang, Shin 2016).

Таблица 1. Примеры микроорганизмов, обычно используемых при ферментации пищевых продуктов

Ферментационные микроорганизмы Продукты, в которых они обычно используются
Бактерии:

Виды Acetobacter

A. aceti подвид aceti

A. pasteurianus

A. peroxydans

A. syzygii

A. okinawensis

A. malorum

A. tropicalis

A. pomorum

Используется при брожении фруктов и важен для изготовления многих уксусов. Они производят уксусную кислоту, а также присутствуют в чайном грибе, какао и некоторых винах.

Виды Streptococcus

С. thermophilus

S. faecalis

S. bovis

Широко используется в молочной ферментации для производства таких продуктов, как йогурт и сыры. Они производят молочную кислоту, а также содержатся в некоторых ферментированных растениях.

Виды Lactobacillus

L. delbrueckii

L. plantarum

L. lactis

L. acidophilus

L. brevis

L. fermentum

L. buchneri

L. nagelii

Широко используется в ферментациях молочных, овощных, фруктовых, зерновых и мясных продуктов для производства сыров, кефира, йогурта, какао, вина, закваски, колбас, огурцов, кимчи, оливок, квашеной капусты, чайного гриба и многих других продуктов.

Виды Bifidobaterium

B. longum

B. animalis подвид lactis

B. breve

Добавляется во время молочного брожения для повышения содержания пробиотиков. Они содержатся в некоторых сырах и йогуртах.

Виды Bacillus

B. coagulans

B. subtilis

Используется при ферментации сои для производства натто и соевых паст. B. subtilis хорошо известен для получения фермента наттокиназы.
Дрожжи и плесневые грибы:

Виды Saccharomyces

S. cerevisiae

S. cerevisiae подвид boulardii

S. uvarum

Используется при ферментации зерна для приготовления пива, вина и закваски. Их также можно найти в чайном грибе, а некоторые виды используются в качестве пробиотиков.

Виды Aspergillus

A. oryzae

A. sojae

Используется для ферментации соевых бобов и риса. A. oryzae (он же кодзи) особенно важен при производстве саке, мисо, соевого соуса, рисового уксуса и рисового вина.

Виды Rhizopus

R. oligosporus

R. oryzae

Используется для ферментации соевых бобов и производства темпе и соевого соуса.

Виды Penicillium

P. camemberti

P. roqueforti

Используется для изготовления сыров с белой плесенью (например, камамбер) и сыров с голубой плесенью (например, рокфор).

Виды Zygosaccharomyces

Z. rouxii

Z. bailii

Используется при ферментации соевых бобов для производства мисо и соевого соуса. Также содержится в чайном грибе.

(Battcock 1998; Fernandez 2015; Tamang, Shin 2016; Tamang, Watanabe 2016; Pokusaeva 2011; Coton 2017; Mamlouk 2013; Suezawa 2008; Oliveira 2017; Laich 2002; Guenther 2011; Ropars 2017; Swain 2014; Londono-Hernandez 2017; Kitamoto 2015; Fijan 2014; Kawarai 2007; Kim 2017; Marongiu 2015; Gallone 2016; Krogerus 2017; Kelesidis 2012; Wang 2009; Mayo 2008; Lefeber 2011; Vogel 1993)

Спирт (этанол)

Злоупотребление алкогольными напитками и зависимость от них связаны с дисбактериозом, приводящим к воспалению и повышенной проницаемости слизистой оболочки кишечника. Поглощение бактерий, микробных продуктов и другого кишечного содержимого через поврежденную слизистую оболочку может вызвать воспаление в печени и способствовать развитию заболеваний печени, связанных с алкоголем (Capurso 2017; Dubinkina 2017). Кроме того, некоторые данные свидетельствуют о том, что у некоторых людей с алкогольной зависимостью может быть повышенная проницаемость кишечника и более высокие показатели депрессии, тревоги и беспокойства. Изменения в составе микробиома, обнаруженные в этой группе людей, указывают на возможность того, что микробиом может иметь потенциал для снижения риска рецидива у некоторых людей с алкогольной зависимостью (Capurso 2017; Leclercq 2014).

Стресс и сон

Стресс и нарушение сна тесно связаны и коррелируют с нарушениями здорового баланса кишечных микробов (Weljie 2015; Galland 2014; Poroyko 2016; Benedict 2016). Резкое снижение численности и функции кишечных микробов было отмечено после внезапных острых стрессовых событий, таких как сердечный приступ, травма или ожоговая травма (Alverdy 2017). Считается, что состояние высокого психологического стресса в организме вызывает изменения в микробиоме кишечника, что может привести к изменениям в регуляции некоторых нейромедиаторов (Househam 2017). Кроме того, из-за двунаправленной коммуникации по оси «кишечник-мозг» дисбиоз, в свою очередь, может вызвать дисфункциональную активацию стрессовой реакции (Alverdy 2017; Bermon 2015; Rogers 2016; Clapp 2017).

Снижение стресса может быть одним из способов улучшить здоровье микробиома. Было показано, что медитация снижает активацию путей стресса и подавляет хроническое воспаление, что может поддерживать полезные популяции кишечных микробов (Househam 2017). Более того, достаточное количество сна и соблюдение нормальных ритмов сна/бодрствования могут иметь важное значение для поддержания здорового микробиома (Thaiss 2014; Parekh 2018; Anderson 2017).

Более подробная информация доступна в протоколах «Управление стрессом» и «Бессонница».

ОСЬ «КИШЕЧНИК-МОЗГ»

Пищеварительный тракт имеет свою собственную нервную ткань, называемую энтеральной (кишечной) нервной системой, которая воспринимает среду кишечника и реагирует на нее, а также регулирует деятельность кишечника. Хотя кишечная нервная система может функционировать независимо, она также тесно взаимодействует с центральной нервной системой организма через сеть, называемую осью «кишечник-мозг». Двунаправленный характер этой коммуникации объясняет не только то, как стресс может влиять на пищеварение, но также то, как события в пищеварительном тракте могут влиять на мозг (Quigley 2018; Zhou 2015; Mayer 2014; Carabotti 2015).

Микробиом кишечника становится ключевым игроком, влияющим на коммуникацию по оси «кишечник-мозг». Кишечные микробы производят множество нейроактивных химических веществ, помогают контролировать барьерную функцию кишечника и модулировать иммунную и воспалительную передачу сигналов, все из которых влияют на передачу сигналов по нервным путям (Carabotti 2015). В настоящее время считается, что нарушения в кишечном микробном сообществе связаны с неврологическими расстройствами, такими как болезнь Паркинсона, болезнь Альцгеймера, расстройства аутистического спектра, а также с депрессией, тревогой и хронической болью. Результаты исследований на животных показывают, что, скорее всего, через ось «кишечник-мозг», микробиом кишечника может даже формировать аппетит, пищевое поведение и вкусовые предпочтения (Mayer 2015; Mayer 2014; Hu 2016). В ходе замечательного эксперимента исследователи трансплантировали фекальные микробы от пациентов с болезнью Паркинсона генетически восприимчивым мышам. Это вызвало проявления заболевания, такие как нарушение движения, у подвергшихся воздействию мышей, в то время как у тех же генетически предрасположенных мышей, которым трансплантировали фекальные микробы здоровых людей, эти симптомы не развились (Sampson 2016).

Физические упражнения (спорт)

Хорошо известно, что регулярные физические упражнения средней интенсивности уменьшают стресс, уменьшают хроническое воспаление и улучшают обмен веществ (Lalanza 2015; Beavers 2010; Nicklas 2009; McGarrah 2016; Sato 2003; Colombo 2013). Результаты нескольких исследований свидетельствуют о том, что физически активные и хорошо подготовленные люди имеют большее микробное разнообразие кишечника и больше полезных микробов, чем люди, ведущие малоподвижный образ жизни (Clarke 2014; Estaki 2016; Bressa 2017; Barton 2017; Petersen 2017). Наблюдаемые преимущества упражнений для иммунного ответа, метаболизма и общего состояния здоровья могут быть частично опосредованы их благотворным влиянием на микробиом кишечника (Bermon 2015; Monda 2017). Кроме того, некоторые исследователи предположили, что микробные побочные продукты могут играть роль в сохранении структуры и функции скелетных мышц, особенно у пожилых людей, что стало известно как ось «кишечник-мышцы» (Ticinesi 2017; Grosicki 2017).

Более подробно в публикации: БЕГ ИЗМЕНИТ ТЕЛО И МОЗГ, ПОМОЖЕТ ПРЕОДОЛЕТЬ СТРЕСС, БЕСПОКОЙСТВО И ДЕПРЕССИЮ.

7Новые и перспективные методы лечения для здоровья микробиома

Трансплантация фекальной микробиоты

Одной из наиболее интересных областей исследования микробиома была трансплантация фекальной микробиоты, которая включает в себя перенос фекальной суспензии, содержащей кишечные микробы, от здорового человека к нездоровому в терапевтических целях. Процедура обычно выполняется через клизму или зонд, вводимый в желудок или двенадцатиперстную кишку. Однако в исследовании 2017 года на пациентах с рецидивирующими инфекциями Clostridium difficile пероральная капсула сублимированных (лиофилизированных) фекальных микробов была сравнительно эффективна для доставки с помощью колоноскопии для предотвращения рецидивов (Gallo 2016; Kao 2017).

Трансплантация фекальной микробиоты стала важным методом лечения рецидивирующих трудноизлечимых инфекций C. difficile, эффективность которых приближается к 90% (Liubakka 2016; Cammarota 2017; Matijasic 2016). Клинические исследования, хотя и находящиеся на ранних этапах своего развития, предполагают, что оно также может иметь значение при лечении ряда воспалительных и метаболических состояний, связанных с дисбактериозом, таких как воспалительное заболевание кишечника (Matijasic 2016), синдром раздраженного кишечника (Distrutti 2016), ожирение, диабета 2 типа (Marotz 2016) и расстройства аутистического спектра (РАС) (Kang, Adams 2017). Кроме того, трансплантация фекальной микробиоты пока имеет отличный профиль безопасности (Cammarota 2017).

Фаговая терапия

Бактериофаги или фаги - это вирусы, которые заражают определенные бактерии, но не заражают клетки человека (Doss 2017). Фаги, которые считаются самыми многочисленными организмами на Земле, являются неотъемлемой частью микробиома человека, где, как считается, они управляют бактериальными сообществами, ограничивая целевые виды (Mirzaei 2017; Keen 2015). Фаготерапия изучается как альтернатива терапии антибиотиками при определенных состояниях и, возможно, для устранения вредных бактерий из микробных сообществ организма (McCarville 2016; Lin, Koskella 2017).

Обильное и разнообразное сообщество фагов населяет ротовую полость, и определенные фаги или их ферменты оказались многообещающими для лечения заболеваний пародонта и предотвращения образования зубного налета (Szafranski 2017). Фаги, которые нацелены на вызывающие инфекцию желудочно-кишечные бактерии, такие как Vibrio cholerae (причина холеры) (Yen 2017), Helicobacter pylori (Wan 2011), C. difficile (Nale 2016), Shigella dysenteriae (Mai 2015) и некоторые вредные штаммы Escherichia coli (Dalmasso 2016) были идентифицированы и обладают терапевтическим потенциалом. Появились более ранние сообщения об успешном использовании фаговой терапии для профилактики и лечения различных других типов бактериальных инфекций, включая инфекции кожи, мочевыводящих путей и глаз, которые служат основой для будущих исследований (Chanishvili 2012).

8Знакомство с пробиотиками

Пробиотики - это живые микроорганизмы, которые укрепляют здоровье при приеме внутрь в достаточном количестве (Shi 2016). Большинство пробиотических добавок содержат бактерии и обычно включают виды из родов Lactobacillus и Bifidobacterium (Ciorba 2012; Islam 2016; Saini 2010). Несколько видов грибковых Saccharomyces также используются в пробиотических добавках (Fakruddin 2017). Добавки с пробиотиками обычно измеряются в колониеобразующих единицах (КОЕ, CFU), которые представляют количество жизнеспособных клеток (Weese 2011; Wallace 2017).

Микроорганизмы классифицируются по иерархии семейств, родов, видов и штаммов. Род указывается по имени организма; вид - это его второе название, за которым в некоторых случаях следует обозначение штамма (Khalighi 2016). Например, Lactobacillus acidophilus La-14 представляет собой хорошо описанный пробиотик (Stahl 2013) рода Lactobacillus, вида acidophilus и штамма La-14 (Salvetti 2012).

Растущее количество исследований пробиотиков устанавливает безопасность и терапевтическую эффективность многих отдельных штаммов (Sanders 2010; Shi 2016).

ПРОБИОТИКИ: СООБРАЖЕНИЯ БЕЗОПАСНОСТИ

Пробиотики имеют хорошие показатели безопасности при использовании человеком в различных условиях. Тем не менее, некоторые потенциальные области, вызывающие беспокойство, включают очень молодых или очень пожилых людей с ослабленным иммунитетом из-за рака, людей, которые принимают сильнодействующие иммунодепрессанты после трансплантации органов, или тех, кто находится в критическом состоянии в отделении интенсивной терапии (Happel 2018). Исследование показало, что наиболее неблагоприятные эффекты наблюдались у ослабленных пожилых и неизлечимо больных людей, в то время как у ВИЧ-инфицированных польза от пробиотиков перевешивает их риски (Happel 2018; Stadlbauer 2015).

В одном сообщении отмечалось, что фунгемия (наличие грибков или дрожжей в крови), вызванная Saccharomyces boulardii, развилась у двух новорожденных, из которых только один получил лечение пробиотиком, а второй заразился инфекцией от первого ребенка, который находился в соседней кроватке (Perapoch 2000). Сообщалось также о фунгемии, вызванной S. boulardii, у 8-месячного младенца с острым миелоидным лейкозом, который получал пробиотики для предотвращения диареи, связанной с химиотерапией (Cesaro 2000).

Сообщалось о фунгемии, вызванной S. boulardii, у пожилого пациента с колитом Clostridium difficile, получавшего ванкомицин (Cherifi 2004), и у нескольких пациентов в отделениях интенсивной терапии, леченных антибиотиками, с центральными венозными катетерами (Lherm 2002). Бактериемия, вызванная L. acidophilus, наблюдалась у пациента со СПИДом и болезнью Ходжкина (лимфогранулематоз) (Ledoux 2006), а бактериемия, вызванная L. rhamnosus GG, наблюдалась у 17-летнего мальчика с язвенным колитом, который лечился системными кортикостероидами и инфликсимабом (Remicade) (Vahabnezhad 2013).

Другие группы населения, потенциально подверженные риску осложнений, связанных с пробиотиками, по данным Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA), включают людей с искусственными сердечными клапанами, а также людей с активным истечением кишечника или активным кишечным заболеванием, таким как колит, из-за возможности того, что пробиотики могут проникнуть через стенка кишечника (Doron 2015).

Систематический обзор и метаанализ показали, что пробиотики во время беременности не повышают риск преждевременных родов и не приводят к каким-либо неблагоприятным исходам для матери или ребенка (Jarde 2018).

Перед использованием пробиотиков людям из описанных здесь групп риска рекомендуется проконсультироваться с квалифицированным врачом.

9Пробиотики для здоровья пищеварительной системы

Доказано, что пробиотическая терапия безопасна и эффективна для профилактики и лечения широкого спектра заболеваний пищеварительной системы и, вероятно, станет все более важной по мере роста проблем, связанных с устойчивостью к антибиотикам (Pamer 2016; Wilkins 2017). Пробиотики, вероятно, сохраняют здоровье пищеварительной системы благодаря своему антимикробному, противовоспалительному и иммуномодулирующему действию на слизистую оболочку кишечника (Surendran Nair 2017; Wilkins 2017). В рандомизированном двойном слепом плацебо-контролируемом клиническом исследовании на добровольцах пожилого возраста комбинация пробиотиков, содержащая Bifidobacterium bifidum BB-02, B. lactis BL-01 и олигофруктозу, привела к положительным изменениям размера и разнообразия бактериальных популяций кишечника, которые часто поражаются в процессе старения (Bartosch 2005).

Диарея

Систематический обзор и метаанализ клинических испытаний показали, что Lactobacillus reuteri DSM 17938 в дозах 100–400 миллионов КОЕ в день в течение пяти-семи дней уменьшал продолжительность диареи у детей (Urbanska 2016). В другом систематическом обзоре и метаанализе L. rhamnosus GG в дозах от 400 до 120 миллиардов КОЕ в день эффективно предотвращал антибиотик-ассоциированную диарею у детей и взрослых (Szajewska 2015b).

Диарея путешественников - это распространенная форма острой инфекционной диареи, от которой, по оценкам, страдают 25% путешественников в первые две недели пребывания за границей (Giddings 2016). Хотя испытания показали неоднозначные результаты, добавки, содержащие пробиотические дрожжи Saccharomyces boulardii (5-10 миллиардов КОЕ в день), продемонстрировали многообещающие эффекты в предотвращении диареи путешественников (Giddings 2016; Ouwehand 2017). Другие полезные пробиотики включают L. rhamnosus GG, L. acidophilus и B. bifidum (Giddings 2016).

Антибиотик-ассоциированная диарея

Несколько пробиотических добавок оказались многообещающими в предотвращении диареи, связанной с антибиотиками - антибиотик-ассоциированная диарея. В частности, было обнаружено, что S. boulardii снижает риск диареи, связанной с антибиотиками на 53% в систематическом обзоре и метаанализе 21 рандомизированного контролируемого исследования с участием 4780 участников, лечившихся антибиотиками (Szajewska 2015b). В другом систематическом обзоре и метаанализе 12 рандомизированных контролируемых клинических испытаний с участием в общей сложности 1499 участников, получавших антибиотики, L. rhamnosus GG снизил риск диареи, связанной с лечением, на 51% (Szajewska 2015a). Самый последний систематический обзор и метаанализ, включающий 17 рандомизированных контролируемых исследований и в общей сложности 3631 не госпитализированных пациентов, лечившихся антибиотиками, показали, что у тех, кто получал какие-либо пробиотики, на 51% меньше вероятность развития диареи, связанной с антибиотиками. В этом анализе добавки, содержащие L. rhamnosus GG и S. boulardii в суточных дозах выше 5 миллиардов КОЕ, оказались более защитными (Blaabjerg 2017).

Clostridium difficile индуцированная диарея

C. difficile - это спорообразующая бактерия, которая может вызывать воспаление толстой кишки (колит) и диарею у уязвимых людей (Heinlen 2010). Это наиболее частая причина возникновения диареи в больницах (Ofosu 2016). Основные факторы риска инфекции C. difficile включают госпитализацию или помещение в специализированное учреждение, использование антибиотиков, желудочно-кишечные операции или процедуры, серьезные заболевания, нарушение иммунной функции и пожилой возраст. Ингибиторы протонной помпы, класс лекарств, используемых для лечения гастроэзофагеального рефлюкса, гастрита и язвенной болезни, также повышают риск (CDC 2012; Khanna 2012). Заболеваемость и тяжесть инфекций, вызываемых C. difficile, растет, при этом количество госпитализаций по поводу этой инфекции в США удвоилось с 2000 по 2010 год (Lessa 2015; Lessa 2012). Антибиотики являются стандартным лечением диареи, вызванной C. difficile, и рецидивы являются обычным явлением (Al-Jashaami 2016).

Доказано, что добавки с пробиотиками безопасны и эффективны для предотвращения диареи, связанной с C. difficile. Одна общественная больница, пострадавшая от крупной вспышки инфекций, вызванных C. difficile, сообщила о снижении числа случаев заболевания на 73% и уменьшении рецидивов на 39% после введения политики введения всем пациентам пробиотических добавок в течение 12 часов после начала любого режима антибиотиков. Пробиотик обеспечивал 50 миллиардов КОЕ в день комбинации L. acidophilus CL1285, L. casei LBC80R и L. rhamnosus CLR2. Продолжая включать пробиотическую терапию в свою стратегию профилактики, больница смогла поддерживать очень низкую частоту возникновения и рецидивов инфекций C. difficile в течение 10 лет, предшествующих публикации их отчета (Maziade 2015).

В рандомизированном контролируемом исследовании 2017 года пробиотик из четырех штаммов, содержащий L. acidophilus NCFM, L. paracasei Lpc-37, B. lactis BI-04 и B. lactis Bi-07, сравнивался с плацебо в качестве дополнения к стандартной медикаментозной терапии у 33 участников с их первым диагнозом инфекции C. difficile от легкой до умеренной. Было обнаружено, что через 28 дней продолжительность диареи была снижена у тех, кто получал комбинацию пробиотиков (Barker 2017).

Систематический обзор и метаанализ 2017 года, в который были включены данные 19 исследований, в которых в общей сложности участвовал 6261 госпитализированных взрослых, получавший антибиотики, показали, что начало терапии пробиотиками в течение первых двух дней лечения антибиотиками привело к снижению риска инфицирования C. difficile на 68%, и эффективность снижались с каждым днем задержки начала пробиотической терапии (Shen 2017). Другие метаанализы сделали аналогичные выводы: добавки с пробиотиками снижали риск диареи, индуцированной C. difficile, связанной с антибиотиками, примерно на 60% у взрослых и детей, как в больничных условиях, так и за их пределами, с высокой степенью безопасности. Госпитализированные пациенты были более успешными. Хотя в большинстве испытаний использовались добавки с одним или несколькими видами Lactobacillus, видами Lactobacillus плюс Bifidobacterium или видами Saccharomyces, профилактический эффект, по-видимому, не зависел от вида (Goldenberg 2017; Lau, Chamberlain 2016).

Комплексы пробиотиков со смесью бактериофагов (фагами):

Life Extension, Добавка для ЖКТ FLORASSIST с фаговой технологией, 30 вегетарианских капсул в жидкой форме

Life Extension, Добавка для ЖКТ FLORASSIST с фаговой технологией, 30 вегетарианских капсул в жидкой форме

Arthur Andrew Medical, Floraphage, 90 капсул

Arthur Andrew Medical, Floraphage, 90 капсул

Sunwarrior, Пробиотики, 30 веганских капсул

Sunwarrior, Пробиотики, 30 веганских капсул

Запор

Микробиом кишечника является одним из важных факторов, регулирующих движение пищи через пищеварительную систему (моторика или перистальтика кишечника). Полезные кишечные микробы помогают поддерживать нормальную перистальтику кишечника, подавляя воспаление слизистой оболочки, взаимодействуя с нервной системой, модулируя метаболизм желчных кислот и изменяя среду кишечника за счет производства короткоцепочечных жирных кислот и других соединений (Dimidi 2017; Zhao 2016).

Многочисленные клинические испытания продемонстрировали преимущества пробиотических добавок в стимуляции перистальтики кишечника и облегчении запоров. В обзорной статье сообщалось о пяти рандомизированных контролируемых испытаниях с использованием различных штаммов B. lactis, двух испытаниях с использованием L. casei Shirota и по одному испытанию с использованием L. reuteri DSM 17938 и L. paracasei IMPC 2.1 для лечения хронического запора. Результаты всех испытаний были положительными, и все, кроме одного, показали статистически значимые улучшения. Наблюдались различные преимущества, включая улучшение консистенции и частоты стула, сокращение времени транзита и уменьшение тяжести запора (Zhao 2016). Систематический обзор и метаанализ 14 исследований с участием 1182 взрослых, страдающих запорами, выявили значительные преимущества B. lactis, но не L. casei Shirota (Dimidi 2014). Комбинация L. plantarum LP01 и B. breve BR03, а также единственный пробиотик B. animalis подвида lactis BS01 продемонстрировали положительный эффект в облегчении запора (Del Piano 2010). Другие исследования показывают, что добавки штаммов B. lactis сокращают время транзита, особенно у пожилых пациентов с запорами (Martinez-Martinez 2017; Miller 2016; Miller 2013).

В двух интересных плацебо-контролируемых испытаниях изучалось влияние пробиотика B. longum BB536 в дозе 25 или 50 миллиардов КОЕ в день в течение 16 недель на функцию кишечника у пожилых пациентов, получающих питание через трубку в желудок или тонкий кишечник. Когда рассматривались только пациенты с низкой частотой испражнения, было отмечено значительное увеличение частоты испражнения, а когда учитывались только пациенты с высокой частотой испражнения, отмечалось значительное снижение частоты испражнения. Эти данные свидетельствуют о модулирующем эффекте этого штамма B. longum на функцию кишечника (Kondo 2013).

Для получения дополнительной информации о запорах смотри протокол здоровья при запорах.

Синдром раздраженного кишечника (СРК)

Синдром раздраженного кишечника (СРК) - это хроническое расстройство пищеварения, характеризующееся болью в животе, вздутием живота и нарушением функции кишечника, и часто ассоциируется с депрессией, тревогой и высоким уровнем стресса. Хотя нет четкой причины, появляется все больше доказательств того, что может быть задействован дисбактериоз, способствующий симптомам как пищеварения, так и настроения в результате изменений вдоль оси «кишечник-мозг», которые включают слабое воспаление, повышенную проницаемость кишечника и иммунологические нарушения (Bennet 2015; Quigley 2018; Sinagra 2017; Staudacher 2016; Canavan 2014; Ohman 2010). Несмотря на неоднозначные результаты, большая часть доказательств указывает на то, что пробиотики уменьшают симптомы и улучшают качество жизни у больных СРК (Didari 2015; Tiequn 2015; Zhang 2016; Sinagra 2017).

В метаанализе 2016 года были объединены результаты 21 рандомизированного контролируемого исследования, посвященного влиянию пробиотической терапии на пациентов с СРК. В некоторых из включенных испытаний использовались комбинации пробиотиков с различными видами Lactobacillus и Bifidobacterium, а в других использовались отдельные виды. Пробиотики эффективно улучшали общие симптомы и качество жизни у пациентов с СРК, но не всегда помогали в облегчении конкретных симптомов. Дозировка, которая варьировалась от 60 миллионов до 450 миллиардов КОЕ в день, по-видимому, не влияла на эффективность, а пробиотики одного вида имели преимущество перед пробиотиками разных видов в улучшении общих симптомов и качестве жизни (Zhang 2016). Систематический обзор и метаанализ 2014 года, в который вошли 43 рандомизированных контролируемых исследования, также выявили общее положительное влияние пробиотиков на облегчение симптомов СРК (Ford 2014).

В другом метаанализе было обнаружено, что пробиотики, содержащие только виды Lactobacillus, почти в 18 раз более полезны, чем плацебо, у взрослых с СРК (Tiequn 2015). Два исследования, посвященные влиянию S. cerevisiae CNCM I-3856 на симптомы СРК, обнаружили уменьшение боли в животе у пациентов, получавших пробиотик, по сравнению с плацебо (Cayzeele-Decherf 2017). Несколько плацебо-контролируемых исследований отметили улучшение симптомов СРК у пациентов, получавших пробиотики, содержащие штаммы Bacillus coagulans (Majeed 2016; Hun 2009; Dolin 2009).

Дополнительные сведения о СРК смотри в протоколе о состоянии здоровья при синдроме раздраженного кишечника.

Воспалительное заболевание кишечника (ВЗК)

Воспалительное заболевание кишечника (ВЗК) включает два основных аутоиммунных состояния, язвенный колит и болезнь Крона. Было обнаружено, что микробные сообщества кишечника у пациентов с ВЗК колеблются больше, чем у здоровых людей, и дисбактериоз вместе с сопутствующей иммунной дисфункцией и воспалением были вовлечены как в начало этого состояния, так и в его обострения (Halfvarson 2017; Fakhoury 2014; DeGruttola 2016; Lane 2017).

Результаты нескольких метаанализов рандомизированных контролируемых исследований показывают, что добавки с пробиотиками в целом могут безопасно помочь пациентам с язвенным колитом достичь и поддерживать ремиссию (Derwa 2017; Ganji-Arjenaki 2018; Fujiya 2014). Хотя значительная польза от использования пробиотиков в целом не была продемонстрирована у пациентов с болезнью Крона, было обнаружено, что S. boulardii при добавлении к стандартному лечению болезни Крона уменьшает некоторые симптомы (Plein 1993) и клинические рецидивы (Guslandi 2000) в двух небольших рандомизированных контролируемых исследованиях.

Два плацебо-контролируемых исследования оценивали эффект коммерческого комбинированного пробиотика под названием VSL#3 у пациентов с активным язвенным колитом легкой и средней степени тяжести, получающих стандартные методы лечения. Этот продукт содержит четыре вида Lactobacillus (L. acidophilus, L. plantarum, L. casei и L. bulgaricus), три вида Bifidobacterium (B. longum, B. breve и B. infantis) и один вид Streptococcus (S. thermophilus) (Matijasic 2016). В обоих исследованиях у пациентов, получавших VSL#3, наблюдались более высокие показатели клинического ответа и ремиссии по сравнению с плацебо (Sood 2009; Tursi 2010). Аналогичное, но неконтролируемое исследование также отметило улучшение ответа и частоту ремиссии при добавлении VSL#3 к стандартным методам лечения (Bibiloni 2005). В другом клиническом исследовании пациентов с язвенным колитом средней и тяжелой степени тяжести комбинированный пробиотик, содержащий L. acidophilus, L. salivarius и B. bifidus, добавленный к месалазину, противовоспалительному препарату, используемому для лечения ВЗК, показал лучшее улучшение, чем пациенты с приемом только месалазина (Palumbo 2016).

Несколько пробиотических добавок одного вида также были полезны при лечении язвенного колита. В плацебо-контролируемом клиническом исследовании B. longum BB536 в дозе 200–300 миллиардов КОЕ в день увеличивал скорость клинической ремиссии и улучшал внешний вид ткани толстой кишки (Tamaki 2016), а Escherichia coli Nissle 1917 был так же эффективен, как месалазин, для предотвращения рецидивов в нескольких исследованиях пациентов, получающих стандартную медикаментозную терапию (Kruis 1997; Rembacken 1999; Kruis 2004); однако это может быть не полезно для индукции ремиссии в активных случаях (Petersen 2014). Клиническое исследование, в котором участвовали пациенты с язвенным колитом, показало, что пробиотик L. rhamnosus GG был так же эффективен, как месалазин или их комбинация, в предотвращении рецидивов (Zocco 2006). Кроме того, результаты пилотного исследования предполагают, что S. boulardii при добавлении к месалазину может способствовать достижению клинической ремиссии у пациентов с язвенным колитом, у которых наблюдаются обострения от легкой до умеренной степени (Guslandi 2003).

Для получения дополнительной информации о болезни Крона и язвенном колите, пожалуйста, ознакомьтесь с протоколом здоровья при воспалительном заболевании кишечника.

Моно пробиотик - Bifidobacterium longum BB536:

Life Extension, Bifido GI Balance, 60 Vegetarian Capsules

Life Extension, Bifido GI Balance, 60 Vegetarian Capsules

Natural Factors, Travel Biotic, BB536, 10 Billion Active Cells, 60 Vegetarian Capsules

Natural Factors, Travel Biotic, BB536, 10 Billion Active Cells, 60 Vegetarian Capsules

Quality of Life Labs, ProbioPure, пробиотки 30 овощных капсул

Quality of Life Labs, ProbioPure, пробиотки 30 овощных капсул

Гастроэзофагеальная рефлюксная болезнь (ГЭРБ)

Пищевод является домом для богатой микробной экосистемы, и у пациентов с гастроэзофагеальной рефлюксной болезнью (ГЭРБ) был выявлен дисбактериоз пищевода. Сейчас считается, что этот дисбактериоз может играть роль в прогрессировании ГЭРБ до предраковых и злокачественных состояний пищевода (Yang 2014; Di Pilato 2016). Хотя пока неясно, как можно бороться с дисбиозом пищевода, ясно, что стандартное лечение ГЭРБ - обычно препараты ингибиторы протонной помпы (ИПП), снижающие секрецию желудочной кислоты - может в долгосрочной перспективе привести к множеству проблем со здоровьем, включая дисбактериоз кишечника и избыточный бактериальный рост тонкой кишки (SIBO) (Del Piano 2012; Lombardo 2010; Fujimori 2015).

В нескольких исследованиях изучалось влияние использования пробиотических добавок вместе с ИПП. В рандомизированном клиническом исследовании детей с ГЭРБ лечили ИПП плюс пробиотик, содержащий 100 миллионов КОЕ L. reuteri DSM 17938 в день, или плацебо. Через 12 недель SIBO был обнаружен у 6,2% тех, кто получал пробиотик, и у 56,2% тех, кто получал плацебо (Belei 2018). Аналогичное исследование с участием взрослых с ГЭРБ показало, что пробиотик, содержащий L. paracasei F19, предотвращает вздутие живота, метеоризм и боли в животе, связанные с лечением (Compare 2015).

Для получения дополнительной информации о ГЭРБ смотри протокол состояния здоровья при гастроэзофагеальной рефлюксной болезни.

Гастрит и язвенная болезнь

Наиболее частыми причинами гастрита и язвенной болезни (ЯБЖ) являются инфекция бактерией Helicobacter pylori и прием нестероидных противовоспалительных препаратов. Другие причины и факторы включают некоторые другие лекарства, курение, чрезмерное употребление алкоголя, пожилой возраст и стресс (Mayo Clinic 2017a; Mayo Clinic 2017b; Fashner 2015; Nordenstedt 2013).

Более половины людей во всем мире являются носителями H. pylori желудка (Kusters 2006). У большинства из них симптомы отсутствуют, но у других H. pylori может вызывать изменения слизистой оболочки желудка и верхних отделов кишечника, повышая риск язвы желудка или двенадцатиперстной кишки и рака желудка (Kafshdooz 2017; Ruggiero 2014). При назначении лечения, стандартной медикаментозной терапией является использование так называемой тройной или четверной терапии - ингибитора протонной помпы с солью висмута или без нее и двух-трех антибиотиков. Развитие устойчивости H. pylori ко многим широко используемым антибиотикам снизило эффективность этого подхода в последние годы (Goderska 2018; Mascellino 2017).

Пробиотики могут быть полезны при гастрите и ЯБЖ благодаря их способности уменьшать воспаление слизистых оболочек, уменьшать связывание H. pylori и способствовать сильному иммунному ответу против бактерий. Кроме того, некоторые штаммы пробиотиков могут продуцировать антибактериальные молекулы, которые ингибируют H. pylori (Goderska 2018; Homan 2015). Ряд клинических испытаний с использованием различных пробиотиков и их комбинаций без какого-либо другого лечения показал, что хотя они, по-видимому, не уничтожают H. pylori, они могут снизить количество организмов H. pylori (Homan 2015).

В метаанализе 2016 года, объединившем данные 30 рандомизированных контролируемых исследований, была протестирована пробиотическая терапия в качестве дополнения к стандартной терапии инфекции H. pylori. Авторы пришли к выводу, что пробиотики из видов Lactobacillus, Bifidobacterium или Saccharomyces улучшают уровень эрадикации и снижают побочные эффекты, связанные с антибиотиками (Lau, Ward 2016). Другие метаанализы также показали, что ряд пробиотиков с одним и несколькими штаммами может улучшить показатели эрадикации и переносимость лечения (Lu, Yu 2016; McFarland 2016; Zhang 2015).

Пробиотики также могут быть полезны при лечении гастрита и пациентов с ЯБЖ без инфекции H. pylori. Исследования на животных показывают, что терапия пробиотиками может уменьшить вызывающие язву эффекты стресса (Konturek 2009) и нестероидных противовоспалительных препаратов, таких как аспирин и ибупрофен (Senol 2011; Girard 2010). Клинические испытания необходимы для подтверждения этих преимуществ на людях и определения штаммов и доз, которые будут наиболее эффективными.

Для получения дополнительной информации о H. pylori, гастрите и ЯБЖ, пожалуйста, ознакомьтесь с протоколом лечения пептических язв.

Диспепсия и вздутие живота

Функциональная диспепсия - это состояние, характеризующееся ощущением полноты и болей в желудке, особенно после еды, причину которого невозможно определить. Тестирование желудочной жидкости показало, что у пациентов с диспепсией микроорганизмы желудка явно отличаются от здоровых людей (Igarashi 2017).

В рандомизированном контролируемом исследовании пациенты с функциональной диспепсией, не инфицированные H. pylori, получали либо йогурт, обогащенный L. gasseri OLL2716, либо не обогащенный йогурт-плацебо. Основные симптомы диспепсии были устранены у 35,3% тех, кто получал йогурт, обогащенный L. gasseri, и у 17,3% тех, кто получал йогурт-плацебо (Ohtsu 2017). Другие исследователи отметили, что добавка L. gasseri OLL2716 обратила вспять дисбиоз желудочной жидкости, и это коррелировало с выздоровлением от диспепсии (Igarashi 2017; Nakae 2016).

Вздутие живота - частый симптом расстройства пищеварения, но он также может возникать постоянно без известной причины. В рандомизированных контролируемых испытаниях было показано, что штаммы пробиотиков, такие как B. bifidum MIMBb75 и L. plantarum 299v, уменьшают вздутие живота, связанные с СРК (Iovino 2014). Сообщалось, что у людей с вздутием живота без ясной причины Lactobacillus GG более эффективен, чем плацебо, для уменьшения тяжести вздутия живота (Di Stefano 2004). Кроме того, Bacillus coagulans GBI-30, 6086 уменьшал желудочно-кишечные симптомы у взрослых с симптомами, связанными с газами, но без известных нарушений пищеварения (Kalman 2009).

Комплексы пробиотиков, содержащие Lactobacillus reuteri:

Nature's Way, Primadophilus, Reuteri Superior Probiotic, полиштаммный порошок с scFOS, 141,75 г

Nature's Way, Primadophilus, Reuteri Superior Probiotic, полиштаммный порошок с scFOS, 141,75 г

BioGaia, Пищевая добавка с пробиотиками, лимонный вкус, 30 жевательных таблеток

BioGaia, Пищевая добавка с пробиотиками, лимонный вкус, 30 жевательных таблеток

Life Extension, Gastro-Ease, 60 вегетарианских капсул

Life Extension, Gastro-Ease, 60 вегетарианских капсул

10Пробиотики для здоровья сердечно-сосудистой системы

Хотя сердечно-сосудистая система, по-видимому, не имеет собственного микробного сообщества, в последнее время большое внимание было привлечено к роли микробиома кишечника в здоровье сердечно-сосудистой системы и заболеваниях. Исследования связывают дисбактериоз кишечника с атеросклерозом и гипертонией (Lau 2017), а некоторые данные указывают на роль микробиоты кишечника в сердечной недостаточности (Nagatomo 2015). Клинические испытания показали, что добавки с пробиотиками и пребиотиками могут поддерживать контроль веса и улучшать другие метаболические и воспалительные маркеры, связанные со здоровьем сердечно-сосудистой системы (He 2017; Upadrasta 2016).

Пробиотики и артериальное давление

Результаты многочисленных лабораторных исследований и исследований на животных показывают, что пробиотические бактерии и побочные продукты их ферментации могут оказывать благотворное влияние на людей с высоким кровяным давлением. Возможные механизмы этого эффекта включают снижение окислительного стресса и системного воспаления, улучшение метаболизма холестерина и всасывания кальция с пищей, а также ингибирование действия сосудосуживающего фермента, называемого ангиотензин-превращающим ферментом (АПФ) (Daliri 2017; Upadrasta 2016). В пятилетнем наблюдательном исследовании потребление молочных продуктов, ферментированных штаммом Lactobacillus casei Shirota, три или более раз в неделю было связано со снижением риска развития гипертонии (Aoyagi 2017). В трехнедельном пилотном исследовании с участием 40 человек с ожирением и гипертонией артериальное давление и индексы массы тела были снижены у тех, кто получал сыр, ферментированный пробиотиком L. plantarum TENSIA, по сравнению с сыром без пробиотических бактерий (Sharafedtinov 2013).

Пробиотики и метаболизм холестерина

Мета-анализ 13 испытаний с общим количеством участников 485 показал, что терапия пробиотиками в целом может эффективно снизить уровень общего холестерина и холестерина ЛПНП. В этом анализе было обнаружено, что штаммы L. acidophilus обладают сильным липидоснижающим действием (Shimizu 2015). В клинических испытаниях также было показано, что другие бактерии Lactobacillus, такие как L. reuteri и L. plantarum, снижают общий холестерин и уровень холестерина ЛПНП (Lau 2017; Shimizu 2015).

В рандомизированном исследовании с участием 127 субъектов с высоким уровнем холестерина прием капсул с 2,9 миллиарда КОЕ пробиотика L. reuteri NCIMB 30242 два раза в день привел к снижению общего уровня холестерина на 9,1%, снижению уровня холестерина ЛПНП на 11,6% и улучшение соотношения ЛПНП к холестерину ЛПВП на 13,4% по сравнению с плацебо через девять недель. У участников, получавших L. reuteri NCIMB 30242, также были более низкие уровни воспалительных маркеров C-реактивного белка и фибриногена в конце испытания (Jones, Martoni, Prakash 2012). Кроме того, второй анализ результатов этого исследования показал, что уровень витамина D повышался у тех, кто получал пробиотическую терапию (Jones 2013). Употребление йогурта, содержащего L. reuteri NCIMB 30242, в течение шести недель также снижает повышенный уровень общего холестерина и холестерина ЛПНП в плацебо-контролируемом исследовании с участием 114 участников (Jones, Martoni, Parent 2012).

В другом контролируемом исследовании с участием 49 взрослых с нормальным или умеренно повышенным уровнем холестерина добавка, содержащая 2 миллиарда КОЕ L. plantarum ECGC 13110402, принимаемая дважды в день в течение 12 недель, снизила уровни холестерина ЛПНП. Подгруппа участников старше 60 лет также улучшила уровни триглицеридов и холестерина ЛПВП после использования пробиотика. Снижение артериального давления также было отмечено у тех, кто получал пробиотик (Costabile 2017).

Комплексы пробиотиков для здоровья сердечно-сосудистой системы с Lactobacillus reuteri, Lactobacillus plantarum и моно Lactobacillus reuteri:

Enzymedica, Pro Bio, пробиотик с гарантированной эффективностью, 30 капсул

Enzymedica, Pro Bio, пробиотик с гарантированной эффективностью, 30 капсул

Now Foods, Gr8-Dophilus, 120 растительных капсул

Now Foods, Gr8-Dophilus, 120 растительных капсул

Life Extension, FLORASSIST Heart Health, 60 Vegetarian Capsules

Life Extension, FLORASSIST Heart Health, 60 Vegetarian Capsules

11Пробиотики для здоровья полости рта

Микробиом полости рта, очень важный компонент микробиома человека, содержит от сотен до тысяч различных видов, которые присутствуют в разных местах, например, на зубах, деснах, щеках, небе, губах и миндалинах (Arweiler 2016; Dewhirst 2010). Дисбактериоз полости рта играет роль в развитии кариеса, гингивита и заболеваний пародонта. Все больше данных указывает на то, что восстановление здоровых популяций полезных бактерий полости рта с помощью пробиотической терапии может играть важную роль в предотвращении и лечении этих состояний (Gupta 2017; Rosier 2017; Haukioja 2010; Allaker 2017).

Пародонтоз и пародонтит

Дисбиоз микробиома полости рта связан с углублением пародонтальных карманов (пародонтоз) и пародонтитом - хроническим воспалительным заболеванием, которое может повредить мягкие ткани и кости и, в конечном итоге, привести к потере зубов (Gupta 2017; Meuric 2017; Jiao 2014; Deng 2018). Пародонтит также увеличивает риск некоторых системных заболеваний, включая сосудистые заболевания, диабет и некоторые формы рака (Deng 2018). Несколько исследований показали, что пробиотики могут уменьшить кровоточивость десен и глубину пародонтального кармана у пациентов с заболеваниями пародонта, а также уменьшить потерю альвеолярной кости на животных моделях (Allaker 2017; Maekawa 2014; Gatej 2018; Haukioja 2010; Krasse 2006). Преимущества пробиотиков могут быть связаны с их способностью конкурировать с вредными микробами за питательные вещества, производить молекулы, подавляющие вредные бактерии, и вызывать благоприятные изменения в иммунных ответах (Allaker 2017).

В рандомизированном контролируемом исследовании с участием пациентов с заболеваниями пародонта ежедневный прием капсулы, содержащей 10 мг убитого нагреванием Lactobacillus plantarum L-137, повысил эффективность удаления зубного камня и выравнивания корня при уменьшении глубины пародонтального кармана (Iwasaki 2016). Хотя бактерии в этой добавке больше не были жизнеспособными, другие исследования показали, что убитая нагреванием форма L. plantarum L-137 обладает иммуномодулирующим действием (Fujiki 2012), что, возможно, является причиной ее положительного воздействия на здоровье пародонта.

Еще одна многообещающая добавка для лечения пародонтоза - это пробиотический штамм L. reuteri (Martin-Cabezas 2016; Kumar 2017). Несколько клинических испытаний показали, что леденцы, изготовленные с использованием этого вида пробиотиков, при добавлении к регулярному удалению зубного камня и выравниванию поверхности корня зуба уменьшают образование налета, кровоточивость десен и глубину кармана, а также увеличивают прикрепление десен к корню зуба у пациентов с хроническим заболеванием пародонта. (Ince 2015; Teughels 2013; Vivekananda 2010; Szkaradkiewicz 2014; Tekce 2015). Кроме того, рандомизированное контролируемое исследование 2018 года показало, что леденцы L. reuteri показали преимущества у пациентов с мукозитом и периимплантитом, двумя воспалительными состояниями, которые могут затрагивать ткани, окружающие дентальный имплантат (Galofre 2018).

Было обнаружено, что пробиотическая бактерия L. salivarius WB21 снижает уровень вредных бактерий в зубном налете (Mayanagi 2009), улучшает состояние десен (Iwamoto 2010) и снижает риск заболеваний пародонта (Shimauchi 2008). В других клинических испытаниях пробиотическое ополаскиватель для полости рта, содержащий L. salivarius NK02, улучшал эффективность удаления зубного налета и выравнивания корней при пародонтозе (Sajedinejad 2017), а пастилка, содержащая L. rhamnosus GG и Bifidobacterium animalis подвид lactis BB-12, уменьшала образование налета и улучшала здоровья десен у здоровых людей (Toiviainen 2015).

Полости зуба

Streptococcus salivarius M18 - это пробиотический организм, который продемонстрировал антибактериальные эффекты против S. mutans, бактерии полости рта, участвующей в образовании полостей зуба. Также было показано, что он производит ферменты, которые уменьшают накопление зубного налета и его подкисление (Burton 2013). В рандомизированном контролируемом исследовании факторы риска развития кариеса улучшились через 90 дней у детей, получавших ежедневные пастилки, содержащие не менее 1 миллиарда КОЕ S. salivarius M18 (Di Pierro, Zanvit 2015). В другом плацебо-контролируемом исследовании трехмесячное лечение пероральным S. salivarius M18 в суточной дозе 3,6 миллиарда КОЕ привело к большему улучшению показателей налета по сравнению с плацебо у детей с зубными полостями. Кроме того, бактериальный анализ показал, что присутствие S. mutans было снижено у детей с наиболее высокими уровнями колонизации пробиотическим штаммом (Burton 2013).

В лабораторных исследованиях было обнаружено, что различные виды Lactobacillus ингибируют S. mutans (Lin, Chen 2017; Wasfi 2018). Подобные преимущества были обнаружены в клинических исследованиях. В рандомизированном контролируемом исследовании было обнаружено, что полоскания рта с пробиотиками, содержащие либо Bacillus coagulans, либо смесь L. acidophilus, B. longum, B. lactis и B. bifidum, уменьшают образование зубного налета и улучшают состояние десен лучше, чем плацебо у детей (Yousuf 2017). В другом рандомизированном контролируемом исследовании ежедневное использование жевательной таблетки с тремя видами пробиотиков Streptococcus привело к более низкому риску кариеса по сравнению с плацебо у здоровых детей двух-трех лет (Hedayati-Hajikand 2015).

Большое количество исследований показывает, что ксилит, неперевариваемый сахарный спирт, оказывает пребиотическое действие не только на кишечник, но и на ротовую полость (Makinen 2010; Nayak 2014). Было обнаружено, что ксилит в качестве добавки и ингредиента зубных паст, ополаскивателей для рта, жевательных резинок и конфет снижает уровень вызывающих кариес бактерий в слюне и зубном налете, уменьшает образование зубного налета и препятствует разложению зубов (Nayak 2014). Систематический обзор и метаанализ 2017 года показали, что ксилит эффективен для профилактики кариеса (Janakiram 2017). Другой обзор показал, что зубные пасты с ксилитом и фтором могут защищать от кариеса более эффективно, чем зубные пасты, содержащие только фтор, у детей (Riley 2015).

Для получения дополнительной информации о заболеваниях пародонта и зубных полостях смотри протокол здоровья полости рта.

Формулы пробиотиков для здоровья полости рта:

Hyperbiotics, PRO-Dental, натуральный мятный вкус, 45 запатентованных жевательных таблеток LiveBac

Hyperbiotics, PRO-Dental, натуральный мятный вкус, 45 запатентованных жевательных таблеток LiveBac

Life Extension, FLORASSIST гигиена полости рта, 30 леденцов

Life Extension, FLORASSIST гигиена полости рта, 30 леденцов

Now Foods, OralBiotic, 60 пастилок

Now Foods, OralBiotic, 60 пастилок

12Пробиотики и здоровье кожи

Кожа является домом для большого и разнообразного микробиома, который влияет на здоровье кожи и оказывает влияние на здоровье в целом. Микробиом кожи варьируется у одного и того же человека в зависимости от участка тела, а также у разных людей. Он формируется как внешними, так и внутренними факторами (Prescott 2017; Barnard 2017; SanMiguel 2015; Grice 2011). Тем не менее, даже при воздействии постоянно меняющихся условий микробиом кожи, по-видимому, остается в значительной степени стабильным у людей с течением времени (Oh 2016). Дисбиоз кожи был отмечен при множестве кожных заболеваний, включая атопический дерматит (экзема), угри, себорея, псориаз, розацеа и перхоть (Barnard 2017; Abdallah 2017; Paulino 2017).

Пробиотические бактерии могут оказывать местное и системное действие, которое поддерживает барьерную функцию кожи, регулирует иммунную активность и контролирует микробные популяции (Al-Ghazzewi 2014; Wong 2013; Lew 2013). Добавки с пробиотиками могут быть полезны при некоторых инфекционных и воспалительных заболеваниях кожи, а также при повреждениях кожи, вызванных солнцем и травмами (Notay 2017; Roudsari 2015; Kober 2015). В большинстве клинических испытаний использовались оральные пробиотики, но новые исследования показывают, что местное применение пробиотических бактерий также может быть полезным для ускорения заживления кожи (Zoccali 2016; Lopes 2017).

Угревая сыпь (акне)

Пероральные пробиотики, такие как Lactobacillus acidophilus и Bifidobacterium bifidum, показали положительный эффект у людей с акне в ранних клинических исследованиях (Bowe 2014). В контролируемом исследовании с участием 20 субъектов с акне добавление L. rhamnosus SP1 в дозе 3 миллиарда КОЕ в день привело к большему улучшению состояния кожи, чем плацебо, через 12 недель (Fabbrocini 2016). Другие данные свидетельствуют о том, что комбинация пероральных пробиотиков и антибиотиков может быть более эффективной, чем одна из них для взрослых с акне легкой или средней степени тяжести (Jung 2013). Дополнительные клинические исследования показали, что 5% раствор L. plantarum для местного применения, но не 1% раствор, уменьшал размер очагов угревой сыпи и покраснение (Muizzuddin 2012).

Пробиотический штамм Enterococcus faecalis SL-5, применяемый в виде лосьона, продемонстрировал антибактериальную активность против бактерий, вызывающих угри, и улучшил внешний вид высыпаний от прыщей (Kang 2009). Другие пробиотические бактерии, в том числе L. reuteri, B. longum, B. adolescentis и Streptococcus salivarius, продемонстрировали аналогичные антибактериальные эффекты и потенциально могут использоваться в качестве местных средств для лечения акне (Bowe 2014).

Атопический дерматит

Факторы, которые формируют микробиом кишечника в раннем возрасте, могут влиять на риск аллергических состояний у детей, таких как атопический дерматит, кожное заболевание, обычно называемое экземой (Zheng 2016; Marrs 2016). Атопический дерматит связан с нарушением барьерной функции кожи, воспалением и потерей разнообразия микробиома кожи (Wollina 2017).

Добавки с пробиотиками могут помочь предотвратить атопический дерматит, особенно если они используются во время беременности и в первые годы жизни (Zukiewicz-Sobczak 2014; Kim 2013; Elazab 2013; Pelucchi 2012). В систематическом обзоре и метаанализе по профилактике экземы у младенцев и детей в большинстве изученных исследований использовались добавки с видами Lactobacillus, Bifidobacterium или с обоими видами, и оба штамма показали защитный эффект (Mansfield 2014).

Согласно недавнему метаанализу, пробиотики могут быть полезны для лечения атопического дерматита у взрослых и детей старше одного года (Kim 2014; Huang 2017). Пробиотики только с видами Bifidobacterium, по-видимому, менее эффективны, чем те, которые содержат смешанные виды и виды Lactobacillus (Kim 2014; Chang 2016). Три исследования показали, что L. acidophilus L-92 улучшил атопический дерматит в трех исследованиях на людях (Torii 2011; Yamamoto 2016; Inoue 2014).

Для получения дополнительной информации о прыщах, атопическом дерматите и других состояниях кожи смотри протокол состояния здоровья при кожных заболеваниях.

13Пробиотики для здоровья влагалища и мочевыводящих путей

Бактерии Lactobacillus долгое время считались ключевым компонентом здоровой экосистемы влагалища (биоценоз влагалища). Поддерживая кислый pH (около 3,5-4,5), конкурируя за источники энергии и участки связывания на стенке влагалища и производя противомикробные химические вещества, виды Lactobacillus, в частности, помогают контролировать популяции потенциально вредных микроорганизмов, которые также могут присутствовать в микробиоме влагалища (Huang, Fettweis 2014; Vaneechoutte 2017). Одной из наиболее распространенных вагинальных инфекций во всем мире является бактериальный вагиноз, который часто называют не инфекцией, а дисбактериозом, поскольку механизмы, лежащие в основе этого состояния, недостаточно изучены, и было предложено несколько гипотез (Muzny 2016). Дисбактериоз влагалища характеризуется наличием микробного сообщества влагалища, которое содержит меньше лактобацилл и чрезмерный рост других, потенциально вредных видов, и связан с проблемами со здоровьем, включая повышенный риск заражения и передачи инфекций, передаваемых половым путем, и преждевременных родов (van de Wijgert 2017; Mitra 2016). Кроме того, дисбактериоз влагалища был связан с повышенным риском инфекций мочевыводящих путей (Kirjavainen 2009).

Пилотные испытания на здоровых женщинах показывают, что как пероральное, так и вагинальное введение комбинаций пробиотиков Lactobacillus с такими видами, как L. casei rhamnosus, L. rhamnosus, L. paracasei, L. fermentum, L. plantarum и L. gasseri, может приводить к длительному сроку колонизации влагалища бактериями Lactobacillus (Verdenelli 2016; Bohbot 2012; Strus 2012). Систематический обзор 20 исследований 2016 года показывает, что пробиотики, содержащие по крайней мере один вид Lactobacillus, могут быть важной частью профилактики и лечения бактериального вагиноза и инфекций мочевыводящих путей у женщин (Hanson 2016). Более поздние результаты даже предполагают, что длительный прием добавок Lactobacillus может помочь избавиться от инфекции вирусом папилломы человека (ВПЧ), некоторые штаммы которого вызывают раковые изменения в шейке матки (Palma 2018).

Бактериальный вагиноз

Бактериальный вагиноз обычно лечат противомикробными препаратами, но частота рецидивов высока - 30–40%. Было показано, что добавление пероральной или вагинальной пробиотической терапии на основе Lactobacillus к стандартному уходу предотвращает рецидивы и повышает эффективность лечения (Parma 2014; Kumar 2011; Homayouni 2014; Cribby 2008). В клиническом испытании 2018 года с участием 34 женщин с бактериальным вагинозом сравнивалась пробиотическая терапия с плацебо в качестве последующего лечения после антибиотиков. Женщины в группе пробиотиков ели обогащенный йогурт, содержащий L. crispatus LbV 88, L. gasseri LbV 150N, L. jensenii LbV 116 и L. rhamnosus LbV 96, каждый по 1,25 миллиарда КОЕ в день, а женщины в группе плацебо употребляли химически подкисленное молоко. Через четыре недели ни у одной из 17 женщин в группе пробиотиков и шести из 17 женщин в группе плацебо не было бактериального вагиноза (Laue 2018). Мета-анализ 12 рандомизированных клинических испытаний показал, что включение пробиотиков в лечение бактериального вагиноза может повысить эффективность лечения на 53% и более (Huang, Song 2014).

Пробиотики также эффективны в качестве самостоятельного лечения бактериального вагиноза у некоторых женщин. У 544 здоровых женщин с диагнозом бактериальный вагиноз лечение пероральным пробиотиком, обеспечивающим 2 миллиарда КОЕ L. rhamnosus GR-1 и L. reuteri RC-14 в день, было более эффективным, чем плацебо, для достижения и поддержания здорового микробного баланса влагалища. В этом исследовании почти 62% женщин, получавших пробиотики, и почти 27% женщин, получавших плацебо, больше не имели бактериального вагиноза после шести недель лечения, а нормальный баланс вагинальной микрофлоры все еще присутствовал примерно у 51% женщин в группе, принимавших пробиотики, и около 21% из группы плацебо через шесть недель после окончания лечения (Vujic 2013).

В другом клиническом исследовании 34 женщины с бактериальным вагинозом в пременопаузе использовали вагинальные таблетки с медленным высвобождением пробиотиков с L. fermentum LF15 и L. plantarum LP01 или плацебо каждую день перед сном в течение семи ночей, затем один раз каждые три ночи в течение трех недель и, наконец, один раз еженедельно еще четыре недели. По истечении восьми недель у 20 из 24 женщин в группе пробиотиков (83%) больше не было бактериального вагиноза, и ни у одной из женщин в группе плацебо не было значительного улучшения (Vicariotto 2014).

Формулы пробиотиков для женского здоровья с Lactobacillus gasseri:

Garden of Life, Разработанные доктором пробиотики, витаминный комплекс Once Daily Women's, 30 вегетарианский капсул

Garden of Life, Разработанные доктором пробиотики, витаминный комплекс Once Daily Women's, 30 вегетарианский капсул

Renew Life, Пробиотики Ultimate Flora для женского вагинального здоровья, 50 млрд живых культур, 30 вегетарианских капсул

Renew Life, Пробиотики Ultimate Flora для женского вагинального здоровья, 50 млрд живых культур, 30 вегетарианских капсул

HealthyBiom, Пробиотики для поддержания женского здоровья, 25 млрд КОЕ, 90 растительных капсул

HealthyBiom, Пробиотики для поддержания женского здоровья, 25 млрд КОЕ, 90 растительных капсул

Вульвовагинальный кандидоз

В лабораторных исследованиях было показано, что пробиотические бактерии Lactobacillus обладают противогрибковым действием и регулируют иммунный ответ против видов дрожжей Candida (Chew 2015; Deidda 2016; Wagner 2012). Некоторые штаммы пробиотиков, такие как L. rhamnosus GR-1 и L. reuteri RC-14, могут изменять метаболическую активность дрожжевых клеток и даже влиять на функцию некоторых генов, которые способствуют устойчивости к противогрибковым препаратам (Kohler 2012).

Результаты нескольких исследований показывают, что оральные и вагинальные пробиотики Lactobacillus повышают эффективность стандартного противогрибкового лечения у женщин с вульвовагинальным кандидозом. В рандомизированном плацебо-контролируемом исследовании 55 женщин, которые проходили стандартное лечение от кандидозного вульвовагинита, получали дополнительное лечение пероральными пробиотиками, обеспечивая 2 миллиарда КОЕ L. rhamnosus GR-1 и L. reuteri RC-14, или плацебо, ежедневно в течение четырех недель. В конце исследования в группе пробиотиков было меньше симптомов и меньше вагинальных дрожжей по сравнению с группой плацебо (Martinez 2009).

В рандомизированном открытом исследовании 207 субъектов с вагинальным кандидозом лечились только стандартными противогрибковыми препаратами, а 209 лечились лекарствами плюс 10 аппликаций вагинального пробиотика, содержащего L. acidophilus, L. rhamnosus, Streptococcus thermophilus и L. delbrueckii подвида bulgaricus, начиная с пяого дня после завершения лечения. В конце исследования около 69% получавших пробиотики не имели клинических жалоб по сравнению с около 20% тех, кто получал только противогрибковые препараты (Kovachev 2015). Также было показано, что вагинальные пробиотики, содержащие отдельные штаммы L. plantarum, снижают частоту рецидивов после традиционных противогрибковых препаратов (Palacios 2016; De Seta 2014).

Для получения дополнительной информации о кандидозном вульвовагините смотри протокол о состоянии здоровья при грибковых инфекциях.

Инфекция мочевыводящих путей

Lactobacillus может подавлять колонизацию вызывающими инфекцию микробами около мочевого отверстия и усиливать иммунную функцию, снижая риск инфекции мочевыводящих путей. Пробиотическая терапия с использованием видов Lactobacillus может быть эффективной для предотвращения инфекции мочевыводящих путей (Foxman 2013).

В ходе годичного клинического исследования 252 женщины в постменопаузе с рецидивирующими инфекциями мочевыводящих путей получали профилактическое лечение либо комбинированным пероральным пробиотиком, обеспечивающим 2 миллиарда КОЕ L. rhamnosus GR-1 и L. reuteri RC-14 в день, либо триметопримом/сульфаметоксазол, комбинация двух противомикробных препаратов. Среднее количество симптоматических инфекций мочевыводящих путей в год снизилось в обеих группах, но уровень устойчивости к противомикробным препаратам существенно увеличился в группе, получавшей противомикробные препараты. Авторы отметили, что даже несмотря на то, что комбинация пробиотиков не уменьшала среднее количество инфекций мочевыводящих путей в большей степени, чем лечение противомикробными препаратами, существенно более низкая устойчивость к противомикробным препаратам в группе пробиотиков могла бы сделать их приемлемой альтернативой для предотвращения инфекций мочевыводящих путей (Beerepoot 2012).

L. crispatus - один из нескольких полезных видов Lactobacillus, обнаруженных в здоровых микробиомах влагалища (Lepargneur 2016; Abdelmaksoud 2016). В пилотном исследовании девять женщин с рецидивирующими инфекциями мочевыводящих путей лечились вагинальными суппозиториями (свечи), содержащими 100 миллионов КОЕ L. crispatus GAI 98322, каждые две ночи в течение года. Среднее количество инфекций значительно снизилось с 5-ти в год, предшествовавших испытанию, до 1,3 за год (Uehara 2006). В рандомизированном контролируемом исследовании 100 женщин с рецидивирующими инфекциями мочевыводящих путей лечили либо вагинальными суппозиториями, содержащими 100 миллионов КОЕ L. crispatus CTV-05, либо плацебо каждую ночь в течение пяти ночей, а затем еженедельно в течение 10 недель. По сравнению с плацебо терапия пробиотиками снизила частоту эпизодов инфекции мочевыводящих путей во время исследования примерно наполовину (Stapleton 2011).

Для получения дополнительной информации об инфекциях мочевыводящих путей смотри протокол здоровья по инфекциям мочевыводящих путей.

14Пробиотики для респираторного и иммунного здоровья

Микробные обитатели горла, носа и носовых пазух составляют микробиом верхних дыхательных путей и, как и микробиом кишечника, помогают ограничивать присутствие вредных микробов и регулировать иммунную функцию (Schenck 2016; de Steenhuijsen Piters 2015; Gao 2014). Здоровые легкие, которые когда-то считались стерильными, теперь являются одними из последних участков тела, которые, как известно, являются домом для уникального микробиома (Roux 2017; Pichon 2017; Cui 2014). Некоторое сходство с микробными сообществами полости рта и носа позволяет предположить, что определенные бактерии могут попадать в дыхательные пути из этих мест, но легкие также содержат определенные резидентные микробы (Hauptmann 2016). Предполагается, что микробиом легких играет важную роль в здоровье и болезнях, а также в регулировании иммунитета. Понимание этих связей все еще находится на очень ранней стадии (Wang, Li 2017; Cui 2014).

Было обнаружено, что пероральные пробиотики снижают частоту и продолжительность инфекций верхних дыхательных путей, а также количество антибиотиков, необходимых для лечения (Hao 2015; Quick 2015). Кроме того, новые исследования показывают, что местные пробиотики в виде назальных спреев могут быть эффективными для восстановления здорового микробного баланса в верхних дыхательных путях (Santagati 2015). Пилотные испытания показывают, что назальные спреи со Streptococcus salivarius 24SMB или S. sanguinis могут быть полезны для детей с хроническим или рецидивирующим средним отитом (Skovbjerg 2009; Marchisio 2015).

Астма и аллергический ринит

Сообщалось о дисбактериозе легких у людей с астмой, где наблюдались меньшее микробное разнообразие и изменения в составе микробных сообществ (Chung 2017). Дисбактериоз кишечника также играет важную роль в предрасположенности к аллергии и астме. Такие факторы, как кесарево сечение, искусственное вскармливание и воздействие антибиотиков в раннем возрасте, которые негативно влияют на микробиом кишечника младенца, связаны с более высоким риском астмы и аллергии (West 2016; Moya-Perez 2017; Kolokotroni 2012).

В двух небольших исследованиях было показано, что специальный высушенный дрожжевой ферментат из S. cerevisiae (Epicor) снижает сезонную аллергию. В одном исследовании 25 здоровых участников принимали Epicor или плацебо ежедневно в течение пяти недель в течение сезона аллергии. В группе плацебо наблюдалась повышенная частота сезонных аллергий, а в группе Epicor - нет. Интересно, что симптомы аллергии вернулись в течение 1-2 недель после того, как участники прекратили принимать Epicor (Jensen 2008). В более крупном исследовании сравнивали суточные дозы 500 мг Epicor или плацебо у 96 здоровых субъектов с сезонной аллергией в анамнезе. Субъекты в группе Epicor имели менее выраженную заложенность носа и насморк и использовали меньше лекарств от аллергии, чем те, кто принимал плацебо (Moyad 2009).

Частично аллергия опосредуется иммунным сигнальным белком, который называется иммуноглобулин Е (IgE). Если иммунная система вырабатывает слишком много IgE в ответ на раздражитель, может возникнуть аллергическая реакция. В доклиническом скрининговом исследовании было показано, что штамм Lactobacillus acidophilus под названием L-92 снижает выработку IgE у мышей, зараженных проаллергенным веществом (Ishida 2003). На основе этих интригующих результатов было проведено три клинических испытания L. acidophilus L-92. Сначала L-92 вводили субъектам в течение двух сезонов аллергии. Дозировки составляли 50 миллиардов КОЕ дважды в день в течение шести недель в течение первого сезона и 20 миллиардов КОЕ один раз в неделю во время второго сезона. В первом сезоне участвовало 23 человека, а во втором - 20. В течение первого сезона L-92 уменьшил расстройство глаз, связанное с аллергией, на 31%. Во время второго наблюдалось статистически значимое снижение общего стресса, связанного с аллергией, у субъектов, получавших L-92 (Ishida, Nakamura, Kanzato, Sawada, Yamamoto 2005). Во втором исследовании 49 участников с аллергическим ринитом принимали 30 миллиардов КОЕ L-92 или плацебо ежедневно в течение восьми недель. Отек слизистой оболочки носа уменьшился на 24% на восьмой неделе в группе L-92. Кроме того, оценка назальных симптомов снизилась на 19% в группе L-92 по сравнению с плацебо на восьмой неделе (Ishida, Nakamura, Kanzato, Sawada, Hirata 2005). В третьем и немного более крупном исследовании 80 субъектов, которые имели аллергию на пыльцу кедра и подвергались воздействию пыльцы кедра на исходном уровне, принимали L-92 или плацебо в течение 8 недель перед повторным воздействием пыльцы кедра. L-92 приводил к значительному уменьшению симптомов назальной и глазной аллергии по сравнению с плацебо при повторном воздействии (Caplpis Co. Ltd. 2012).

У взрослых с аллергией пробиотический штамм Bifidobacterium longum BB536 значительно уменьшал некоторые симптомы, вызванные воздействием пыльцы, чем плацебо (Xiao 2007). В рандомизированном контролируемом исследовании детей с аллергией на пыльцу смесь B. longum BB536, B. infantis M-63 и B. breve M-16V значительно улучшила симптомы и качество жизни (Miraglia Del Giudice 2017). Кроме того, пробиотики повысили эффективность аллерген-специфической иммунотерапии у пациентов с астмой и аллергией (Liu 2016; Jerzynska 2016). У взрослых с сезонным аллергическим ринитом пероральный прием B. lactis NCC2818 улучшил некоторые иммунные параметры и симптомы аллергии (Singh 2013).

Для получения дополнительной информации об аллергии и астме смотри протокол здоровья при аллергии.

Формулы пробиотиков для респираторного здоровья, содержащие Streptococcus salivarius, EpiCor®, и для иммунитета:

Life Extension, FLORASSIST, здоровье горла, 30 пастилок

Life Extension, FLORASSIST, здоровье горла, 30 пастилок

Life Extension, FLORASSIST Nasal, 30 Vegetarian Capsules

Life Extension, FLORASSIST Nasal, 30 Vegetarian Capsules

Life Extension, FLORASSIST Winter Immune Support, 30 Stick Packs

Life Extension, FLORASSIST Winter Immune Support, 30 Stick Packs

Инфекции верхних дыхательных путей

Доклинические исследования показывают, что некоторые виды пробиотиков Lactobacillus могут стимулировать противомикробный иммунный ответ в дыхательных путях (Marranzino 2012), а клинические испытания показали их положительный эффект в предотвращении инфекций верхних дыхательных путей. Рандомизированные контролируемые испытания с участием здоровых людей молодого, среднего и пожилого возраста показали, что кисломолочные продукты, обогащенные различными пробиотическими штаммами L. casei, могут снизить заболеваемость и сократить продолжительность инфекций верхних дыхательных путей (Shida 2017; Fujita 2013; Jespersen 2015). Также было обнаружено, что молочные или йогуртовые продукты, содержащие пробиотические штаммы L. paracasei, снижают риск инфицирования верхних дыхательных путей у пожилых людей и детей (Corsello 2017; Pu 2017). Результаты небольшого испытания на детях предполагают, что пробиотик L. brevis KB290, содержащийся в традиционном японском маринаде, может защитить от гриппа (Waki 2014).

В рандомизированном контролируемом исследовании 78 здоровых взрослых, сообщающих о высоком уровне психологического стресса, получали пероральную таблетку, содержащую 10 мг нежизнеспособной формы штамма бактерий L. plantarum L-137, убитой нагреванием, или плацебо ежедневно в течение 12 недель. Количество, тяжесть и продолжительность инфекций верхних дыхательных путей уменьшились у тех, кто получал L. plantarum L-137. Было показано, что убитая нагреванием форма этого организма обладает иммуномодулирующим действием, что, возможно, способствовало преимуществам, наблюдаемым в этом исследовании (Hirose 2013).

Рандомизированное контролируемое исследование с участием 198 студентов колледжа показало, что ежедневный прием пробиотиков с содержанием не менее 1 миллиарда КОЕ в каждом из L. rhamnosus GG и B. animalis подвида lactis BB-12 в течение 12 недель снижает среднюю продолжительность и среднюю степень тяжести инфекций верхних дыхательных путей и количество пропущенных в результате учебных дней (Smith 2013). Один только B. animalis подвид lactis BB-12 также может быть эффективным у взрослых при использовании в капсулах или при добавлении в йогурт до ферментации (Meng 2016).

Рандомизированное контролируемое исследование с участием 465 здоровых взрослых показало, что единственный пробиотический штамм B. animalis подвида lactis Bl-04 в дозе 2 миллиарда КОЕ в день предотвращал инфекции верхних дыхательных путей лучше, чем плацебо или комбинация пробиотиков (West 2014). Другое рандомизированное контролируемое исследование, в котором студентов старших курсов лечили пробиотиками или плацебо, показало, что добавка B. bifidum R0071 сокращала количество дней болезни из-за инфекции верхних дыхательных путей (Langkamp-Henken 2015). У пожилых людей употребление 100 миллиардов КОЕ в день B. longum BB536 снизило заболеваемость гриппом по сравнению с плацебо в течение 14-недельного периода (Namba 2010).

S. salivarius - распространенная бактерия в здоровом рту (Burton 2006). Пробиотический штамм S. salivarius K12 способен колонизировать ротовую полость и горло и может снизить частоту эпизодов ангины, вызванной бактерией (Di Pierro 2014). Добавки с этим пробиотическим штаммом оказались многообещающими в предотвращении тонзиллита и фарингита (инфекции горла) и в снижении частоты возникновения и/или тяжести среднего отита (инфекции среднего уха) (Zupancic 2017). Испытания у детей показывают, что S. salivarius K12 может предотвращать стрептококковые инфекции горла, скарлатину и средний отит (Di Pierro, Colombo, Giuliani, 2016), даже у детей с недавними или повторяющимися эпизодами стрептококкового фарингита (стрептококковая ангина) (Di Pierro, Colombo, Zanvit 2016; Di Pierro 2014; Di Pierro 2012) или средний отит (Di Pierro, Di Pasquale 2015).

В рандомизированном плацебо-контролируемом исследовании с участием 721 участника, которое проводилось в течение трех зимних холодных сезонов, различные смеси пробиотиков и пребиотиков, содержащие такие организмы, как L. plantarum LP02, L. rhamnosus LR04 и LR05 и B. lactis BS01, привели к снижению частоты инфекции верхних дыхательных путей (Pregliasco 2008).

В 16-недельном рандомизированном двойном слепом плацебо-контролируемом клиническом исследовании с участием 100 человек в возрасте от 60 до 74 лет ежедневное введение 2 миллиардов спор B. subtilis CU1 в течение 10 дней, повторенное 4 раза с 18-дневными перерывами, снизило частоту респираторных инфекций в подгруппе из 44 участников по сравнению с плацебо. Потребление пробиотиков также привело к положительным изменениям иммунного ответа (Lefevre 2015). B. subtilis CU1 был безопасен и хорошо переносился пожилыми людьми, и его введение не сопровождалось какими-либо побочными эффектами (Lefevre 2017).

Дополнительные сведения об инфекциях верхних дыхательных путей и гриппе смотри в протоколах лечения простуды и гриппа.

15Пробиотики и настроение

Рандомизированное контролируемое клиническое исследование, в котором изучали участников с низким уровнем свободного кортизола в моче, показало, что Lactobacillus helveticus R0052 и Bifidobacterium longum R0175 улучшают психическое благополучие и могут иметь профилактическую роль в отношении психологических изменений, связанных со стрессом (Messaoudi, Violle 2011).

В двойном слепом плацебо-контролируемом клиническом исследовании на добровольцах пробиотический состав, содержащий L. helveticus R0052 и B. longum R0175, принимаемый в течение 30 дней, привел к положительным психологическим эффектам, включая улучшение шкал, измеряющих депрессию, злость-враждебность, и решение проблем. Эта же комбинация пробиотиков также снижает тревожное поведение у крыс (Messaoudi, Lalonde 2011). В другой модели на крысах комбинация пробиотиков снижала показатели депрессии после сердечного приступа и восстанавливала проницаемость кишечника (Arseneault-Breard 2012), а также снижала гибель клеток в различных областях мозга (Girard 2009). У мышей он предотвращал изменения в мозге, возникающие в результате хронического психологического стресса (Ait-Belgnaoui 2014).

Комплексы пробиотиков для психического здоровья с Lactobacillus helveticus и Bifidobacterium longum:

Life Extension, FLORASSIST Mood Improve, 30 Capsules

Life Extension, FLORASSIST Mood Improve, 30 Capsules

InnovixLabs, Пробиотик для улучшения настроения, помощь в борьбе со стрессом, 60 капсул

InnovixLabs, Пробиотик для улучшения настроения, помощь в борьбе со стрессом, 60 капсул

Jarrow Formulas, Jarro-Dophilus Mood, 10 Billion, 30 EnteroGuard Veggie Capss

Jarrow Formulas, Jarro-Dophilus Mood, 10 Billion, 30 EnteroGuard Veggie Caps

ИСТОЧНИКИ И ЛИТЕРАТУРА
  1. Maintaining a Healthy Microbiome https://www.lifeextension.com/protocols/gastrointestinal/maintaining-a-healthy-microbiome
  2. Abdallah F, Mijouin L, Pichon C. Skin Immune Landscape: Inside and Outside the Organism. Mediators Inflamm. 2017;2017:5095293.
  3. Abdelmaksoud AA, Koparde VN, Sheth NU, Serrano MG, Glascock AL, Fettweis JM, . . . Jefferson KK. Comparison of Lactobacillus crispatus isolates from Lactobacillus-dominated vaginal microbiomes with isolates from microbiomes containing bacterial vaginosis-associated bacteria. Microbiology. Mar 2016;162(3):466-475.
  4. Ackerman DL, Craft KM, Doster RS, Weitkamp JH, Aronoff DM, Gaddy JA, Townsend SD. Antimicrobial and Antibiofilm Activity of Human Milk Oligosaccharides against Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, and Acinetobacter baumannii. ACS infectious diseases. Dec 8 2017.
  5. Ait-Belgnaoui A, Colom A, Braniste V, Ramalho L, Marrot A, Cartier C, . . . Tompkins T. Probiotic gut effect prevents the chronic psychological stress-induced brain activity abnormality in mice. Neurogastroenterology and motility: the official journal of the European Gastrointestinal Motility Society. Apr 2014;26(4):510-520.
  6. Al-Ghazzewi FH, Tester RF. Impact of prebiotics and probiotics on skin health. Benef Microbes. Jun 1 2014;5(2):99-107.
  7. Al-Jashaami LS, DuPont HL. Management of Clostridium difficile Infection. Gastroenterol Hepatol (N Y). Oct 2016;12(10):609-616.
  8. Allaker RP, Stephen AS. Use of Probiotics and Oral Health. Current oral health reports. 2017;4(4):309-318.
  9. Alverdy JC, Luo JN. The Influence of Host Stress on the Mechanism of Infection: Lost Microbiomes, Emergent Pathobiomes, and the Role of Interkingdom Signaling. Front Microbiol. 2017;8:322.
  10. Amato KR, Yeoman CJ, Cerda G, Schmitt CA, Cramer JD, Miller ME, . . . Leigh SR. Variable responses of human and non-human primate gut microbiomes to a Western diet. Microbiome. Nov 16 2015;3:53.
  11. Anderson JR, Carroll I, Azcarate-Peril MA, Rochette AD, Heinberg LJ, Peat C, . . . Gunstad J. A preliminary examination of gut microbiota, sleep, and cognitive flexibility in healthy older adults. Sleep Med. Oct 2017;38:104-107.
  12. Aoyagi Y, Park S, Matsubara S, Honda Y, Amamoto R, Kushiro A, . . . Shephard RJ. Habitual intake of fermented milk products containing Lactobacillus casei strain Shirota and a reduced risk of hypertension in older people. Benef Microbes. Feb 7 2017;8(1):23-29.
  13. Araujo JR, Tomas J, Brenner C, Sansonetti PJ. Impact of high-fat diet on the intestinal microbiota and small intestinal physiology before and after the onset of obesity. Biochimie. Oct 2017;141:97-106.
  14. Arboleya S, Watkins C, Stanton C, Ross RP. Gut Bifidobacteria Populations in Human Health and Aging. Front Microbiol. 2016;7:1204.
  15. Arseneault-Breard J, Rondeau I, Gilbert K, Girard SA, Tompkins TA, Godbout R, Rousseau G. Combination of Lactobacillus helveticus R0052 and Bifidobacterium longum R0175 reduces post-myocardial infarction depression symptoms and restores intestinal permeability in a rat model. The British journal of nutrition. Jun 2012;107(12):1793-1799.
  16. Arweiler NB, Netuschil L. The Oral Microbiota. Advances in experimental medicine and biology. 2016;902:45-60.
  17. Barker AK, Duster M, Valentine S, Hess T, Archbald-Pannone L, Guerrant R, Safdar N. A randomized controlled trial of probiotics for Clostridium difficile infection in adults (PICO). The Journal of antimicrobial chemotherapy. Nov 1 2017;72(11):3177-3180.
  18. Barnard E, Li H. Shaping of cutaneous function by encounters with commensals. The Journal of physiology. Jan 15 2017;595(2):437-450.
  19. Barton W, Penney NC, Cronin O, Garcia-Perez I, Molloy MG, Holmes E, . . . O'Sullivan O. The microbiome of professional athletes differs from that of more sedentary subjects in composition and particularly at the functional metabolic level. Gut. Mar 30 2017.
  20. Bartosch S, Woodmansey EJ, Paterson JC, McMurdo ME, Macfarlane GT. Microbiological effects of consuming a synbiotic containing Bifidobacterium bifidum, Bifidobacterium lactis, and oligofructose in elderly persons, determined by real-time polymerase chain reaction and counting of viable bacteria. Clinical infectious diseases: an official publication of the Infectious Diseases Society of America. Jan 1 2005;40(1):28-37.
  21. Battcock MA-A, S. Food and Agriculture Organization of the United Nations. Agricultural Services Bulletin No. 134: Fermented Fruits and Vegetables: A Global Perspective. Chapter 2: Basic Principles of Fermentation. http://www.fao.org/docrep/x0560e/x0560e07.htm. Published 1998. Accessed 02/23/2018.
  22. Beavers KM, Brinkley TE, Nicklas BJ. Effect of exercise training on chronic inflammation. Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry. Jun 3 2010;411(11-12):785-793.
  23. Beerepoot MA, ter Riet G, Nys S, van der Wal WM, de Borgie CA, de Reijke TM, . . . Geerlings SE. Lactobacilli vs antibiotics to prevent urinary tract infections: a randomized, double-blind, noninferiority trial in postmenopausal women. Archives of internal medicine. May 14 2012;172(9):704-712.
  24. Belei O, Olariu L, Dobrescu A, Marcovici T, Marginean O. Is It Useful to Administer Probiotics Together With Proton Pump Inhibitors in Children With Gastroesophageal Reflux? J Neurogastroenterol Motil. Jan 30 2018;24(1):51-57.
  25. Belkaid Y, Hand TW. Role of the microbiota in immunity and inflammation. Cell. Mar 27 2014;157(1):121-141.
  26. Benedict C, Vogel H, Jonas W, Woting A, Blaut M, Schurmann A, Cedernaes J. Gut microbiota and glucometabolic alterations in response to recurrent partial sleep deprivation in normal-weight young individuals. Molecular metabolism. Dec 2016;5(12):1175-1186.
  27. Bennet SM, Ohman L, Simren M. Gut microbiota as potential orchestrators of irritable bowel syndrome. Gut and liver. May 23 2015;9(3):318-331.
  28. Bermon S, Petriz B, Kajeniene A, Prestes J, Castell L, Franco OL. The microbiota: an exercise immunology perspective. Exercise immunology review. 2015;21:70-79.
  29. Bibiloni R, Fedorak RN, Tannock GW, Madsen KL, Gionchetti P, Campieri M, . . . Sartor RB. VSL#3 probiotic-mixture induces remission in patients with active ulcerative colitis. The American journal of gastroenterology. Jul 2005;100(7):1539-1546.
  30. Blaabjerg S, Artzi DM, Aabenhus R. Probiotics for the Prevention of Antibiotic-Associated Diarrhea in Outpatients-A Systematic Review and Meta-Analysis. Antibiotics (Basel, Switzerland). Oct 12 2017;6(4).
  31. Bohbot JM, Cardot JM. Vaginal impact of the oral administration of total freeze-dried culture of LCR 35 in healthy women. Infectious diseases in obstetrics and gynecology. 2012;2012:503648.
  32. Bowe W, Patel NB, Logan AC. Acne vulgaris, probiotics and the gut-brain-skin axis: from anecdote to translational medicine. Benef Microbes. Jun 1 2014;5(2):185-199.
  33. Branton WG, Ellestad KK, Maingat F, Wheatley BM, Rud E, Warren RL, . . . Power C. Brain microbial populations in HIV/AIDS: alpha-proteobacteria predominate independent of host immune status. PloS one. 2013;8(1):e54673.
  34. Bressa C, Bailen-Andrino M, Perez-Santiago J, Gonzalez-Soltero R, Perez M, Montalvo-Lominchar MG, . . . Larrosa M. Differences in gut microbiota profile between women with active lifestyle and sedentary women. PloS one. 2017;12(2):e0171352.
  35. Brown RL, Clarke TB. The regulation of host defences to infection by the microbiota. Immunology. Jan 2017;150(1):1-6.
  36. Burton JH, Johnson M, Johnson J, Hsia DS, Greenway FL, Heiman ML. Addition of a Gastrointestinal Microbiome Modulator to Metformin Improves Metformin Tolerance and Fasting Glucose Levels. Journal of Diabetes Science and Technology. 03/23 2015;9(4):808-814.
  37. Burton JP, Drummond BK, Chilcott CN, Tagg JR, Thomson WM, Hale JD, Wescombe PA. Influence of the probiotic Streptococcus salivarius strain M18 on indices of dental health in children: a randomized double-blind, placebo-controlled trial. J Med Microbiol. Jun 2013;62(Pt 6):875-884.
  38. Burton JP, Wescombe PA, Moore CJ, Chilcott CN, Tagg JR. Safety assessment of the oral cavity probiotic Streptococcus salivarius K12. Appl Environ Microbiol. Apr 2006;72(4):3050-3053.
  39. Cabinian A, Sinsimer D, Tang M, Zumba O, Mehta H, Toma A, . . . Laouar A. Transfer of Maternal Immune Cells by Breastfeeding: Maternal Cytotoxic T Lymphocytes Present in Breast Milk Localize in the Peyer's Patches of the Nursed Infant. PloS one. 2016;11(6):e0156762.
  40. Cammarota G, Ianiro G, Tilg H, Rajilic-Stojanovic M, Kump P, Satokari R, . . . Gasbarrini A. European consensus conference on faecal microbiota transplantation in clinical practice. Gut. Apr 2017;66(4):569-580.
  41. Canavan C, West J, Card T. The epidemiology of irritable bowel syndrome. Clinical epidemiology. 2014;6:71-80. Candido FG, Valente FX, Grzeskowiak LM, Moreira APB, Rocha D, Alfenas RCG. Impact of dietary fat on gut microbiota and low-grade systemic inflammation: mechanisms and clinical implications on obesity. International journal of food sciences and nutrition. Jul 4 2017:1-19.
  42. Caplpis Co. Ltd. Data on file. 2012.
  43. Capurso G, Lahner E. The interaction between smoking, alcohol and the gut microbiome. Best Pract Res Clin Gastroenterol. Oct 2017;31(5):579-588.
  44. Carabotti M, Scirocco A, Maselli MA, Severi C. The gut-brain axis: interactions between enteric microbiota, central and enteric nervous systems. Annals of Gastroenterology: Quarterly Publication of the Hellenic Society of Gastroenterology. Apr-Jun 2015;28(2):203-209.
  45. Cassidy-Bushrow AE, Burmeister C, Havstad S, Levin AM, Lynch SV, Ownby DR, . . . Wegienka G. Prenatal antimicrobial use and early-childhood body mass index. International journal of obesity (2005). Aug 17 2017.
  46. Castanys-Munoz E, Martin MJ, Vazquez E. Building a Beneficial Microbiome from Birth. Adv Nutr. Mar 2016;7(2):323-330.
  47. Cayzeele-Decherf A, Pelerin F, Leuillet S, Douillard B, Housez B, Cazaubiel M, . . . Desreumaux P. Saccharomyces cerevisiae CNCM I-3856 in irritable bowel syndrome: An individual subject meta-analysis. World journal of gastroenterology: WJG. Jan 14 2017;23(2):336-344.
  48. CDC. Centers for Disease Control and Prevention. Healthcare-Associated Infections: Frequently Asked Questions about Clostridium dificile or Healthcare Providers. https://www.cdc.gov/hai/organisms/cdiff/cdiff_faqs_hcp.html. Last updated 03/06/2012. Accessed 01/19/2018.
  49. Cervenka I, Agudelo LZ, Ruas JL. Kynurenines: Tryptophan's metabolites in exercise, inflammation, and mental health. Science (New York, N.Y.). Jul 28 2017;357(6349).
  50. Cesaro S, Chinello P, Rossi L, Zanesco L. Saccharomyces cerevisiae fungemia in a neutropenic patient treated with Saccharomyces boulardii. Supportive care in cancer: official journal of the Multinational Association of Supportive Care in Cancer. Nov 2000;8(6):504-505.
  51. Chan YK, Estaki M, Gibson DL. Clinical consequences of diet-induced dysbiosis. Ann Nutr Metab. 2013;63 Suppl 2:28-40.
  52. Chang YS, Trivedi MK, Jha A, Lin YF, Dimaano L, Garcia-Romero MT. Synbiotics for Prevention and Treatment of Atopic Dermatitis: A Meta-analysis of Randomized Clinical Trials. JAMA pediatrics. Mar 2016;170(3):236-242.
  53. Chanishvili N. Phage therapy--history from Twort and d'Herelle through Soviet experience to current approaches. Advances in virus research. 2012;83:3-40.
  54. Chedid V, Dhalla S, Clarke JO, Roland BC, Dunbar KB, Koh J, . . . Mullin GE. Herbal therapy is equivalent to rifaximin for the treatment of small intestinal bacterial overgrowth. Glob Adv Health Med. May 2014;3(3):16-24.
  55. Chen C, Song X, Wei W, Zhong H, Dai J, Lan Z, . . . Jia H. The microbiota continuum along the female reproductive tract and its relation to uterine-related diseases. Nature communications. Oct 17 2017;8(1):875.
  56. Chen Z, Li J, Gui S, Zhou C, Chen J, Yang C, . . . Xie P. Comparative metaproteomics analysis shows altered fecal microbiota signatures in patients with major depressive disorder. Neuroreport. Mar 21 2018;29(5):417-425.
  57. Cherifi S, Robberecht J, Miendje Y. Saccharomyces cerevisiae fungemia in an elderly patient with Clostridium difficile colitis. Acta clinica Belgica. Jul-Aug 2004;59(4):223-224.
  58. Chew SY, Cheah YK, Seow HF, Sandai D, Than LT. Probiotic Lactobacillus rhamnosus GR-1 and Lactobacillus reuteri RC-14 exhibit strong antifungal effects against vulvovaginal candidiasis-causing Candida glabrata isolates. J Appl Microbiol. May 2015;118(5):1180-1190.
  59. Chiang JY. Recent advances in understanding bile acid homeostasis. F1000Research. 2017;6:2029.
  60. Chung KF. Airway microbial dysbiosis in asthmatic patients: A target for prevention and treatment? The Journal of allergy and clinical immunology. Apr 2017;139(4):1071-1081.
  61. Ciorba MA. A gastroenterologist's guide to probiotics. Clinical gastroenterology and hepatology: the official clinical practice journal of the American Gastroenterological Association. Sep 2012;10(9):960-968.
  62. Claesson MJ, Cusack S, O'Sullivan O, Greene-Diniz R, de Weerd H, Flannery E, . . . O'Toole PW. Composition, variability, and temporal stability of the intestinal microbiota of the elderly. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Mar 15 2011;108 Suppl 1:4586-4591.
  63. Claesson MJ, Jeffery IB, Conde S, Power SE, O'Connor EM, Cusack S, . . . O'Toole PW. Gut microbiota composition correlates with diet and health in the elderly. Nature. Aug 9 2012;488(7410):178-184.
  64. Clapp M, Aurora N, Herrera L, Bhatia M, Wilen E, Wakefield S. Gut microbiota's effect on mental health: The gut-brain axis. Clinics and practice. Sep 15 2017;7(4):987.
  65. Clark A, Mach N. Exercise-induced stress behavior, gut-microbiota-brain axis and diet: a systematic review for athletes. Journal of the International Society of Sports Nutrition. 2016;13:43.
  66. Clarke SF, Murphy EF, O'Sullivan O, Lucey AJ, Humphreys M, Hogan A, . . . Cotter PD. Exercise and associated dietary extremes impact on gut microbial diversity. Gut. Dec 2014;63(12):1913-1920.
  67. Colombo CM, de Macedo RM, Fernandes-Silva MM, Caporal AM, Stinghen AE, Costantini CR, . . . Faria-Neto JR. Short-term effects of moderate intensity physical activity in patients with metabolic syndrome. Einstein (Sao Paulo, Brazil). Jul-Sep 2013;11(3):324-330.
  68. Compare D, Rocco A, Sgamato C, Coccoli P, Campo SM, Nazionale I, . . . Nardone G. Lactobacillus paracasei F19 versus placebo for the prevention of proton pump inhibitor-induced bowel symptoms: a randomized clinical trial. Dig Liver Dis. Apr 2015;47(4):273-279.
  69. Conly JM, Stein K. The production of menaquinones (vitamin K2) by intestinal bacteria and their role in maintaining coagulation homeostasis. Progress in food & nutrition science. Oct-Dec 1992;16(4):307-343.
  70. Correa-Oliveira R, Fachi JL, Vieira A, Sato FT, Vinolo MA. Regulation of immune cell function by short-chain fatty acids. Clinical & translational immunology. Apr 2016;5(4):e73.
  71. Corsello G, Carta M, Marinello R, Picca M, De Marco G, Micillo M, . . . Berni Canani R. Preventive Effect of Cow's Milk Fermented with Lactobacillus paracasei CBA L74 on Common Infectious Diseases in Children: A Multicenter Randomized Controlled Trial. Nutrients. Jun 27 2017;9(7).
  72. Costabile A, Buttarazzi I, Kolida S, Quercia S, Baldini J, Swann JR, . . . Gibson GR. An in vivo assessment of the cholesterol-lowering efficacy of Lactobacillus plantarum ECGC 13110402 in normal to mildly hypercholesterolaemic adults. PloS one. 2017;12(12):e0187964.
  73. Costantini L, Molinari R, Farinon B, Merendino N. Impact of Omega-3 Fatty Acids on the Gut Microbiota. International journal of molecular sciences. Dec 7 2017;18(12).
  74. Coton M, Pawtowski A, Taminiau B, Burgaud G, Deniel F, Coulloumme-Labarthe L, . . . Coton E. Unraveling microbial ecology of industrial-scale Kombucha fermentations by metabarcoding and culture-based methods. FEMS microbiology ecology. May 1 2017;93(5).
  75. Cribby S, Taylor M, Reid G. Vaginal microbiota and the use of probiotics. Interdisciplinary perspectives on infectious diseases. 2008;2008:256490.
  76. Cui L, Morris A, Huang L, Beck JM, Twigg HL, 3rd, von Mutius E, Ghedin E. The microbiome and the lung. Annals of the American Thoracic Society. Aug 2014;11 Suppl 4:S227-232.
  77. D’Argenio V, Salvatore F. The role of the gut microbiome in the healthy adult status. Clinica Chimica Acta. 2015;451(Part A):97-102.
  78. Dahl WJ, Stewart ML. Position of the Academy of Nutrition and Dietetics: Health Implications of Dietary Fiber. Journal of the Academy of Nutrition and Dietetics. Nov 2015;115(11):1861-1870.
  79. Daliri EB, Lee BH, Oh DH. Current Perspectives on Antihypertensive Probiotics. Probiotics and antimicrobial proteins. Jun 2017;9(2):91-101.
  80. Dalmasso M, Strain R, Neve H, Franz CM, Cousin FJ, Ross RP, Hill C. Three New Escherichia coli Phages from the Human Gut Show Promising Potential for Phage Therapy. PloS one. 2016;11(6):e0156773.
  81. Davenport ER, Sanders JG, Song SJ, Amato KR, Clark AG, Knight R. The human microbiome in evolution. BMC Biol. Dec 27 2017;15(1):127.
  82. David LA, Maurice CF, Carmody RN, Gootenberg DB, Button JE, Wolfe BE, . . . Turnbaugh PJ. Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome. Nature. Jan 23 2014;505(7484):559-563.
  83. De Seta F, Parazzini F, De Leo R, Banco R, Maso GP, De Santo D, . . . Restaino S. Lactobacillus plantarum P17630 for preventing Candida vaginitis recurrence: a retrospective comparative study. European journal of obstetrics, gynecology, and reproductive biology. Nov 2014;182:136-139.
  84. de Steenhuijsen Piters WA, Sanders EA, Bogaert D. The role of the local microbial ecosystem in respiratory health and disease. Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences. Aug 19 2015;370(1675).
  85. DeGruttola AK, Low D, Mizoguchi A, Mizoguchi E. Current Understanding of Dysbiosis in Disease in Human and Animal Models. Inflamm Bowel Dis. May 2016;22(5):1137-1150.
  86. Deidda F, Amoruso A, Nicola S, Graziano T, Pane M, Allesina S, . . . Mogna L. The In Vitro Effectiveness of Lactobacillus fermentum Against Different Candida Species Compared With Broadly Used Azoles. Journal of clinical gastroenterology. Nov/Dec 2016;50 Suppl 2, Proceedings from the 8th Probiotics, Prebiotics & New Foods for Microbiota and Human Health meeting held in Rome, Italy on September 13-15, 2015:S171-s174.
  87. Del Piano M, Anderloni A, Balzarini M, Ballare M, Carmagnola S, Montino F, . . . Mogna G. The innovative potential of Lactobacillus rhamnosus LR06, Lactobacillus pentosus LPS01, Lactobacillus plantarum LP01, and Lactobacillus delbrueckii Subsp. delbrueckii LDD01 to restore the "gastric barrier effect" in patients chronically treated with PPI: a pilot study. Journal of clinical gastroenterology. Oct 2012;46 Suppl:S18-26.
  88. Del Piano M, Carmagnola S, Anderloni A, Andorno S, Ballare M, Balzarini M, . . . Capurso L. The use of probiotics in healthy volunteers with evacuation disorders and hard stools: a double-blind, randomized, placebo-controlled study. Journal of clinical gastroenterology. Sep 2010;44 Suppl 1:S30-34.
  89. Deng ZL, Sztajer H, Jarek M, Bhuju S, Wagner-Dobler I. Worlds Apart - Transcriptome Profiles of Key Oral Microbes in the Periodontal Pocket Compared to Single Laboratory Culture Reflect Synergistic Interactions. Front Microbiol. 2018;9:124.
  90. Derrien M, van Hylckama Vlieg JE. Fate, activity, and impact of ingested bacteria within the human gut microbiota. Trends in microbiology. Jun 2015;23(6):354-366.
  91. Derwa Y, Gracie DJ, Hamlin PJ, Ford AC. Systematic review with meta-analysis: the efficacy of probiotics in inflammatory bowel disease. Alimentary pharmacology & therapeutics. Aug 2017;46(4):389-400.
  92. Dewhirst FE, Chen T, Izard J, Paster BJ, Tanner AC, Yu WH, . . . Wade WG. The human oral microbiome. J Bacteriol. Oct 2010;192(19):5002-5017.
  93. Di Pierro F, Colombo M, Giuliani MG, Danza ML, Basile I, Bollani T, . . . Rottoli AS. Effect of administration of Streptococcus salivarius K12 on the occurrence of streptococcal pharyngo-tonsillitis, scarlet fever and acute otitis media in 3 years old children. European review for medical and pharmacological sciences. Nov 2016;20(21):4601-4606.
  94. Di Pierro F, Colombo M, Zanvit A, Risso P, Rottoli AS. Use of Streptococcus salivarius K12 in the prevention of streptococcal and viral pharyngotonsillitis in children. Drug Healthc Patient Saf. 2014;6:15-20.
  95. Di Pierro F, Colombo M, Zanvit A, Rottoli AS. Positive clinical outcomes derived from using Streptococcus salivarius K12 to prevent streptococcal pharyngotonsillitis in children: a pilot investigation. Drug Healthc Patient Saf. 2016;8:77-81.
  96. Di Pierro F, Di Pasquale D, Di Cicco M. Oral use of Streptococcus salivarius K12 in children with secretory otitis media: preliminary results of a pilot, uncontrolled study. International journal of general medicine. 2015;8:303-308.
  97. Di Pierro F, Donato G, Fomia F, Adami T, Careddu D, Cassandro C, Albera R. Preliminary pediatric clinical evaluation of the oral probiotic Streptococcus salivarius K12 in preventing recurrent pharyngitis and/or tonsillitis caused by Streptococcus pyogenes and recurrent acute otitis media. International journal of general medicine. 2012;5:991-997.
  98. Di Pierro F, Zanvit A, Nobili P, Risso P, Fornaini C. Cariogram outcome after 90 days of oral treatment with Streptococcus salivarius M18 in children at high risk for dental caries: results of a randomized, controlled study. Clinical, cosmetic and investigational dentistry. 2015;7:107-113.
  99. Di Pilato V, Freschi G, Ringressi MN, Pallecchi L, Rossolini GM, Bechi P. The esophageal microbiota in health and disease. Annals of the New York Academy of Sciences. Oct 2016;1381(1):21-33.
  100. Di Stefano M, Miceli E, Armellini E, Missanelli A, Corazza GR. Probiotics and functional abdominal bloating. Journal of clinical gastroenterology. Jul 2004;38(6 Suppl):S102-103.
  101. Dibb WL. The normal microbial flora of the outer ear canal in healthy Norwegian individuals. NIPH annals. Jun 1990;13(1):11-16.
  102. Didari T, Mozaffari S, Nikfar S, Abdollahi M. Effectiveness of probiotics in irritable bowel syndrome: Updated systematic review with meta-analysis. World journal of gastroenterology: WJG. Mar 14 2015;21(10):3072-3084.
  103. Dimidi E, Christodoulides S, Fragkos KC, Scott SM, Whelan K. The effect of probiotics on functional constipation in adults: a systematic review and meta-analysis of randomized controlled trials. The American journal of clinical nutrition. Oct 2014;100(4):1075-1084.
  104. Dimidi E, Christodoulides S, Scott SM, Whelan K. Mechanisms of Action of Probiotics and the Gastrointestinal Microbiota on Gut Motility and Constipation. Adv Nutr. May 2017;8(3):484-494.
  105. Distrutti E, Monaldi L, Ricci P, Fiorucci S. Gut microbiota role in irritable bowel syndrome: New therapeutic strategies. World journal of gastroenterology. Feb 21 2016;22(7):2219-2241.
  106. Dolin BJ. Effects of a proprietary Bacillus coagulans preparation on symptoms of diarrhea-predominant irritable bowel syndrome. Methods and findings in experimental and clinical pharmacology. Dec 2009;31(10):655-659.
  107. Dominguez-Bello MG, De Jesus-Laboy KM, Shen N, Cox LM, Amir A, Gonzalez A, . . . Clemente JC. Partial restoration of the microbiota of cesarean-born infants via vaginal microbial transfer. Nat Med. Mar 2016;22(3):250-253.
  108. Donovan SM, Comstock SS. Human Milk Oligosaccharides Influence Neonatal Mucosal and Systemic Immunity. Ann Nutr Metab. 2016;69 Suppl 2:42-51.
  109. Doron S, Snydman DR. Risk and safety of probiotics. Clin Infect Dis. May 15 2015;60 Suppl 2:S129-134.
  110. Doss J, Culbertson K, Hahn D, Camacho J, Barekzi N. A Review of Phage Therapy against Bacterial Pathogens of Aquatic and Terrestrial Organisms. Viruses. Mar 18 2017;9(3).
  111. Dubinkina VB, Tyakht AV, Odintsova VY, Yarygin KS, Kovarsky BA, Pavlenko AV, . . . Govorun VM. Links of gut microbiota composition with alcohol dependence syndrome and alcoholic liver disease. Microbiome. Oct 17 2017;5(1):141.
  112. Elazab N, Mendy A, Gasana J, Vieira ER, Quizon A, Forno E. Probiotic administration in early life, atopy, and asthma: a meta-analysis of clinical trials. Pediatrics. Sep 2013;132(3):e666-676.
  113. Estaki M, Pither J, Baumeister P, Little JP, Gill SK, Ghosh S, . . . Gibson DL. Cardiorespiratory fitness as a predictor of intestinal microbial diversity and distinct metagenomic functions. Microbiome. Aug 8 2016;4(1):42.
  114. Etienne-Mesmin L, Chassaing B, Gewirtz AT. Tryptophan: A gut microbiota-derived metabolites regulating inflammation. World J Gastrointest Pharmacol Ther. Feb 6 2017;8(1):7-9.
  115. Evivie SE, Huo GC, Igene JO, Bian X. Some current applications, limitations and future perspectives of lactic acid bacteria as probiotics. Food Nutr Res. 2017;61(1):1318034.
  116. Fabbiano S, Suarez-Zamorano N, Trajkovski M. Host-Microbiota Mutualism in Metabolic Diseases. Frontiers in endocrinology. 2017;8:267.
  117. Fabbrocini G, Bertona M, Picazo O, Pareja-Galeano H, Monfrecola G, Emanuele E. Supplementation with Lactobacillus rhamnosus SP1 normalises skin expression of genes implicated in insulin signalling and improves adult acne. Benef Microbes. Nov 30 2016;7(5):625-630.
  118. Fakhoury M, Negrulj R, Mooranian A, Al-Salami H. Inflammatory bowel disease: clinical aspects and treatments. J Inflamm Res. 2014;7:113-120.
  119. Fakruddin M, Hossain MN, Ahmed MM. Antimicrobial and antioxidant activities of Saccharomyces cerevisiae IFST062013, a potential probiotic. BMC complementary and alternative medicine. Jan 21 2017;17(1):64.
  120. Falana K, Knight R, Martin CR, Goldszmid R, Greathouse KL, Gere J, . . . Kuo WP. Short Course in the Microbiome. Journal of circulating biomarkers. Jan-Dec 2015;4:8.
  121. Fasano A. Intestinal permeability and its regulation by zonulin: diagnostic and therapeutic implications. Clinical gastroenterology and hepatology: the official clinical practice journal of the American Gastroenterological Association. Oct 2012;10(10):1096-1100.
  122. Fashner J, Gitu AC. Diagnosis and Treatment of Peptic Ulcer Disease and H. pylori Infection. American family physician. Feb 15 2015;91(4):236-242.
  123. Fernandez M, Hudson JA, Korpela R, de los Reyes-Gavilan CG. Impact on human health of microorganisms present in fermented dairy products: an overview. Biomed Res Int. 2015;2015:412714.
  124. Ferrario C, Statello R, Carnevali L, Mancabelli L, Milani C, Mangifesta M, . . . Turroni F. How to Feed the Mammalian Gut Microbiota: Bacterial and Metabolic Modulation by Dietary Fibers. Front Microbiol. 2017;8:1749.
  125. Fijan S. Microorganisms with claimed probiotic properties: an overview of recent literature. International journal of environmental research and public health. May 5 2014;11(5):4745-4767.
  126. Flint HJ, Scott KP, Duncan SH, Louis P, Forano E. Microbial degradation of complex carbohydrates in the gut. Gut Microbes. Jul-Aug 2012;3(4):289-306.
  127. Flowers SA, Ellingrod VL. The Microbiome in Mental Health: Potential Contribution of Gut Microbiota in Disease and Pharmacotherapy Management. Pharmacotherapy. Oct 2015;35(10):910-916.
  128. Ford AC, Quigley EM, Lacy BE, Lembo AJ, Saito YA, Schiller LR, . . . Moayyedi P. Efficacy of prebiotics, probiotics, and synbiotics in irritable bowel syndrome and chronic idiopathic constipation: systematic review and meta-analysis. The American journal of gastroenterology. Oct 2014;109(10):1547-1561; quiz 1546, 1562.
  129. Foxman B, Buxton M. Alternative approaches to conventional treatment of acute uncomplicated urinary tract infection in women. Current infectious disease reports. Apr 2013;15(2):124-129.
  130. Foxman B, Goldberg D. Why the human microbiome project should motivate epidemiologists to learn ecology. Epidemiology (Cambridge, Mass.). Nov 2010;21(6):757-759.
  131. Francino MP. Antibiotics and the Human Gut Microbiome: Dysbioses and Accumulation of Resistances. Front Microbiol. 2015;6:1543.
  132. Fujiki T, Hirose Y, Yamamoto Y, Murosaki S. Enhanced immunomodulatory activity and stability in simulated digestive juices of Lactobacillus plantarum L-137 by heat treatment. Bioscience, biotechnology, and biochemistry. 2012;76(5):918-922.
  133. Fujimori S. What are the effects of proton pump inhibitors on the small intestine? World journal of gastroenterology. Jun 14 2015;21(22):6817-6819.
  134. Fujimura KE, Lynch SV. Microbiota in allergy and asthma and the emerging relationship with the gut microbiome. Cell Host Microbe. May 13 2015;17(5):592-602.
  135. Fujita R, Iimuro S, Shinozaki T, Sakamaki K, Uemura Y, Takeuchi A, . . . Ohashi Y. Decreased duration of acute upper respiratory tract infections with daily intake of fermented milk: a multicenter, double-blinded, randomized comparative study in users of day care facilities for the elderly population. American journal of infection control. Dec 2013;41(12):1231-1235.
  136. Fujiya M, Ueno N, Kohgo Y. Probiotic treatments for induction and maintenance of remission in inflammatory bowel diseases: a meta-analysis of randomized controlled trials. Clinical journal of gastroenterology. Feb 2014;7(1):1-13.
  137. Galland L. The gut microbiome and the brain. Journal of medicinal food. Dec 2014;17(12):1261-1272.
  138. Gallo A, Passaro G, Gasbarrini A, Landolfi R, Montalto M. Modulation of microbiota as treatment for intestinal inflammatory disorders: An uptodate. World journal of gastroenterology: WJG. Aug 28 2016;22(32):7186-7202.
  139. Gallone B, Steensels J, Prahl T, Soriaga L, Saels V, Herrera-Malaver B, . . . Verstrepen KJ. Domestication and Divergence of Saccharomyces cerevisiae Beer Yeasts. Cell. Sep 8 2016;166(6):1397-1410.e1316.
  140. Galofre M, Palao D, Vicario M, Nart J, Violant D. Clinical and microbiological evaluation of the effect of Lactobacillus reuteri in the treatment of mucositis and peri-implantitis: A triple-blind randomized clinical trial. Journal of periodontal research. Jan 19 2018.
  141. Ganji-Arjenaki M, Rafieian-Kopaei M. Probiotics are a good choice in remission of inflammatory bowel diseases: A meta analysis and systematic review. J Cell Physiol. Mar 2018;233(3):2091-2103.
  142. Gao Z, Kang Y, Yu J, Ren L. Human pharyngeal microbiome may play a protective role in respiratory tract infections. Genomics, proteomics & bioinformatics. Jun 2014;12(3):144-150.
  143. Gatej SM, Marino V, Bright R, Fitzsimmons TR, Gully N, Zilm P, . . . Bartold PM. Probiotic Lactobacillus rhamnosus GG prevents alveolar bone loss in a mouse model of experimental periodontitis. J Clin Periodontol. Feb 2018;45(2):204-212.
  144. Gaya P, Medina M, Sanchez-Jimenez A, Landete JM. Phytoestrogen Metabolism by Adult Human Gut Microbiota. Molecules. Aug 9 2016;21(8).
  145. Gevers D, Knight R, Petrosino JF, Huang K, McGuire AL, Birren BW, . . . Huttenhower C. The Human Microbiome Project: a community resource for the healthy human microbiome. PLoS biology. 2012;10(8):e1001377.
  146. Ghoshal UC, Shukla R, Ghoshal U. Small Intestinal Bacterial Overgrowth and Irritable Bowel Syndrome: A Bridge between Functional Organic Dichotomy. Gut and liver. Mar 15 2017;11(2):196-208.
  147. Giddings SL, Stevens AM, Leung DT. Traveler's Diarrhea. The Medical clinics of North America. Mar 2016;100(2):317-330.
  148. Girard P, Coppe MC, Pansart Y, Gillardin JM. Gastroprotective effect of Saccharomyces boulardii in a rat model of ibuprofen-induced gastric ulcer. Pharmacology. 2010;85(3):188-193.
  149. Girard SA, Bah TM, Kaloustian S, Lada-Moldovan L, Rondeau I, Tompkins TA, . . . Rousseau G. Lactobacillus helveticus and Bifidobacterium longum taken in combination reduce the apoptosis propensity in the limbic system after myocardial infarction in a rat model. The British journal of nutrition. Nov 2009;102(10):1420-1425.
  150. Goderska K, Agudo Pena S, Alarcon T. Helicobacter pylori treatment: antibiotics or probiotics. Appl Microbiol Biotechnol. Jan 2018;102(1):1-7.
  151. Goldenberg JZ, Yap C, Lytvyn L, Lo CK, Beardsley J, Mertz D, Johnston BC. Probiotics for the prevention of Clostridium difficile-associated diarrhea in adults and children. The Cochrane database of systematic reviews. Dec 19 2017;12:Cd006095.
  152. Goodrich JK, Waters JL, Poole AC, Sutter JL, Koren O, Blekhman R, . . . Ley RE. Human genetics shape the gut microbiome. Cell. Nov 6 2014;159(4):789-799.
  153. Graf D, Di Cagno R, Fak F, Flint HJ, Nyman M, Saarela M, Watzl B. Contribution of diet to the composition of the human gut microbiota. Microbial ecology in health and disease. 2015;26:26164.
  154. Greenway F, Wang S, Heiman M. A novel cobiotic containing a prebiotic and an antioxidant augments the glucose control and gastrointestinal tolerability of metformin: a case report. Benef Microbes. Mar 2014;5(1):29-32.
  155. Grice EA, Segre JA. The skin microbiome. Nature reviews. Microbiology. Apr 2011;9(4):244-253.
  156. Grosicki GJ, Fielding RA, Lustgarten MS. Gut Microbiota Contribute to Age-Related Changes in Skeletal Muscle Size, Composition, and Function: Biological Basis for a Gut-Muscle Axis. Calcified tissue international. Oct 20 2017.
  157. Guenther S, Loessner MJ. Bacteriophage biocontrol of Listeria monocytogenes on soft ripened white mold and red-smear cheeses. Bacteriophage. Mar 2011;1(2):94-100.
  158. Gulden E, Vudattu NK, Deng S, Preston-Hurlburt P, Mamula M, Reed JC, . . . Herold KC. Microbiota control immune regulation in humanized mice. JCI insight. Nov 2 2017;2(21).
  159. Gupta ND, Sharma S, Sharma VK. Probiotic - An emerging therapy in recolonizing periodontal pocket. Journal of oral biology and craniofacial research. Jan-Apr 2017;7(1):72-73.
  160. Guslandi M, Giollo P, Testoni PA. A pilot trial of Saccharomyces boulardii in ulcerative colitis. European journal of gastroenterology & hepatology. Jun 2003;15(6):697-698.
  161. Guslandi M, Mezzi G, Sorghi M, Testoni PA. Saccharomyces boulardii in maintenance treatment of Crohn's disease. Digestive diseases and sciences. Jul 2000;45(7):1462-1464.
  162. Halfvarson J, Brislawn CJ, Lamendella R, Vazquez-Baeza Y, Walters WA, Bramer LM, . . . Jansson JK. Dynamics of the human gut microbiome in inflammatory bowel disease. Nature microbiology. Feb 13 2017;2:17004.
  163. Hanson L, VandeVusse L, Jerme M, Abad CL, Safdar N. Probiotics for Treatment and Prevention of Urogenital Infections in Women: A Systematic Review. Journal of midwifery & women's health. May 2016;61(3):339-355.
  164. Hao Q, Dong BR, Wu T. Probiotics for preventing acute upper respiratory tract infections. The Cochrane database of systematic reviews. Feb 3 2015(2):Cd006895.
  165. Happel AU, Barnabas SL, Froissart R, Passmore JS. Weighing in on the risks and benefits of probiotic use in HIV-infected and immunocompromised populations. Benef Microbes. Feb 27 2018;9(2):239-246.
  166. Haro C, Garcia-Carpintero S, Rangel-Zuniga OA, Alcala-Diaz JF, Landa BB, Clemente JC, . . . Camargo A. Consumption of Two Healthy Dietary Patterns Restored Microbiota Dysbiosis in Obese Patients with Metabolic Dysfunction. Mol Nutr Food Res. Dec 2017;61(12).
  167. Haukioja A. Probiotics and oral health. European journal of dentistry. Jul 2010;4(3):348-355.
  168. Hauptmann M, Schaible UE. Linking microbiota and respiratory disease. FEBS letters. Nov 2016;590(21):3721-3738.
  169. He M, Shi B. Gut microbiota as a potential target of metabolic syndrome: the role of probiotics and prebiotics. Cell & bioscience. 2017;7:54.
  170. Hedayati-Hajikand T, Lundberg U, Eldh C, Twetman S. Effect of probiotic chewing tablets on early childhood caries--a randomized controlled trial. BMC oral health. 2015;15(1):112.
  171. Heinlen L, Ballard JD. Clostridium difficile infection. The American journal of the medical sciences. Sep 2010;340(3):247-252.
  172. Hill D, Sugrue I, Arendt E, Hill C, Stanton C, Ross RP. Recent advances in microbial fermentation for dairy and health. F1000Research. 2017;6:751.
  173. Hirose Y, Yamamoto Y, Yoshikai Y, Murosaki S. Oral intake of heat-killed Lactobacillus plantarum L-137 decreases the incidence of upper respiratory tract infection in healthy subjects with high levels of psychological stress. Journal of nutritional science. 2013;2:e39.
  174. Ho JT, Chan GC, Li JC. Systemic effects of gut microbiota and its relationship with disease and modulation. BMC immunology. Mar 26 2015;16:21.
  175. Homan M, Orel R. Are probiotics useful in Helicobacter pylori eradication? World journal of gastroenterology. Oct 7 2015;21(37):10644-10653.
  176. Homayouni A, Bastani P, Ziyadi S, Mohammad-Alizadeh-Charandabi S, Ghalibaf M, Mortazavian AM, Mehrabany EV. Effects of probiotics on the recurrence of bacterial vaginosis: a review. Journal of lower genital tract disease. Jan 2014;18(1):79-86.
  177. Househam AM, Peterson CT, Mills PJ, Chopra D. The Effects of Stress and Meditation on the Immune System, Human Microbiota, and Epigenetics. Adv Mind Body Med. Fall 2017;31(4):10-25.
  178. Hu X, Wang T, Jin F. Alzheimer's disease and gut microbiota. Science China. Life sciences. Oct 2016;59(10):1006-1023. Huang B, Fettweis JM, Brooks JP, Jefferson KK, Buck GA. The Changing Landscape of the Vaginal Microbiome. Clinics in laboratory medicine. Dec 2014;34(4):747-761.
  179. Huang H, Song L, Zhao W. Effects of probiotics for the treatment of bacterial vaginosis in adult women: a meta-analysis of randomized clinical trials. Archives of gynecology and obstetrics. Jun 2014;289(6):1225-1234.
  180. Huang R, Ning H, Shen M, Li J, Zhang J, Chen X. Probiotics for the Treatment of Atopic Dermatitis in Children: A Systematic Review and Meta-Analysis of Randomized Controlled Trials. Frontiers in cellular and infection microbiology. 2017;7:392.
  181. Huang YJ, Lynch SV. The emerging relationship between the airway microbiota and chronic respiratory disease: clinical implications. Expert review of respiratory medicine. Dec 2011;5(6):809-821.
  182. Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature. Jun 13 2012;486(7402):207-214.
  183. Hun L. Bacillus coagulans significantly improved abdominal pain and bloating in patients with IBS. Postgrad Med. Mar 2009;121(2):119-124.
  184. Huse SM, Ye Y, Zhou Y, Fodor AA. A core human microbiome as viewed through 16S rRNA sequence clusters. PloS one. 2012;7(6):e34242.
  185. Igarashi M, Nakae H, Matsuoka T, Takahashi S, Hisada T, Tomita J, Koga Y. Alteration in the gastric microbiota and its restoration by probiotics in patients with functional dyspepsia. BMJ open gastroenterology. 2017;4(1):e000144.
  186. Ince G, Gursoy H, Ipci SD, Cakar G, Emekli-Alturfan E, Yilmaz S. Clinical and Biochemical Evaluation of Lozenges Containing Lactobacillus reuteri as an Adjunct to Non-Surgical Periodontal Therapy in Chronic Periodontitis. J Periodontol. Jun 2015;86(6):746-754.
  187. Inoue Y, Kambara T, Murata N, Komori-Yamaguchi J, Matsukura S, Takahashi Y, . . . Aihara M. Effects of oral administration of Lactobacillus acidophilus L-92 on the symptoms and serum cytokines of atopic dermatitis in Japanese adults: a double-blind, randomized, clinical trial. Int Arch Allergy Immunol. 2014;165(4):247-254.
  188. Iovino P, Bucci C, Tremolaterra F, Santonicola A, Chiarioni G. Bloating and functional gastro-intestinal disorders: where are we and where are we going? World journal of gastroenterology: WJG. Oct 21 2014;20(39):14407-14419.
  189. Ishida Y, Bandou I, Kanzato H, Yamamoto N. Decrease in ovalbumin specific IgE of mice serum after oral uptake of lactic acid bacteria. Bioscience, biotechnology, and biochemistry. May 2003;67(5):951-957.
  190. Ishida Y, Nakamura F, Kanzato H, Sawada D, Hirata H, Nishimura A, . . . Fujiwara S. Clinical effects of Lactobacillus acidophilus strain L-92 on perennial allergic rhinitis: a double-blind, placebo-controlled study. J Dairy Sci. Feb 2005;88(2):527-533.
  191. Ishida Y, Nakamura F, Kanzato H, Sawada D, Yamamoto N, Kagata H, . . . Fujiwara S. Effect of milk fermented with Lactobacillus acidophilus strain L-92 on symptoms of Japanese cedar pollen allergy: a randomized placebo-controlled trial. Bioscience, biotechnology, and biochemistry. Sep 2005;69(9):1652-1660.
  192. Islam KB, Fukiya S, Hagio M, Fujii N, Ishizuka S, Ooka T, . . . Yokota A. Bile acid is a host factor that regulates the composition of the cecal microbiota in rats. Gastroenterology. Nov 2011;141(5):1773-1781.
  193. Islam SU. Clinical Uses of Probiotics. Medicine. Feb 2016;95(5):e2658.
  194. Iwamoto T, Suzuki N, Tanabe K, Takeshita T, Hirofuji T. Effects of probiotic Lactobacillus salivarius WB21 on halitosis and oral health: an open-label pilot trial. Oral surgery, oral medicine, oral pathology, oral radiology, and endodontics. Aug 2010;110(2):201-208.
  195. Iwasaki K, Maeda K, Hidaka K, Nemoto K, Hirose Y, Deguchi S. Daily Intake of Heat-killed Lactobacillus plantarum L-137 Decreases the Probing Depth in Patients Undergoing Supportive Periodontal Therapy. Oral health & preventive dentistry. 2016;14(3):207-214.
  196. Janakiram C, Deepan Kumar CV, Joseph J. Xylitol in preventing dental caries: A systematic review and meta-analyses. Journal of natural science, biology, and medicine. Jan-Jun 2017;8(1):16-21.
  197. Jandhyala SM, Talukdar R, Subramanyam C, Vuyyuru H, Sasikala M, Nageshwar Reddy D. Role of the normal gut microbiota. World journal of gastroenterology: WJG. Aug 7 2015;21(29):8787-8803.
  198. Jarde A, Lewis-Mikhael AM, Moayyedi P, Stearns JC, Collins SM, Beyene J, McDonald SD. Pregnancy outcomes in women taking probiotics or prebiotics: a systematic review and meta-analysis. BMC Pregnancy Childbirth. Jan 8 2018;18(1):14.
  199. Jasarevic E, Howard CD, Misic AM, Beiting DP, Bale TL. Stress during pregnancy alters temporal and spatial dynamics of the maternal and offspring microbiome in a sex-specific manner. Sci Rep. Mar 7 2017;7:44182.
  200. Jasarevic E, Howerton CL, Howard CD, Bale TL. Alterations in the Vaginal Microbiome by Maternal Stress Are Associated With Metabolic Reprogramming of the Offspring Gut and Brain. Endocrinology. Sep 2015;156(9):3265-3276.
  201. Jasarevic E, Rodgers AB, Bale TL. A novel role for maternal stress and microbial transmission in early life programming and neurodevelopment. Neurobiology of stress. Jan 1 2015;1:81-88.
  202. Jenkins TA, Nguyen JC, Polglaze KE, Bertrand PP. Influence of Tryptophan and Serotonin on Mood and Cognition with a Possible Role of the Gut-Brain Axis. Nutrients. Jan 20 2016;8(1).
  203. Jensen GS, Patterson KM, Barnes J, Schauss AG, Beaman R, Reeves SG, Robinson LE. A double-blind placebo-controlled, randomized pilot study: consumption of a high-metabolite immunogen from yeast culture has beneficial effects on erythrocyte health and mucosal immune protection in healthy subjects. The Open Nutrition Journal. 2008;2(1).
  204. Jerzynska J, Stelmach W, Balcerak J, Woicka-Kolejwa K, Rychlik B, Blauz A, . . . Stelmach I. Effect of Lactobacillus rhamnosus GG and vitamin D supplementation on the immunologic effectiveness of grass-specific sublingual immunotherapy in children with allergy. Allergy and asthma proceedings: the official journal of regional and state allergy societies. Jul 2016;37(4):324-334.
  205. Jespersen L, Tarnow I, Eskesen D, Morberg CM, Michelsen B, Bugel S, . . . Calder PC. Effect of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei, L. casei 431 on immune response to influenza vaccination and upper respiratory tract infections in healthy adult volunteers: a randomized, double-blind, placebo-controlled, parallel-group study. The American journal of clinical nutrition. Jun 2015;101(6):1188-1196.
  206. Jiao Y, Hasegawa M, Inohara N. The Role of Oral Pathobionts in Dysbiosis during Periodontitis Development. Journal of dental research. Jun 2014;93(6):539-546.
  207. Johnson KV, Burnet PW. Microbiome: Should we diversify from diversity? Gut Microbes. Nov 2016;7(6):455-458. Jones ML, Martoni CJ, Parent M, Prakash S. Cholesterol-lowering efficacy of a microencapsulated bile salt hydrolase-active Lactobacillus reuteri NCIMB 30242 yoghurt formulation in hypercholesterolaemic adults. The British journal of nutrition. May 2012;107(10):1505-1513.
  208. Jones ML, Martoni CJ, Prakash S. Cholesterol lowering and inhibition of sterol absorption by Lactobacillus reuteri NCIMB 30242: a randomized controlled trial. European journal of clinical nutrition. Nov 2012;66(11):1234-1241.
  209. Jones ML, Martoni CJ, Prakash S. Oral supplementation with probiotic L. reuteri NCIMB 30242 increases mean circulating 25-hydroxyvitamin D: a post hoc analysis of a randomized controlled trial. The Journal of clinical endocrinology and metabolism. Jul 2013;98(7):2944-2951.
  210. Jung GW, Tse JE, Guiha I, Rao J. Prospective, randomized, open-label trial comparing the safety, efficacy, and tolerability of an acne treatment regimen with and without a probiotic supplement and minocycline in subjects with mild to moderate acne. Journal of cutaneous medicine and surgery. Mar-Apr 2013;17(2):114-122.
  211. Kafshdooz T, Akbarzadeh A, Majdi Seghinsara A, Pourhassan M, Nasrabadi HT, Milani M. Role of Probiotics in Managing of Helicobacter Pylori Infection: A Review. Drug research. Feb 2017;67(2):88-93.
  212. Kalman DS, Schwartz HI, Alvarez P, Feldman S, Pezzullo JC, Krieger DR. A prospective, randomized, double-blind, placebo-controlled parallel-group dual site trial to evaluate the effects of a Bacillus coagulans-based product on functional intestinal gas symptoms. BMC Gastroenterol. Nov 18 2009;9:85.
  213. Kang BS, Seo JG, Lee GS, Kim JH, Kim SY, Han YW, . . . Park YM. Antimicrobial activity of enterocins from Enterococcus faecalis SL-5 against Propionibacterium acnes, the causative agent in acne vulgaris, and its therapeutic effect. Journal of microbiology (Seoul, Korea). Feb 2009;47(1):101-109.
  214. Kang C, Wang B, Kaliannan K, Wang X, Lang H, Hui S, . . . Mi M. Gut Microbiota Mediates the Protective Effects of Dietary Capsaicin against Chronic Low-Grade Inflammation and Associated Obesity Induced by High-Fat Diet. MBio. May 23 2017;8(3).
  215. Kang C, Zhang Y, Zhu X, Liu K, Wang X, Chen M, . . . Mi M. Healthy Subjects Differentially Respond to Dietary Capsaicin Correlating with Specific Gut Enterotypes. The Journal of clinical endocrinology and metabolism. Dec 2016;101(12):4681-4689.
  216. Kang DW, Adams JB, Gregory AC, Borody T, Chittick L, Fasano A, . . . Krajmalnik-Brown R. Microbiota Transfer Therapy alters gut ecosystem and improves gastrointestinal and autism symptoms: an open-label study. Microbiome. Jan 23 2017;5(1):10.
  217. Kao D, Roach B, Silva M, Beck P, Rioux K, Kaplan GG, . . . Louie T. Effect of Oral Capsule- vs Colonoscopy-Delivered Fecal Microbiota Transplantation on Recurrent Clostridium difficile Infection: A Randomized Clinical Trial. JAMA. Nov 28 2017;318(20):1985-1993.
  218. Kato S. Role of serotonin 5-HT(3) receptors in intestinal inflammation. Biological & pharmaceutical bulletin. 2013;36(9):1406-1409.
  219. Kau AL, Ahern PP, Griffin NW, Goodman AL, Gordon JI. Human nutrition, the gut microbiome and the immune system. Nature. Jun 15 2011;474(7351):327-336.
  220. Kawarai T, Furukawa S, Ogihara H, Yamasaki M. Mixed-species biofilm formation by lactic acid bacteria and rice wine yeasts. Appl Environ Microbiol. Jul 2007;73(14):4673-4676.
  221. Keen EC. A century of phage research: bacteriophages and the shaping of modern biology. BioEssays: news and reviews in molecular, cellular and developmental biology. Jan 2015;37(1):6-9.
  222. Kelesidis T, Pothoulakis C. Efficacy and safety of the probiotic Saccharomyces boulardii for the prevention and therapy of gastrointestinal disorders. Therapeutic advances in gastroenterology. Mar 2012;5(2):111-125.
  223. Kelly G. Inulin-type prebiotics--a review: part 1. Alternative medicine review: a journal of clinical therapeutic. Dec 2008;13(4):315-329.
  224. Khalighi A, Behdani R, Kouhestani S. Probiotics: A Comprehensive Review of Their Classification, Mode of Action and Role in Human Nutrition. In: Rao V, Rao LG, eds. Probiotics and Prebiotics in Human Nutrition and Health. Rijeka: InTech; 2016:Ch. 02.
  225. Khanna S, Pardi DS. Clostridium difficile infection: new insights into management. Mayo Clinic proceedings. Nov 2012;87(11):1106-1117.
  226. Kim HJ, Kim HY, Lee SY, Seo JH, Lee E, Hong SJ. Clinical efficacy and mechanism of probiotics in allergic diseases. Korean journal of pediatrics. Sep 2013;56(9):369-376.
  227. Kim KM, Lim J, Lee JJ, Hurh BS, Lee I. Characterization of Aspergillus sojae Isolated from Meju, Korean Traditional Fermented Soybean Brick. Journal of microbiology and biotechnology. Feb 28 2017;27(2):251-261.
  228. Kim SO, Ah YM, Yu YM, Choi KH, Shin WG, Lee JY. Effects of probiotics for the treatment of atopic dermatitis: a meta-analysis of randomized controlled trials. Ann Allergy Asthma Immunol. Aug 2014;113(2):217-226.
  229. Kirjavainen PV, Pautler S, Baroja ML, Anukam K, Crowley K, Carter K, Reid G. Abnormal immunological profile and vaginal microbiota in women prone to urinary tract infections. Clinical and vaccine immunology: CVI. Jan 2009;16(1):29-36.
  230. Kitamoto K. Cell biology of the Koji mold Aspergillus oryzae. Bioscience, biotechnology, and biochemistry. 2015;79(6):863-869.
  231. Knaus UG, Hertzberger R, Pircalabioru GG, Yousefi SP, Branco Dos Santos F. Pathogen control at the intestinal mucosa - H2O2 to the rescue. Gut Microbes. Jan 2 2017;8(1):67-74.
  232. Knight R, Callewaert C, Marotz C, Hyde ER, Debelius JW, McDonald D, Sogin ML. The Microbiome and Human Biology. Annual review of genomics and human genetics. Aug 31 2017;18:65-86.
  233. Kober MM, Bowe WP. The effect of probiotics on immune regulation, acne, and photoaging. International journal of women's dermatology. Jun 2015;1(2):85-89.
  234. Koboziev I, Reinoso Webb C, Furr KL, Grisham MB. Role of the enteric microbiota in intestinal homeostasis and inflammation. Free radical biology & medicine. Mar 2014;68:122-133.
  235. Kohler GA, Assefa S, Reid G. Probiotic interference of Lactobacillus rhamnosus GR-1 and Lactobacillus reuteri RC-14 with the opportunistic fungal pathogen Candida albicans. Infectious diseases in obstetrics and gynecology. 2012;2012:636474.
  236. Kolokotroni O, Middleton N, Gavatha M, Lamnisos D, Priftis KN, Yiallouros PK. Asthma and atopy in children born by caesarean section: effect modification by family history of allergies - a population based cross-sectional study. BMC Pediatr. Nov 16 2012;12:179.
  237. Kondo J, Xiao JZ, Shirahata A, Baba M, Abe A, Ogawa K, Shimoda T. Modulatory effects of Bifidobacterium longum BB536 on defecation in elderly patients receiving enteral feeding. World journal of gastroenterology: WJG. 2013;19(14):2162-2170.
  238. Konturek PC, Sliwowski Z, Koziel J, Ptak-Belowska A, Burnat G, Brzozowski T, Konturek SJ. Probiotic bacteria Escherichia coli strain Nissle 1917 attenuates acute gastric lesions induced by stress. Journal of physiology and pharmacology: an official journal of the Polish Physiological Society. Dec 2009;60 Suppl 6:41-48.
  239. Korpela K, Salonen A, Virta LJ, Kekkonen RA, de Vos WM. Association of Early-Life Antibiotic Use and Protective Effects of Breastfeeding: Role of the Intestinal Microbiota. JAMA pediatrics. Aug 1 2016;170(8):750-757.
  240. Kovachev SM, Vatcheva-Dobrevska RS. Local Probiotic Therapy for Vaginal Candida albicans Infections. Probiotics and antimicrobial proteins. Mar 2015;7(1):38-44.
  241. Krajmalnik-Brown R, Ilhan ZE, Kang DW, DiBaise JK. Effects of gut microbes on nutrient absorption and energy regulation. Nutrition in clinical practice: official publication of the American Society for Parenteral and Enteral Nutrition. Apr 2012;27(2):201-214.
  242. Krasse P, Carlsson B, Dahl C, Paulsson A, Nilsson A, Sinkiewicz G. Decreased gum bleeding and reduced gingivitis by the probiotic Lactobacillus reuteri. Swedish dental journal. 2006;30(2):55-60.
  243. Krogerus K, Magalhaes F, Vidgren V, Gibson B. Novel brewing yeast hybrids: creation and application. Appl Microbiol Biotechnol. Jan 2017;101(1):65-78.
  244. Kruis W, Fric P, Pokrotnieks J, Lukas M, Fixa B, Kascak M, . . . Schulze J. Maintaining remission of ulcerative colitis with the probiotic Escherichia coli Nissle 1917 is as effective as with standard mesalazine. Gut. Nov 2004;53(11):1617-1623.
  245. Kruis W, Schutz E, Fric P, Fixa B, Judmaier G, Stolte M. Double-blind comparison of an oral Escherichia coli preparation and mesalazine in maintaining remission of ulcerative colitis. Alimentary pharmacology & therapeutics. Oct 1997;11(5):853-858.
  246. Kulinich A, Liu L. Human milk oligosaccharides: The role in the fine-tuning of innate immune responses. Carbohydrate research. Sep 2 2016;432:62-70.
  247. Kumar N, Behera B, Sagiri SS, Pal K, Ray SS, Roy S. Bacterial vaginosis: Etiology and modalities of treatment-A brief note. Journal of pharmacy & bioallied sciences. Oct 2011;3(4):496-503.
  248. Kumar S, Madurantakam P. Limited evidence shows short-term benefit of probiotics when used as an adjunct to scaling and root planing in the treatment of chronic periodontitis. Evidence-based dentistry. Dec 22 2017;18(4):109-110.
  249. Kusters JG, van Vliet AH, Kuipers EJ. Pathogenesis of Helicobacter pylori infection. Clinical microbiology reviews. Jul 2006;19(3):449-490.
  250. Laich F, Fierro F, Martin JF. Production of penicillin by fungi growing on food products: identification of a complete penicillin gene cluster in Penicillium griseofulvum and a truncated cluster in Penicillium verrucosum. Appl Environ Microbiol. Mar 2002;68(3):1211-1219.
  251. Lalanza JF, Sanchez-Roige S, Cigarroa I, Gagliano H, Fuentes S, Armario A, . . . Escorihuela RM. Long-term moderate treadmill exercise promotes stress-coping strategies in male and female rats. Sci Rep. Nov 5 2015;5:16166.
  252. Lamuel-Raventos RM, Onge MS. Prebiotic nut compounds and human microbiota. Critical reviews in food science and nutrition. Sep 22 2017;57(14):3154-3163.
  253. Lane ER, Zisman TL, Suskind DL. The microbiota in inflammatory bowel disease: current and therapeutic insights. J Inflamm Res. 2017;10:63-73.
  254. Langkamp-Henken B, Rowe CC, Ford AL, Christman MC, Nieves C, Jr., Khouri L, . . . Dahl WJ. Bifidobacterium bifidum R0071 results in a greater proportion of healthy days and a lower percentage of academically stressed students reporting a day of cold/flu: a randomised, double-blind, placebo-controlled study. The British journal of nutrition. Feb 14 2015;113(3):426-434.
  255. Lau CS, Chamberlain RS. Probiotics are effective at preventing Clostridium difficile-associated diarrhea: a systematic review and meta-analysis. International journal of general medicine. 2016;9:27-37.
  256. Lau CS, Ward A, Chamberlain RS. Probiotics improve the efficacy of standard triple therapy in the eradication of Helicobacter pylori: a meta-analysis. Infection and drug resistance. 2016;9:275-289.
  257. Lau K, Srivatsav V, Rizwan A, Nashed A, Liu R, Shen R, Akhtar M. Bridging the Gap between Gut Microbial Dysbiosis and Cardiovascular Diseases. Nutrients. Aug 10 2017;9(8).
  258. Laue C, Papazova E, Liesegang A, Pannenbeckers A, Arendarski P, Linnerth B, . . . Schrezenmeir J. Effect of a yoghurt drink containing Lactobacillus strains on bacterial vaginosis in women - a double-blind, randomised, controlled clinical pilot trial. Benef Microbes. Jan 29 2018;9(1):35-50.
  259. Leclercq S, Matamoros S, Cani PD, Neyrinck AM, Jamar F, Starkel P, . . . Delzenne NM. Intestinal permeability, gut-bacterial dysbiosis, and behavioral markers of alcohol-dependence severity. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct 21 2014;111(42):E4485-4493.
  260. Ledoux D, Labombardi VJ, Karter D. Lactobacillus acidophilus bacteraemia after use of a probiotic in a patient with AIDS and Hodgkin's disease. International journal of STD & AIDS. Apr 2006;17(4):280-282.
  261. Lefeber T, Janssens M, Moens F, Gobert W, De Vuyst L. Interesting starter culture strains for controlled cocoa bean fermentation revealed by simulated cocoa pulp fermentations of cocoa-specific lactic acid bacteria. Appl Environ Microbiol. Sep 2011;77(18):6694-6698.
  262. Lefevre M, Racedo SM, Denayrolles M, Ripert G, Desfougeres T, Lobach AR, . . . Urdaci MC. Safety assessment of Bacillus subtilis CU1 for use as a probiotic in humans. Regulatory toxicology and pharmacology: RTP. Feb 2017;83:54-65.
  263. Lefevre M, Racedo SM, Ripert G, Housez B, Cazaubiel M, Maudet C, . . . Urdaci MC. Probiotic strain Bacillus subtilis CU1 stimulates immune system of elderly during common infectious disease period: a randomized, double-blind placebo-controlled study. Immunity & ageing: I & A. 2015;12:24.
  264. Lemas DJ, Yee S, Cacho N, Miller D, Cardel M, Gurka M, . . . Shenkman E. Exploring the contribution of maternal antibiotics and breastfeeding to development of the infant microbiome and pediatric obesity. Seminars in fetal & neonatal medicine. Dec 2016;21(6):406-409.
  265. Leone V, Gibbons SM, Martinez K, Hutchison AL, Huang EY, Cham CM, . . . Chang EB. Effects of diurnal variation of gut microbes and high-fat feeding on host circadian clock function and metabolism. Cell host & microbe. May 13 2015;17(5):681-689.
  266. Lepargneur JP. Lactobacillus crispatus as biomarker of the healthy vaginal tract. Ann Biol Clin (Paris). Aug 1 2016;74(4):421-427.
  267. Lessa FC, Gould CV, McDonald LC. Current status of Clostridium difficile infection epidemiology. Clin Infect Dis. Aug 2012;55 Suppl 2:S65-70.
  268. Lessa FC, Mu Y, Bamberg WM, Beldavs ZG, Dumyati GK, Dunn JR, . . . McDonald LC. Burden of Clostridium difficile Infection in the United States. New England Journal of Medicine. 2015;372(9):825-834.
  269. Lew LC, Liong MT. Bioactives from probiotics for dermal health: functions and benefits. J Appl Microbiol. May 2013;114(5):1241-1253.
  270. Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI. Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity. Nature. Dec 21 2006;444(7122):1022-1023.
  271. Lherm T, Monet C, Nougiere B, Soulier M, Larbi D, Le Gall C, . . . Malbrunot C. Seven cases of fungemia with Saccharomyces boulardii in critically ill patients. Intensive care medicine. Jun 2002;28(6):797-801.
  272. Li DK, Chen H, Ferber J, Odouli R. Infection and antibiotic use in infancy and risk of childhood obesity: a longitudinal birth cohort study. The lancet. Diabetes & endocrinology. Jan 2017;5(1):18-25.
  273. Lin DM, Koskella B, Lin HC. Phage therapy: An alternative to antibiotics in the age of multi-drug resistance. World J Gastrointest Pharmacol Ther. Aug 6 2017;8(3):162-173.
  274. Lin X, Chen X, Tu Y, Wang S, Chen H. Effect of Probiotic Lactobacilli on the Growth of Streptococcus Mutans and Multispecies Biofilms Isolated from Children with Active Caries. Med Sci Monit. Aug 30 2017;23:4175-4181.
  275. Lippert K, Kedenko L, Antonielli L, Kedenko I, Gemeier C, Leitner M, . . . Hackl E. Gut microbiota dysbiosis associated with glucose metabolism disorders and the metabolic syndrome in older adults. Benef Microbes. Aug 24 2017;8(4):545-556.
  276. Liu J, Chen FH, Qiu SQ, Yang LT, Zhang HP, Liu JQ, . . . Yang PC. Probiotics enhance the effect of allergy immunotherapy on regulating antigen specific B cell activity in asthma patients. Am J Transl Res. 2016;8(12):5256-5270.
  277. Liubakka A, Vaughn BP. Clostridium difficile Infection and Fecal Microbiota Transplant. AACN advanced critical care. Jul 2016;27(3):324-337.
  278. Lloyd-Price J, Abu-Ali G, Huttenhower C. The healthy human microbiome. Genome medicine. Apr 27 2016;8(1):51.
  279. Lombardo L, Foti M, Ruggia O, Chiecchio A. Increased incidence of small intestinal bacterial overgrowth during proton pump inhibitor therapy. Clinical gastroenterology and hepatology: the official clinical practice journal of the American Gastroenterological Association. Jun 2010;8(6):504-508.
  280. Londono-Hernandez L, Ramirez-Toro C, Ruiz HA, Ascacio-Valdes JA, Aguilar-Gonzalez MA, Rodriguez-Herrera R, Aguilar CN. Rhizopus oryzae - Ancient microbial resource with importance in modern food industry. International journal of food microbiology. Sep 18 2017;257:110-127.
  281. Lopes EG, Moreira DA, Gullon P, Gullon B, Cardelle-Cobas A, Tavaria FK. Topical application of probiotics in skin: adhesion, antimicrobial and antibiofilm in vitro assays. J Appl Microbiol. Feb 2017;122(2):450-461.
  282. Lozupone CA, Stombaugh JI, Gordon JI, Jansson JK, Knight R. Diversity, stability and resilience of the human gut microbiota. Nature. Sep 13 2012;489(7415):220-230.
  283. Lu LJ, Liu J. Human Microbiota and Ophthalmic Disease. Yale J Biol Med. Sep 2016;89(3):325-330.
  284. Lu M, Yu S, Deng J, Yan Q, Yang C, Xia G, Zhou X. Efficacy of Probiotic Supplementation Therapy for Helicobacter pylori Eradication: A Meta-Analysis of Randomized Controlled Trials. PloS one. 2016;11(10):e0163743.
  285. Ma J, Zhou Q, Li H. Gut Microbiota and Nonalcoholic Fatty Liver Disease: Insights on Mechanisms and Therapy. Nutrients. Oct 16 2017;9(10).
  286. Maekawa T, Hajishengallis G. Topical treatment with probiotic Lactobacillus brevis CD2 inhibits experimental periodontal inflammation and bone loss. Journal of periodontal research. Dec 2014;49(6):785-791.
  287. Mai V, Ukhanova M, Reinhard MK, Li M, Sulakvelidze A. Bacteriophage administration significantly reduces Shigella colonization and shedding by Shigella-challenged mice without deleterious side effects and distortions in the gut microbiota. Bacteriophage. Oct-Dec 2015;5(4):e1088124.
  288. Majeed M, Nagabhushanam K, Natarajan S, Sivakumar A, Ali F, Pande A, . . . Karri SK. Bacillus coagulans MTCC 5856 supplementation in the management of diarrhea predominant Irritable Bowel Syndrome: a double blind randomized placebo controlled pilot clinical study. Nutr J. Feb 27 2016;15:21.
  289. Makinen KK. Sugar alcohols, caries incidence, and remineralization of caries lesions: a literature review. International journal of dentistry. 2010;2010:981072.
  290. Mamlouk D, Gullo M. Acetic Acid bacteria: physiology and carbon sources oxidation. Indian J Microbiol. Dec 2013;53(4):377-384.
  291. Mansfield JA, Bergin SW, Cooper JR, Olsen CH. Comparative probiotic strain efficacy in the prevention of eczema in infants and children: a systematic review and meta-analysis. Military medicine. Jun 2014;179(6):580-592.
  292. Marasco G, Di Biase AR, Schiumerini R, Eusebi LH, Iughetti L, Ravaioli F, . . . Festi D. Gut Microbiota and Celiac Disease. Digestive diseases and sciences. Jun 2016;61(6):1461-1472.
  293. Marchisio P, Santagati M, Scillato M, Baggi E, Fattizzo M, Rosazza C, . . . Principi N. Streptococcus salivarius 24SMB administered by nasal spray for the prevention of acute otitis media in otitis-prone children. European journal of clinical microbiology & infectious diseases: official publication of the European Society of Clinical Microbiology. Dec 2015;34(12):2377-2383.
  294. Marongiu A, Zara G, Legras JL, Del Caro A, Mascia I, Fadda C, Budroni M. Novel starters for old processes: use of Saccharomyces cerevisiae strains isolated from artisanal sourdough for craft beer production at a brewery scale. Journal of industrial microbiology & biotechnology. Jan 2015;42(1):85-92.
  295. Marotz CA, Zarrinpar A. Treating Obesity and Metabolic Syndrome with Fecal Microbiota Transplantation. Yale J Biol Med. Sep 2016;89(3):383-388.
  296. Marranzino G, Villena J, Salva S, Alvarez S. Stimulation of macrophages by immunobiotic Lactobacillus strains: influence beyond the intestinal tract. Microbiology and immunology. Nov 2012;56(11):771-781.
  297. Marrs T, Flohr C. The role of skin and gut microbiota in the development of atopic eczema. Br J Dermatol. Oct 2016;175 Suppl 2:13-18.
  298. Martin-Cabezas R, Davideau JL, Tenenbaum H, Huck O. Clinical efficacy of probiotics as an adjunctive therapy to non-surgical periodontal treatment of chronic periodontitis: a systematic review and meta-analysis. J Clin Periodontol. Jun 2016;43(6):520-530.
  299. Martin CR, Ling PR, Blackburn GL. Review of Infant Feeding: Key Features of Breast Milk and Infant Formula. Nutrients. May 11 2016;8(5).
  300. Martin DH. The microbiota of the vagina and its influence on women's health and disease. The American journal of the medical sciences. Jan 2012;343(1):2-9.
  301. Martinez-Martinez MI, Calabuig-Tolsa R, Cauli O. The effect of probiotics as a treatment for constipation in elderly people: A systematic review. Arch Gerontol Geriatr. Jul 2017;71:142-149.
  302. Martinez RC, Franceschini SA, Patta MC, Quintana SM, Candido RC, Ferreira JC, . . . Reid G. Improved treatment of vulvovaginal candidiasis with fluconazole plus probiotic Lactobacillus rhamnosus GR-1 and Lactobacillus reuteri RC-14. Lett Appl Microbiol. Mar 2009;48(3):269-274.
  303. Mascellino MT, Porowska B, De Angelis M, Oliva A. Antibiotic susceptibility, heteroresistance, and updated treatment strategies in Helicobacter pylori infection. Drug design, development and therapy. 2017;11:2209-2220.
  304. Matijasic M, Mestrovic T, Peric M, Cipcic Paljetak H, Panek M, Vranesic Bender D, . . . Verbanac D. Modulating Composition and Metabolic Activity of the Gut Microbiota in IBD Patients. International journal of molecular sciences. Apr 19 2016;17(4).
  305. Mawe GM, Hoffman JM. Serotonin signalling in the gut--functions, dysfunctions and therapeutic targets. Nature reviews. Gastroenterology & hepatology. Aug 2013;10(8):473-486.
  306. Mayanagi G, Kimura M, Nakaya S, Hirata H, Sakamoto M, Benno Y, Shimauchi H. Probiotic effects of orally administered Lactobacillus salivarius WB21-containing tablets on periodontopathic bacteria: a double-blinded, placebo-controlled, randomized clinical trial. J Clin Periodontol. Jun 2009;36(6):506-513.
  307. Mayer EA, Knight R, Mazmanian SK, Cryan JF, Tillisch K. Gut microbes and the brain: paradigm shift in neuroscience. The Journal of neuroscience: the official journal of the Society for Neuroscience. Nov 12 2014;34(46):15490-15496.
  308. Mayer EA, Tillisch K, Gupta A. Gut/brain axis and the microbiota. The Journal of clinical investigation. Mar 2 2015;125(3):926-938.
  309. Mayo B, van Sinderen D, Ventura M. Genome analysis of food grade lactic Acid-producing bacteria: from basics to applications. Current genomics. May 2008;9(3):169-183.
  310. Mayor S. Genome sequence of one individual is published for first time. BMJ (Clinical research ed.). Sep 15 2007;335(7619):530-531.
  311. Mayo Clinic. Diseases and Conditions: Gastritis. https://www.mayoclinic.org/diseases-conditions/gastritis/symptoms-causes/syc-20355807. Last updated 05/18/2017a. Accessed 01/23/2018.
  312. Mayo Clinic. Diseases and Conditions: Peptic Ulcer. https://www.mayoclinic.org/diseases-conditions/peptic-ulcer/symptoms-causes/syc-20354223. Last updated 08/12/2017b. Accessed 01/23/2018.
  313. Maziade PJ, Pereira P, Goldstein EJ. A Decade of Experience in Primary Prevention of Clostridium difficile Infection at a Community Hospital Using the Probiotic Combination Lactobacillus acidophilus CL1285, Lactobacillus casei LBC80R, and Lactobacillus rhamnosus CLR2 (Bio-K+). Clin Infect Dis. May 15 2015;60 Suppl 2:S144-147.
  314. McCarville JL, Caminero A, Verdu EF. Novel perspectives on therapeutic modulation of the gut microbiota. Therapeutic advances in gastroenterology. Jul 2016;9(4):580-593.
  315. McFarland LV, Huang Y, Wang L, Malfertheiner P. Systematic review and meta-analysis: Multi-strain probiotics as adjunct therapy for Helicobacter pylori eradication and prevention of adverse events. United European Gastroenterol J. Aug 2016;4(4):546-561.
  316. McGarrah RW, Slentz CA, Kraus WE. The Effect of Vigorous- Versus Moderate-Intensity Aerobic Exercise on Insulin Action. Current cardiology reports. Dec 2016;18(12):117.
  317. Meng H, Lee Y, Ba Z, Peng J, Lin J, Boyer AS, . . . Rogers CJ. Consumption of Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12 impacts upper respiratory tract infection and the function of NK and T cells in healthy adults. Molecular nutrition & food research. May 2016;60(5):1161-1171.
  318. Menni C, Zierer J, Pallister T, Jackson MA, Long T, Mohney RP, . . . Valdes AM. Omega-3 fatty acids correlate with gut microbiome diversity and production of N-carbamylglutamate in middle aged and elderly women. Sci Rep. Sep 11 2017;7(1):11079.
  319. Messaoudi M, Lalonde R, Violle N, Javelot H, Desor D, Nejdi A, . . . Cazaubiel JM. Assessment of psychotropic-like properties of a probiotic formulation (Lactobacillus helveticus R0052 and Bifidobacterium longum R0175) in rats and human subjects. The British journal of nutrition. Mar 2011;105(5):755-764.
  320. Messaoudi M, Violle N, Bisson JF, Desor D, Javelot H, Rougeot C. Beneficial psychological effects of a probiotic formulation (Lactobacillus helveticus R0052 and Bifidobacterium longum R0175) in healthy human volunteers. Gut microbes. Jul-Aug 2011;2(4):256-261.
  321. Meuric V, Le Gall-David S, Boyer E, Acuna-Amador L, Martin B, Fong SB, . . . Bonnaure-Mallet M. Signature of Microbial Dysbiosis in Periodontitis. Appl Environ Microbiol. Jul 15 2017;83(14).
  322. Miller LE, Ouwehand AC. Probiotic supplementation decreases intestinal transit time: meta-analysis of randomized controlled trials. World journal of gastroenterology: WJG. Aug 7 2013;19(29):4718-4725.
  323. Miller LE, Zimmermann AK, Ouwehand AC. Contemporary meta-analysis of short-term probiotic consumption on gastrointestinal transit. World journal of gastroenterology: WJG. Jun 7 2016;22(21):5122-5131.
  324. Miraglia Del Giudice M, Indolfi C, Capasso M, Maiello N, Decimo F, Ciprandi G. Bifidobacterium mixture (B longum BB536, B infantis M-63, B breve M-16V) treatment in children with seasonal allergic rhinitis and intermittent asthma. Italian journal of pediatrics. Mar 7 2017;43(1):25.
  325. Mirzaei MK, Maurice CF. Menage a trois in the human gut: interactions between host, bacteria and phages. Nature reviews. Microbiology. Jul 2017;15(7):397-408.
  326. Mitra A, MacIntyre DA, Marchesi JR, Lee YS, Bennett PR, Kyrgiou M. The vaginal microbiota, human papillomavirus infection and cervical intraepithelial neoplasia: what do we know and where are we going next? Microbiome. Nov 1 2016;4(1):58.
  327. Monda V, Villano I, Messina A, Valenzano A, Esposito T, Moscatelli F, . . . Messina G. Exercise Modifies the Gut Microbiota with Positive Health Effects. Oxidative medicine and cellular longevity. 2017;2017:3831972.
  328. Montemurno E, Cosola C, Dalfino G, Daidone G, De Angelis M, Gobbetti M, Gesualdo L. What Would You Like to Eat, Mr CKD Microbiota? A Mediterranean Diet, please! Kidney & blood pressure research. Jul 29 2014;39(2-3):114-123.
  329. Moon Y. Microbiome-Linked Crosstalk in the Gastrointestinal Exposome towards Host Health and Disease. Pediatric gastroenterology, hepatology & nutrition. Dec 2016;19(4):221-228.
  330. Mor A, Antonsen S, Kahlert J, Holsteen V, Jorgensen S, Holm-Pedersen J, . . . Ehrenstein V. Prenatal exposure to systemic antibacterials and overweight and obesity in Danish schoolchildren: a prevalence study. International journal of obesity (2005). Oct 2015;39(10):1450-1455.
  331. Moreno-Navarrete JM, Sabater M, Ortega F, Ricart W, Fernandez-Real JM. Circulating zonulin, a marker of intestinal permeability, is increased in association with obesity-associated insulin resistance. PloS one. 2012;7(5):e37160.
  332. Morowitz MJ, Carlisle EM, Alverdy JC. Contributions of intestinal bacteria to nutrition and metabolism in the critically ill. The Surgical clinics of North America. Aug 2011;91(4):771-785, viii.
  333. Morris G, Berk M, Carvalho AF, Caso JR, Sanz Y, Maes M. The Role of Microbiota and Intestinal Permeability in the Pathophysiology of Autoimmune and Neuroimmune Processes with an Emphasis on Inflammatory Bowel Disease Type 1 Diabetes and Chronic Fatigue Syndrome. Curr Pharm Des. 2016;22(40):6058-6075.
  334. Moya-Perez A, Luczynski P, Renes IB, Wang S, Borre Y, Anthony Ryan C, . . . Cryan JF. Intervention strategies for cesarean section-induced alterations in the microbiota-gut-brain axis. Nutrition reviews. Apr 1 2017;75(4):225-240.
  335. Moyad MA, Robinson LE, Kittelsrud JM, Reeves SG, Weaver SE, Guzman AI, Bubak ME. Immunogenic yeast-based fermentation product reduces allergic rhinitis-induced nasal congestion: a randomized, double-blind, placebo-controlled trial. Advances in therapy. 2009;26(8):795-804.
  336. Mueller NT, Bakacs E, Combellick J, Grigoryan Z, Dominguez-Bello MG. The infant microbiome development: mom matters. Trends in molecular medicine. Feb 2015;21(2):109-117.
  337. Muizzuddin N, Maher W, Sullivan M, Schnittger S, Mammone T. Physiological effect of a probiotic on skin. Journal of cosmetic science. Nov-Dec 2012;63(6):385-395.
  338. Muzny CA, Schwebke JR. Pathogenesis of Bacterial Vaginosis: Discussion of Current Hypotheses. The Journal of infectious diseases. Aug 15 2016;214 Suppl 1:S1-5.
  339. Nagatomo Y, Tang WH. Intersections Between Microbiome and Heart Failure: Revisiting the Gut Hypothesis. J Card Fail. Dec 2015;21(12):973-980.
  340. Nagpal R, Yadav H. Bacterial Translocation from the Gut to the Distant Organs: An Overview. Ann Nutr Metab. 2017;71 Suppl 1:11-16.
  341. Nakae H, Tsuda A, Matsuoka T, Mine T, Koga Y. Gastric microbiota in the functional dyspepsia patients treated with probiotic yogurt. BMJ open gastroenterology. 2016;3(1):e000109.
  342. Nale JY, Spencer J, Hargreaves KR, Buckley AM, Trzepinski P, Douce GR, Clokie MR. Bacteriophage Combinations Significantly Reduce Clostridium difficile Growth In Vitro and Proliferation In Vivo. Antimicrob Agents Chemother. Feb 2016;60(2):968-981.
  343. Namba K, Hatano M, Yaeshima T, Takase M, Suzuki K. Effects of Bifidobacterium longum BB536 administration on influenza infection, influenza vaccine antibody titer, and cell-mediated immunity in the elderly. Bioscience, biotechnology, and biochemistry. 2010;74(5):939-945.
  344. Nayak PA, Nayak UA, Khandelwal V. The effect of xylitol on dental caries and oral flora. Clinical, cosmetic and investigational dentistry. 2014;6:89-94.
  345. Nicklas BJ, Brinkley TE. Exercise training as a treatment for chronic inflammation in the elderly. Exercise and sport sciences reviews. Oct 2009;37(4):165-170.
  346. Nie YF, Hu J, Yan XH. Cross-talk between bile acids and intestinal microbiota in host metabolism and health. Journal of Zhejiang University. Science. B. Jun 2015;16(6):436-446.
  347. Noh K, Kang YR, Nepal MR, Shakya R, Kang MJ, Kang W, . . . Jeong TC. Impact of gut microbiota on drug metabolism: an update for safe and effective use of drugs. Archives of pharmacal research. Dec 2017;40(12):1345-1355.
  348. Nordenstedt H, Graham DY, Kramer JR, Rugge M, Verstovsek G, Fitzgerald S, . . . El-Serag HB. Helicobacter pylori-negative gastritis: prevalence and risk factors. The American journal of gastroenterology. Jan 2013;108(1):65-71.
  349. Notay M, Foolad N, Vaughn AR, Sivamani RK. Probiotics, Prebiotics, and Synbiotics for the Treatment and Prevention of Adult Dermatological Diseases. American journal of clinical dermatology. Dec 2017;18(6):721-732.
  350. O'Callaghan A, van Sinderen D. Bifidobacteria and Their Role as Members of the Human Gut Microbiota. Front Microbiol. 2016;7:925.
  351. O'Dwyer DN, Dickson RP, Moore BB. The Lung Microbiome, Immunity, and the Pathogenesis of Chronic Lung Disease. J Immunol. Jun 15 2016;196(12):4839-4847.
  352. Ofosu A. Clostridium difficile infection: a review of current and emerging therapies. Annals of Gastroenterology: Quarterly Publication of the Hellenic Society of Gastroenterology. Apr-Jun 2016;29(2):147-154.
  353. Oh J, Byrd AL, Park M, Kong HH, Segre JA. Temporal Stability of the Human Skin Microbiome. Cell. May 5 2016;165(4):854-866.
  354. Ohlsson B, Orho-Melander M, Nilsson PM. Higher Levels of Serum Zonulin May Rather Be Associated with Increased Risk of Obesity and Hyperlipidemia, Than with Gastrointestinal Symptoms or Disease Manifestations. International journal of molecular sciences. Mar 8 2017;18(3).
  355. Ohman L, Simren M. Pathogenesis of IBS: role of inflammation, immunity and neuroimmune interactions. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. Mar 2010;7(3):163-173.
  356. Ohtsu T, Takagi A, Uemura N, Inoue K, Sekino H, Kawashima A, . . . Koga Y. The Ameliorating Effect of Lactobacillus gasseri OLL2716 on Functional Dyspepsia in Helicobacter pylori-Uninfected Individuals: A Randomized Controlled Study. Digestion. 2017;96(2):92-102.
  357. Ojima M, Motooka D, Shimizu K, Gotoh K, Shintani A, Yoshiya K, . . . Shimazu T. Metagenomic Analysis Reveals Dynamic Changes of Whole Gut Microbiota in the Acute Phase of Intensive Care Unit Patients. Digestive diseases and sciences. Jun 2016;61(6):1628-1634.
  358. Oliveira LF, Salvador SL, Silva PH, Furlaneto FA, Figueiredo L, Casarin R, . . . Messora MR. Benefits of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Probiotic in Experimental Periodontitis. J Periodontol. Feb 2017;88(2):197-208.
  359. Ouwehand AC. A review of dose-responses of probiotics in human studies. Benef Microbes. Apr 26 2017;8(2):143-151. Ozdal T, Sela DA, Xiao J, Boyacioglu D, Chen F, Capanoglu E. The Reciprocal Interactions between Polyphenols and Gut Microbiota and Effects on Bioaccessibility. Nutrients. Feb 6 2016;8(2):78.
  360. Paiva SA, Sepe TE, Booth SL, Camilo ME, O'Brien ME, Davidson KW, . . . Russell RM. Interaction between vitamin K nutriture and bacterial overgrowth in hypochlorhydria induced by omeprazole. The American journal of clinical nutrition. Sep 1998;68(3):699-704.
  361. Palacios S, Espadaler J, Fernandez-Moya JM, Prieto C, Salas N. Is it possible to prevent recurrent vulvovaginitis? The role of Lactobacillus plantarum I1001 (CECT7504). European journal of clinical microbiology & infectious diseases: official publication of the European Society of Clinical Microbiology. Oct 2016;35(10):1701-1708.
  362. Palma E, Recine N, Domenici L, Giorgini M, Pierangeli A, Panici PB. Long-term Lactobacillus rhamnosus BMX 54 application to restore a balanced vaginal ecosystem: a promising solution against HPV-infection. BMC infectious diseases. Jan 5 2018;18(1):13.
  363. Palumbo VD, Romeo M, Marino Gammazza A, Carini F, Damiani P, Damiano G, . . . Tomasello G. The long-term effects of probiotics in the therapy of ulcerative colitis: A clinical study. Biomedical papers of the Medical Faculty of the University Palacky, Olomouc, Czechoslovakia. Sep 2016;160(3):372-377.
  364. Pamer EG. Resurrecting the intestinal microbiota to combat antibiotic-resistant pathogens. Science (New York, N.Y.). Apr 29 2016;352(6285):535-538.
  365. Parekh PJ, Oldfield ECt, Johnson DA. The Effects of Sleep on the Commensal Microbiota: Eyes Wide Open? Journal of clinical gastroenterology. Mar 2018;52(3):204-209.
  366. Parma M, Stella Vanni V, Bertini M, Candiani M. Probiotics in the prevention of recurrences of bacterial vaginosis. Altern Ther Health Med. Winter 2014;20 Suppl 1:52-57.
  367. Paulino LC. New perspectives on dandruff and seborrheic dermatitis: lessons we learned from bacterial and fungal skin microbiota. European journal of dermatology : EJD. Jun 1 2017;27(S1):4-7.
  368. Pelucchi C, Chatenoud L, Turati F, Galeone C, Moja L, Bach JF, La Vecchia C. Probiotics supplementation during pregnancy or infancy for the prevention of atopic dermatitis: a meta-analysis. Epidemiology (Cambridge, Mass.). May 2012;23(3):402-414.
  369. Perapoch J, Planes AM, Querol A, Lopez V, Martinez-Bendayan I, Tormo R, . . . Salcedo S. Fungemia with Saccharomyces cerevisiae in two newborns, only one of whom had been treated with ultra-levura. European journal of clinical microbiology & infectious diseases: official publication of the European Society of Clinical Microbiology. Jun 2000;19(6):468-470.
  370. Petersen AM, Mirsepasi H, Halkjaer SI, Mortensen EM, Nordgaard-Lassen I, Krogfelt KA. Ciprofloxacin and probiotic Escherichia coli Nissle add-on treatment in active ulcerative colitis: a double-blind randomized placebo controlled clinical trial. Journal of Crohn's & colitis. Nov 2014;8(11):1498-1505.
  371. Petersen LM, Bautista EJ, Nguyen H, Hanson BM, Chen L, Lek SH, . . . Weinstock GM. Community characteristics of the gut microbiomes of competitive cyclists. Microbiome. Aug 10 2017;5(1):98.
  372. Peterson J, Garges S, Giovanni M, McInnes P, Wang L, Schloss JA, . . . Guyer M. The NIH Human Microbiome Project. Genome Res. Dec 2009;19(12):2317-2323.
  373. Pichon M, Lina B, Josset L. Impact of the Respiratory Microbiome on Host Responses to Respiratory Viral Infection. Vaccines. Nov 3 2017;5(4).
  374. Plein K, Hotz J. Therapeutic effects of Saccharomyces boulardii on mild residual symptoms in a stable phase of Crohn's disease with special respect to chronic diarrhea--a pilot study. Z Gastroenterol. Feb 1993;31(2):129-134.
  375. Pokusaeva K, Fitzgerald GF, van Sinderen D. Carbohydrate metabolism in Bifidobacteria. Genes & Nutrition. Aug 2011;6(3):285-306.
  376. Ponziani FR, Gerardi V, Gasbarrini A. Diagnosis and treatment of small intestinal bacterial overgrowth. Expert review of gastroenterology & hepatology. 2016;10(2):215-227.
  377. Poroyko VA, Carreras A, Khalyfa A, Khalyfa AA, Leone V, Peris E, . . . Gozal D. Chronic Sleep Disruption Alters Gut Microbiota, Induces Systemic and Adipose Tissue Inflammation and Insulin Resistance in Mice. Sci Rep. Oct 14 2016;6:35405.
  378. Potgieter M, Bester J, Kell DB, Pretorius E. The dormant blood microbiome in chronic, inflammatory diseases. FEMS Microbiol Rev. Jul 2015;39(4):567-591.
  379. Pregliasco F, Anselmi G, Fonte L, Giussani F, Schieppati S, Soletti L. A new chance of preventing winter diseases by the administration of synbiotic formulations. Journal of clinical gastroenterology. Sep 2008;42 Suppl 3 Pt 2:S224-233.
  380. Prescott SL, Larcombe DL, Logan AC, West C, Burks W, Caraballo L, . . . Campbell DE. The skin microbiome: impact of modern environments on skin ecology, barrier integrity, and systemic immune programming. The World Allergy Organization journal. 2017;10(1):29.
  381. Proctor DM, Relman DA. The Landscape Ecology and Microbiota of the Human Nose, Mouth, and Throat. Cell Host Microbe. Apr 12 2017;21(4):421-432.
  382. Pu F, Guo Y, Li M, Zhu H, Wang S, Shen X, . . . He F. Yogurt supplemented with probiotics can protect the healthy elderly from respiratory infections: A randomized controlled open-label trial. Clin Interv Aging. 2017;12:1223-1231.
  383. Quick M. Cochrane Commentary: Probiotics For Prevention of Acute Upper Respiratory Infection. Explore (New York, N.Y.). Sep-Oct 2015;11(5):418-420.
  384. Quigley EMM. The Gut-Brain Axis and the Microbiome: Clues to Pathophysiology and Opportunities for Novel Management Strategies in Irritable Bowel Syndrome (IBS). J Clin Med. Jan 3 2018;7(1).
  385. Ramirez-Perez O, Cruz-Ramon V, Chinchilla-Lopez P, Mendez-Sanchez N. The Role of the Gut Microbiota in Bile Acid Metabolism. Ann Hepatol. Oct 28 2017;16(0):15-20.
  386. Rembacken BJ, Snelling AM, Hawkey PM, Chalmers DM, Axon AT. Non-pathogenic Escherichia coli versus mesalazine for the treatment of ulcerative colitis: a randomised trial. Lancet. Aug 21 1999;354(9179):635-639.
  387. Rena G, Hardie DG, Pearson ER. The mechanisms of action of metformin. Diabetologia. 2017;60(9):1577-1585.
  388. Ridlon JM, Kang DJ, Hylemon PB, Bajaj JS. Bile Acids and the Gut Microbiome. Current opinion in gastroenterology. May 2014;30(3):332-338.
  389. Riley P, Moore D, Ahmed F, Sharif MO, Worthington HV. Xylitol-containing products for preventing dental caries in children and adults. The Cochrane database of systematic reviews. Mar 26 2015(3):Cd010743.
  390. Robson MJ, Quinlan MA, Blakely RD. Immune System Activation and Depression: Roles of Serotonin in the Central Nervous System and Periphery. ACS chemical neuroscience. May 17 2017;8(5):932-942.
  391. Rodriguez JM, Murphy K, Stanton C, Ross RP, Kober OI, Juge N, . . . Collado MC. The composition of the gut microbiota throughout life, with an emphasis on early life. Microb Ecol Health Dis. 2015;26:26050.
  392. Rogers GB, Keating DJ, Young RL, Wong ML, Licinio J, Wesselingh S. From gut dysbiosis to altered brain function and mental illness: mechanisms and pathways. Molecular psychiatry. Jun 2016;21(6):738-748.
  393. Ropars J, Lopez-Villavicencio M, Snirc A, Lacoste S, Giraud T. Blue cheese-making has shaped the population genetic structure of the mould Penicillium roqueforti. PloS one. 2017;12(3):e0171387.
  394. Rosenbaum M, Knight R, Leibel RL. The gut microbiota in human energy homeostasis and obesity. Trends in endocrinology and metabolism: TEM. Sep 2015;26(9):493-501.
  395. Rosier BT, Marsh PD, Mira A. Resilience of the Oral Microbiota in Health: Mechanisms That Prevent Dysbiosis. Journal of dental research. Nov 1 2017:22034517742139.
  396. Roudsari MR, Karimi R, Sohrabvandi S, Mortazavian AM. Health effects of probiotics on the skin. Critical reviews in food science and nutrition. 2015;55(9):1219-1240.
  397. Roux D, van Oort PM, Ricard JD, Bos LDJ. Airway microbiome research: a modern perspective on surveillance cultures? Annals of translational medicine. Nov 2017;5(22):445.
  398. Ruggiero P. Use of probiotics in the fight against Helicobacter pylori. World journal of gastrointestinal pathophysiology. Nov 15 2014;5(4):384-391.
  399. Rutayisire E, Huang K, Liu Y, Tao F. The mode of delivery affects the diversity and colonization pattern of the gut microbiota during the first year of infants' life: a systematic review. BMC Gastroenterol. Jul 30 2016;16(1):86.
  400. Ryan PM, Stanton C, Caplice NM. Bile acids at the cross-roads of gut microbiome-host cardiometabolic interactions. Diabetol Metab Syndr. 2017;9:102.
  401. Sachdev AH, Pimentel M. Gastrointestinal bacterial overgrowth: pathogenesis and clinical significance. Therapeutic advances in chronic disease. Sep 2013;4(5):223-231.
  402. Saini R, Saini S, Sharma S. Potential of probiotics in controlling cardiovascular diseases. Journal of cardiovascular disease research. Oct 2010;1(4):213-214.
  403. Sajedinejad N, Paknejad M, Houshmand B, Sharafi H, Jelodar R, Shahbani Zahiri H, Noghabi KA. Lactobacillus salivarius NK02: a Potent Probiotic for Clinical Application in Mouthwash. Probiotics and antimicrobial proteins. Jun 19 2017.
  404. Salvetti E, Torriani S, Felis GE. The Genus Lactobacillus: A Taxonomic Update. Probiotics and antimicrobial proteins. Dec 2012;4(4):217-226.
  405. Sampson TR, Debelius JW, Thron T, Janssen S, Shastri GG, Ilhan ZE, . . . Mazmanian SK. Gut Microbiota Regulate Motor Deficits and Neuroinflammation in a Model of Parkinson's Disease. Cell. Dec 1 2016;167(6):1469-1480.e1412.
  406. Sanders ME, Akkermans LM, Haller D, Hammerman C, Heimbach J, Hormannsperger G, . . . Vaughan E. Safety assessment of probiotics for human use. Gut Microbes. May-Jun 2010;1(3):164-185.
  407. Sanlier N, Gokcen BB, Sezgin AC. Health benefits of fermented foods. Critical reviews in food science and nutrition. Sep 25 2017:1-22.
  408. SanMiguel A, Grice EA. Interactions between host factors and the skin microbiome. Cellular and molecular life sciences: CMLS. Apr 2015;72(8):1499-1515.
  409. Santagati M, Scillato M, Muscaridola N, Metoldo V, La Mantia I, Stefani S. Colonization, safety, and tolerability study of the Streptococcus salivarius 24SMBc nasal spray for its application in upper respiratory tract infections. European journal of clinical microbiology & infectious diseases: official publication of the European Society of Clinical Microbiology. Oct 2015;34(10):2075-2080.
  410. Sato Y, Nagasaki M, Nakai N, Fushimi T. Physical exercise improves glucose metabolism in lifestyle-related diseases. Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.). Nov 2003;228(10):1208-1212.
  411. Schenck LP, Surette MG, Bowdish DM. Composition and immunological significance of the upper respiratory tract microbiota. FEBS letters. Nov 2016;590(21):3705-3720.
  412. Sedighi M, Razavi S, Navab-Moghadam F, Khamseh ME, Alaei-Shahmiri F, Mehrtash A, Amirmozafari N. Comparison of gut microbiota in adult patients with type 2 diabetes and healthy individuals. Microbial pathogenesis. Oct 2017;111:362-369.
  413. Sender R, Fuchs S, Milo R. Are We Really Vastly Outnumbered? Revisiting the Ratio of Bacterial to Host Cells in Humans. Cell. Jan 28 2016;164(3):337-340.
  414. Senol A, Isler M, Karahan AG, Kilic GB, Kuleasan H, Goren I, . . . Cakmakci LM. Effect of probiotics on aspirin-induced gastric mucosal lesions. The Turkish journal of gastroenterology: the official journal of Turkish Society of Gastroenterology. Feb 2011;22(1):18-26.
  415. Sghir A, Gramet G, Suau A, Rochet V, Pochart P, Dore J. Quantification of bacterial groups within human fecal flora by oligonucleotide probe hybridization. Appl Environ Microbiol. May 2000;66(5):2263-2266.
  416. Sharafedtinov KK, Plotnikova OA, Alexeeva RI, Sentsova TB, Songisepp E, Stsepetova J, . . . Mikelsaar M. Hypocaloric diet supplemented with probiotic cheese improves body mass index and blood pressure indices of obese hypertensive patients--a randomized double-blind placebo-controlled pilot study. Nutr J. Oct 12 2013;12:138.
  417. Sharon G, Garg N, Debelius J, Knight R, Dorrestein PC, Mazmanian SK. Specialized metabolites from the microbiome in health and disease. Cell metabolism. Nov 4 2014;20(5):719-730.
  418. Shen NT, Maw A, Tmanova LL, Pino A, Ancy K, Crawford CV, . . . Evans AT. Timely Use of Probiotics in Hospitalized Adults Prevents Clostridium difficile Infection: A Systematic Review With Meta-Regression Analysis. Gastroenterology. Jun 2017;152(8):1889-1900.e1889.
  419. Shi LH, Balakrishnan K, Thiagarajah K, Mohd Ismail NI, Yin OS. Beneficial Properties of Probiotics. Tropical life sciences research. Aug 2016;27(2):73-90.
  420. Shi Y, Mu L. An expanding stage for commensal microbes in host immune regulation. Cellular & molecular immunology. Apr 2017;14(4):339-348.
  421. Shibata N, Kunisawa J, Kiyono H. Dietary and Microbial Metabolites in the Regulation of Host Immunity. Front Microbiol. 2017;8:2171.
  422. Shida K, Sato T, Iizuka R, Hoshi R, Watanabe O, Igarashi T, . . . Ishikawa F. Daily intake of fermented milk with Lactobacillus casei strain Shirota reduces the incidence and duration of upper respiratory tract infections in healthy middle-aged office workers. Eur J Nutr. Feb 2017;56(1):45-53.
  423. Shimauchi H, Mayanagi G, Nakaya S, Minamibuchi M, Ito Y, Yamaki K, Hirata H. Improvement of periodontal condition by probiotics with Lactobacillus salivarius WB21: a randomized, double-blind, placebo-controlled study. J Clin Periodontol. Oct 2008;35(10):897-905.
  424. Shimizu M, Hashiguchi M, Shiga T, Tamura HO, Mochizuki M. Meta-Analysis: Effects of Probiotic Supplementation on Lipid Profiles in Normal to Mildly Hypercholesterolemic Individuals. PloS one. 2015;10(10):e0139795.
  425. Silva Figueiredo P, Carla Inada A, Marcelino G, Maiara Lopes Cardozo C, de Cassia Freitas K, de Cassia Avellaneda Guimaraes R, . . . Aiko Hiane P. Fatty Acids Consumption: The Role Metabolic Aspects Involved in Obesity and Its Associated Disorders. Nutrients. Oct 22 2017;9(10).
  426. Sinagra E, Morreale GC, Mohammadian G, Fusco G, Guarnotta V, Tomasello G, . . . Raimondo D. New therapeutic perspectives in irritable bowel syndrome: Targeting low-grade inflammation, immuno-neuroendocrine axis, motility, secretion and beyond. World journal of gastroenterology: WJG. Sep 28 2017;23(36):6593-6627.
  427. Singh A, Hacini-Rachinel F, Gosoniu ML, Bourdeau T, Holvoet S, Doucet-Ladeveze R, . . . Nutten S. Immune-modulatory effect of probiotic Bifidobacterium lactis NCC2818 in individuals suffering from seasonal allergic rhinitis to grass pollen: an exploratory, randomized, placebo-controlled clinical trial. European journal of clinical nutrition. Feb 2013;67(2):161-167.
  428. Singh RK, Chang HW, Yan D, Lee KM, Ucmak D, Wong K, . . . Liao W. Influence of diet on the gut microbiome and implications for human health. J Transl Med. Apr 8 2017;15(1):73.
  429. Skovbjerg S, Roos K, Holm SE, Grahn Hakansson E, Nowrouzian F, Ivarsson M, . . . Wold AE. Spray bacteriotherapy decreases middle ear fluid in children with secretory otitis media. Archives of disease in childhood. Feb 2009;94(2):92-98. Slavin J. Fiber and prebiotics: mechanisms and health benefits. Nutrients. Apr 22 2013;5(4):1417-1435.
  430. Slyepchenko A, Maes M, Jacka FN, Kohler CA, Barichello T, McIntyre RS, . . . Carvalho AF. Gut Microbiota, Bacterial Translocation, and Interactions with Diet: Pathophysiological Links between Major Depressive Disorder and Non-Communicable Medical Comorbidities. Psychotherapy and psychosomatics. 2017;86(1):31-46.
  431. Smith TJ, Rigassio-Radler D, Denmark R, Haley T, Touger-Decker R. Effect of Lactobacillus rhamnosus LGG® and Bifidobacterium animalis ssp. lactis BB-12(R) on health-related quality of life in college students affected by upper respiratory infections. The British journal of nutrition. Jun 2013;109(11):1999-2007.
  432. Song SJ, Lauber C, Costello EK, Lozupone CA, Humphrey G, Berg-Lyons D, . . . Knight R. Cohabiting family members share microbiota with one another and with their dogs. Elife. Apr 16 2013;2:e00458.
  433. Sood A, Midha V, Makharia GK, Ahuja V, Singal D, Goswami P, Tandon RK. The probiotic preparation, VSL#3 induces remission in patients with mild-to-moderately active ulcerative colitis. Clinical gastroenterology and hepatology: the official clinical practice journal of the American Gastroenterological Association. Nov 2009;7(11):1202-1209, 1209.e1201.
  434. Soto A, Martín V, Jiménez E, Mader I, Rodríguez JM, Fernández L. Lactobacilli and Bifidobacteria in Human Breast Milk: Influence of Antibiotherapy and Other Host and Clinical Factors. Journal of pediatric gastroenterology and nutrition. Jul 2014;59(1):78-88.
  435. Stadlbauer V. Immunosuppression and probiotics: are they effective and safe? Benef Microbes. 2015;6(6):823-828.
  436. Stahl B, Barrangou R. Complete Genome Sequence of Probiotic Strain Lactobacillus acidophilus La-14. Genome announcements. Jun 20 2013;1(3).
  437. Stanton C, Ross RP, Fitzgerald GF, Van Sinderen D. Fermented functional foods based on probiotics and their biogenic metabolites. Curr Opin Biotechnol. Apr 2005;16(2):198-203.
  438. Stapleton AE, Au-Yeung M, Hooton TM, Fredricks DN, Roberts PL, Czaja CA, . . . Stamm WE. Randomized, placebo-controlled phase 2 trial of a Lactobacillus crispatus probiotic given intravaginally for prevention of recurrent urinary tract infection. Clin Infect Dis. May 2011;52(10):1212-1217.
  439. Staudacher HM, Whelan K. Altered gastrointestinal microbiota in irritable bowel syndrome and its modification by diet: probiotics, prebiotics and the low FODMAP diet. The Proceedings of the Nutrition Society. Aug 2016;75(3):306-318.
  440. Strati F, Cavalieri D, Albanese D, De Felice C, Donati C, Hayek J, . . . De Filippo C. New evidences on the altered gut microbiota in autism spectrum disorders. Microbiome. Feb 22 2017;5(1):24.
  441. Strus M, Chmielarczyk A, Kochan P, Adamski P, Chelmicki Z, Chelmicki A, . . . Heczko PB. Studies on the effects of probiotic Lactobacillus mixture given orally on vaginal and rectal colonization and on parameters of vaginal health in women with intermediate vaginal flora. European journal of obstetrics, gynecology, and reproductive biology. Aug 2012;163(2):210-215.
  442. Suezawa Y, Suzuki M, Mori H. Genotyping of a miso and soy sauce fermentation yeast, Zygosaccharomyces rouxii, based on sequence analysis of the partial 26S ribosomal RNA gene and two internal transcribed spacers. Bioscience, biotechnology, and biochemistry. Sep 2008;72(9):2452-2455.
  443. Surendran Nair M, Amalaradjou MA, Venkitanarayanan K. Antivirulence Properties of Probiotics in Combating Microbial Pathogenesis. Adv Appl Microbiol. 2017;98:1-29.
  444. Swain MR, Anandharaj M, Ray RC, Parveen Rani R. Fermented fruits and vegetables of Asia: a potential source of probiotics. Biotechnology research international. 2014;2014:250424.
  445. Swanson HI. Drug Metabolism by the Host and Gut Microbiota: A Partnership or Rivalry? Drug Metab Dispos. Oct 2015;43(10):1499-1504.
  446. Szafranski SP, Winkel A, Stiesch M. The use of bacteriophages to biocontrol oral biofilms. Journal of biotechnology. May 20 2017;250:29-44.
  447. Szajewska H, Kolodziej M. Systematic review with meta-analysis: Lactobacillus rhamnosus GG in the prevention of antibiotic-associated diarrhoea in children and adults. Alimentary pharmacology & therapeutics. Nov 2015a;42(10):1149-1157.
  448. Szajewska H, Kolodziej M. Systematic review with meta-analysis: Saccharomyces boulardii in the prevention of antibiotic-associated diarrhoea. Alimentary pharmacology & therapeutics. Oct 2015b;42(7):793-801.
  449. Szkaradkiewicz AK, Stopa J, Karpinski TM. Effect of oral administration involving a probiotic strain of Lactobacillus reuteri on pro-inflammatory cytokine response in patients with chronic periodontitis. Arch Immunol Ther Exp (Warsz). Dec 2014;62(6):495-500.
  450. Tamaki H, Nakase H, Inoue S, Kawanami C, Itani T, Ohana M, . . . Shibatouge M. Efficacy of probiotic treatment with Bifidobacterium longum 536 for induction of remission in active ulcerative colitis: A randomized, double-blinded, placebo-controlled multicenter trial. Digestive endoscopy: official journal of the Japan Gastroenterological Endoscopy Society. Jan 2016;28(1):67-74.
  451. Tamang JP, Shin DH, Jung SJ, Chae SW. Functional Properties of Microorganisms in Fermented Foods. Front Microbiol. 2016;7.
  452. Tamang JP, Watanabe K, Holzapfel WH. Review: Diversity of Microorganisms in Global Fermented Foods and Beverages. Front Microbiol. 2016;7:377.
  453. Taoka H, Yokoyama Y, Morimoto K, Kitamura N, Tanigaki T, Takashina Y, . . . Watanabe M. Role of bile acids in the regulation of the metabolic pathways. World J Diabetes. Jul 10 2016;7(13):260-270.
  454. Tasnim N, Abulizi N, Pither J, Hart MM, Gibson DL. Linking the Gut Microbial Ecosystem with the Environment: Does Gut Health Depend on Where We Live? Front Microbiol. 2017;8:1935.
  455. Tekce M, Ince G, Gursoy H, Dirikan Ipci S, Cakar G, Kadir T, Yilmaz S. Clinical and microbiological effects of probiotic lozenges in the treatment of chronic periodontitis: a 1-year follow-up study. J Clin Periodontol. Apr 2015;42(4):363-372.
  456. Teughels W, Durukan A, Ozcelik O, Pauwels M, Quirynen M, Haytac MC. Clinical and microbiological effects of Lactobacillus reuteri probiotics in the treatment of chronic periodontitis: a randomized placebo-controlled study. J Clin Periodontol. Nov 2013;40(11):1025-1035.
  457. Thaiss CA, Zeevi D, Levy M, Zilberman-Schapira G, Suez J, Tengeler AC, . . . Elinav E. Transkingdom control of microbiota diurnal oscillations promotes metabolic homeostasis. Cell. Oct 23 2014;159(3):514-529.
  458. Theilmann MC, Goh YJ, Nielsen KF, Klaenhammer TR, Barrangou R, Abou Hachem M. Lactobacillus acidophilus Metabolizes Dietary Plant Glucosides and Externalizes Their Bioactive Phytochemicals. MBio. Nov 21 2017;8(6).
  459. Thomas-White K, Brady M, Wolfe AJ, Mueller ER. The bladder is not sterile: History and current discoveries on the urinary microbiome. Current bladder dysfunction reports. Mar 2016;11(1):18-24.
  460. Thompson JR. Is irritable bowel syndrome an infectious disease? World journal of gastroenterology: WJG. Jan 28 2016;22(4):1331-1334.
  461. Thursby E, Juge N. Introduction to the human gut microbiota. The Biochemical journal. May 16 2017;474(11):1823-1836.
  462. Ticinesi A, Lauretani F, Milani C, Nouvenne A, Tana C, Del Rio D, . . . Meschi T. Aging Gut Microbiota at the Cross-Road between Nutrition, Physical Frailty, and Sarcopenia: Is There a Gut-Muscle Axis? Nutrients. Nov 30 2017;9(12).
  463. Tiequn B, Guanqun C, Shuo Z. Therapeutic effects of Lactobacillus in treating irritable bowel syndrome: a meta-analysis. Intern Med. 2015;54(3):243-249.
  464. Toiviainen A, Jalasvuori H, Lahti E, Gursoy U, Salminen S, Fontana M, . . . Soderling E. Impact of orally administered lozenges with Lactobacillus rhamnosus GG and Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12 on the number of salivary mutans streptococci, amount of plaque, gingival inflammation and the oral microbiome in healthy adults. Clin Oral Investig. Jan 2015;19(1):77-83.
  465. Tomas-Barberan FA, Selma MV, Espin JC. Interactions of gut microbiota with dietary polyphenols and consequences to human health. Current opinion in clinical nutrition and metabolic care. Nov 2016;19(6):471-476.
  466. Torii S, Torii A, Itoh K, Urisu A, Terada A, Fujisawa T, . . . Fujiwara S. Effects of oral administration of Lactobacillus acidophilus L-92 on the symptoms and serum markers of atopic dermatitis in children. Int Arch Allergy Immunol. 2011;154(3):236-245.
  467. Tosh PK, McDonald LC. Infection Control in the Multidrug-Resistant Era: Tending the Human Microbiome. Clinical Infectious Diseases. 2012;54(5):707-713.
  468. Turnbaugh PJ, Ley RE, Hamady M, Fraser-Liggett CM, Knight R, Gordon JI. The human microbiome project. Nature. Oct 18 2007;449(7164):804-810.
  469. Turnbaugh PJ, Ridaura VK, Faith JJ, Rey FE, Knight R, Gordon JI. The Effect of Diet on the Human Gut Microbiome: A Metagenomic Analysis in Humanized Gnotobiotic Mice. Science translational medicine. 2009;1(6):6ra14-16ra14.
  470. Tursi A, Brandimarte G, Papa A, Giglio A, Elisei W, Giorgetti GM, . . . Gasbarrini A. Treatment of relapsing mild-to-moderate ulcerative colitis with the probiotic VSL#3 as adjunctive to a standard pharmaceutical treatment: a double-blind, randomized, placebo-controlled study. The American journal of gastroenterology. Oct 2010;105(10):2218-2227.
  471. Uehara S, Monden K, Nomoto K, Seno Y, Kariyama R, Kumon H. A pilot study evaluating the safety and effectiveness of Lactobacillus vaginal suppositories in patients with recurrent urinary tract infection. International journal of antimicrobial agents. Aug 2006;28 Suppl 1:S30-34.
  472. Upadrasta A, Madempudi RS. Probiotics and blood pressure: current insights. Integrated blood pressure control. 2016;9:33-42.
  473. Urbaniak C, Burton JP, Reid G. Breast, milk and microbes: a complex relationship that does not end with lactation. Womens Health (Lond). Jul 2012;8(4):385-398.
  474. Urbanska M, Gieruszczak-Bialek D, Szajewska H. Systematic review with meta-analysis: Lactobacillus reuteri DSM 17938 for diarrhoeal diseases in children. Alimentary pharmacology & therapeutics. May 2016;43(10):1025-1034.
  475. Ursell LK, Metcalf JL, Parfrey LW, Knight R. Defining the Human Microbiome. Nutrition reviews. Aug 2012;70(Suppl 1):S38-44.
  476. Vahabnezhad E, Mochon AB, Wozniak LJ, Ziring DA. Lactobacillus bacteremia associated with probiotic use in a pediatric patient with ulcerative colitis. Journal of clinical gastroenterology. May-Jun 2013;47(5):437-439.
  477. van de Wijgert J, Jespers V. The global health impact of vaginal dysbiosis. Res Microbiol. Nov - Dec 2017;168(9-10):859-864.
  478. van der Meulen TA, Harmsen H, Bootsma H, Spijkervet F, Kroese F, Vissink A. The microbiome-systemic diseases connection. Oral diseases. Nov 2016;22(8):719-734.
  479. Vanamala JK, Knight R, Spector TD. Can Your Microbiome Tell You What to Eat? Cell metabolism. Dec 1 2015;22(6):960-961.
  480. Vaneechoutte M. The human vaginal microbial community. Res Microbiol. Nov - Dec 2017;168(9-10):811-825.
  481. Verdenelli MC, Cecchini C, Coman MM, Silvi S, Orpianesi C, Coata G, . . . Di Renzo GC. Impact of Probiotic SYNBIO((R)) Administered by Vaginal Suppositories in Promoting Vaginal Health of Apparently Healthy Women. Curr Microbiol. Oct 2016;73(4):483-490.
  482. Vicariotto F, Mogna L, Del Piano M. Effectiveness of the two microorganisms Lactobacillus fermentum LF15 and Lactobacillus plantarum LP01, formulated in slow-release vaginal tablets, in women affected by bacterial vaginosis: a pilot study. Journal of clinical gastroenterology. Nov-Dec 2014;48 Suppl 1:S106-112.
  483. Vinke PC, El Aidy S, van Dijk G. The Role of Supplemental Complex Dietary Carbohydrates and Gut Microbiota in Promoting Cardiometabolic and Immunological Health in Obesity: Lessons from Healthy Non-Obese Individuals. Frontiers in nutrition. 2017;4:34.
  484. Vivekananda MR, Vandana KL, Bhat KG. Effect of the probiotic Lactobacilli reuteri (Prodentis) in the management of periodontal disease: a preliminary randomized clinical trial. Journal of oral microbiology. Nov 2 2010;2.
  485. Vogel RF, Lohmann M, Nguyen M, Weller AN, Hammes WP. Molecular characterization of Lactobacillus curvatus and Lact. sake isolated from sauerkraut and their application in sausage fermentations. J Appl Bacteriol. Mar 1993;74(3):295-300.
  486. Vujic G, Jajac Knez A, Despot Stefanovic V, Kuzmic Vrbanovic V. Efficacy of orally applied probiotic capsules for bacterial vaginosis and other vaginal infections: a double-blind, randomized, placebo-controlled study. European journal of obstetrics, gynecology, and reproductive biology. May 2013;168(1):75-79.
  487. Wagner RD, Johnson SJ. Probiotic lactobacillus and estrogen effects on vaginal epithelial gene expression responses to Candida albicans. J Biomed Sci. Jun 20 2012;19:58.
  488. Wahlstrom A, Sayin SI, Marschall HU, Backhed F. Intestinal Crosstalk between Bile Acids and Microbiota and Its Impact on Host Metabolism. Cell metabolism. Jul 12 2016;24(1):41-50.
  489. Waki N, Matsumoto M, Fukui Y, Suganuma H. Effects of probiotic Lactobacillus brevis KB290 on incidence of influenza infection among schoolchildren: an open-label pilot study. Lett Appl Microbiol. Dec 2014;59(6):565-571.
  490. Wallace CJK, Milev R. The effects of probiotics on depressive symptoms in humans: a systematic review. Annals of general psychiatry. 2017;16:14.
  491. Wan XQ, Tang DS, Liu AP, Tan SY, Li WK, Kuang J, Li HM. [Isolation of a wild-type virulent phage of Helicobacter pylori and its simulated treatments of gastrointestinal Hp in vitro]. Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University. Feb 2011;31(2):304-307.
  492. Wang C, Du M, Zheng D, Kong F, Zu G, Feng Y. Purification and characterization of nattokinase from Bacillus subtilis natto B-12. Journal of agricultural and food chemistry. Oct 28 2009;57(20):9722-9729.
  493. Wang J, Li F, Tian Z. Role of microbiota on lung homeostasis and diseases. Science China. Life sciences. Dec 2017;60(12):1407-1415.
  494. Wang JZ, Du WT, Xu YL, Cheng SZ, Liu ZJ. Gut microbiome-based medical methodologies for early-stage disease prevention. Microbial pathogenesis. Apr 2017;105:122-130.
  495. Wang Y, Kuang Z, Yu X, Ruhn KA, Kubo M, Hooper LV. The intestinal microbiota regulates body composition through NFIL3 and the circadian clock. Science (New York, N.Y.). Sep 1 2017;357(6354):912-916.
  496. Wasfi R, Abd El-Rahman OA, Zafer MM, Ashour HM. Probiotic Lactobacillus sp. inhibit growth, biofilm formation and gene expression of caries-inducing Streptococcus mutans. Journal of cellular and molecular medicine. Mar 2018;22(3):1972-1983.
  497. Watson H, Mitra S, Croden FC, Taylor M, Wood HM, Perry SL, . . . Hull MA. A randomised trial of the effect of omega-3 polyunsaturated fatty acid supplements on the human intestinal microbiota. Gut. Sep 26 2017.
  498. Weese JS, Martin H. Assessment of commercial probiotic bacterial contents and label accuracy. The Canadian veterinary journal = La revue veterinaire canadienne. Jan 2011;52(1):43-46.
  499. Weljie AM, Meerlo P, Goel N, Sengupta A, Kayser MS, Abel T, . . . Sehgal A. Oxalic acid and diacylglycerol 36:3 are cross-species markers of sleep debt. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb 24 2015;112(8):2569-2574.
  500. West CE, Jenmalm MC, Kozyrskyj AL, Prescott SL. Probiotics for treatment and primary prevention of allergic diseases and asthma: looking back and moving forward. Expert review of clinical immunology. Jun 2016;12(6):625-639.
  501. West NP, Horn PL, Pyne DB, Gebski VJ, Lahtinen SJ, Fricker PA, Cripps AW. Probiotic supplementation for respiratory and gastrointestinal illness symptoms in healthy physically active individuals. Clinical nutrition (Edinburgh, Scotland). Aug 2014;33(4):581-587.
  502. Whisner CM, Castillo LF. Prebiotics, Bone and Mineral Metabolism. Calcified tissue international. Oct 27 2017.
  503. Whiteside SA, Razvi H, Dave S, Reid G, Burton JP. The microbiome of the urinary tract--a role beyond infection. Nature reviews. Urology. Feb 2015;12(2):81-90.
  504. Wilkins T, Sequoia J. Probiotics for Gastrointestinal Conditions: A Summary of the Evidence. American family physician. Aug 1 2017;96(3):170-178.
  505. Wischmeyer PE, McDonald D, Knight R. Role of the microbiome, probiotics, and 'dysbiosis therapy' in critical illness. Current opinion in critical care. Aug 2016;22(4):347-353.
  506. Witkowska-Zimny M, Kaminska-El-Hassan E. Cells of human breast milk. Cellular & molecular biology letters. 2017;22:11.
  507. Wollina U. Microbiome in atopic dermatitis. Clin Cosmet Investig Dermatol. 2017;10:51-56.
  508. Wong VW, Martindale RG, Longaker MT, Gurtner GC. From germ theory to germ therapy: skin microbiota, chronic wounds, and probiotics. Plastic and reconstructive surgery. Nov 2013;132(5):854e-861e.
  509. Wu H, Esteve E, Tremaroli V, Khan MT, Caesar R, Manneras-Holm L, . . . Backhed F. Metformin alters the gut microbiome of individuals with treatment-naive type 2 diabetes, contributing to the therapeutic effects of the drug. Nat Med. Jul 2017;23(7):850-858.
  510. Xiao JZ, Kondo S, Yanagisawa N, Miyaji K, Enomoto K, Sakoda T, . . . Enomoto T. Clinical efficacy of probiotic Bifidobacterium longum for the treatment of symptoms of Japanese cedar pollen allergy in subjects evaluated in an environmental exposure unit. Allergology international: official journal of the Japanese Society of Allergology. Mar 2007;56(1):67-75.
  511. Xu Z, Knight R. Dietary effects on human gut microbiome diversity. The British journal of nutrition. Jan 2015;113 Suppl:S1-5.
  512. Yamamoto K, Yokoyama K, Matsukawa T, Kato S, Kato S, Yamada K, Hirota T. Efficacy of prolonged ingestion of Lactobacillus acidophilus L-92 in adult patients with atopic dermatitis. J Dairy Sci. Jul 2016;99(7):5039-5046.
  513. Yamazaki Y, Nakamura Y, Nunez G. Role of the microbiota in skin immunity and atopic dermatitis. Allergology international: official journal of the Japanese Society of Allergology. Oct 2017;66(4):539-544.
  514. Yang BG, Hur KY, Lee MS. Alterations in Gut Microbiota and Immunity by Dietary Fat. Yonsei medical journal. Nov 2017;58(6):1083-1091.
  515. Yang L, Chaudhary N, Baghdadi J, Pei Z. Microbiome in reflux disorders and esophageal adenocarcinoma. Cancer J. May-Jun 2014;20(3):207-210.
  516. Yatsunenko T, Rey FE, Manary MJ, Trehan I, Dominguez-Bello MG, Contreras M, . . . Gordon JI. Human gut microbiome viewed across age and geography. Nature. May 9 2012;486(7402):222-227.
  517. Yen M, Cairns LS, Camilli A. A cocktail of three virulent bacteriophages prevents Vibrio cholerae infection in animal models. Nature communications. Feb 1 2017;8:14187.
  518. Yousuf A, Sidiq M, Ganta S, Nagaraj A, Vishnani P, Jan I. Effect of Freeze Dried Powdered Probiotics on Gingival Status and Plaque Inhibition: A Randomized, Double-blind, Parallel Study. Contemporary clinical dentistry. Jan-Mar 2017;8(1):116-121.
  519. Zapata HJ, Quagliarello VJ. The microbiota and microbiome in aging: potential implications in health and age-related diseases. J Am Geriatr Soc. Apr 2015;63(4):776-781.
  520. Zarrinpar A, Chaix A, Panda S. Daily Eating Patterns and Their Impact on Health and Disease. Trends in endocrinology and metabolism: TEM. Feb 2016;27(2):69-83.
  521. Zhang MM, Qian W, Qin YY, He J, Zhou YH. Probiotics in Helicobacter pylori eradication therapy: a systematic review and meta-analysis. World journal of gastroenterology: WJG. Apr 14 2015;21(14):4345-4357.
  522. Zhang Y, Li L, Guo C, Mu D, Feng B, Zuo X, Li Y. Effects of probiotic type, dose and treatment duration on irritable bowel syndrome diagnosed by Rome III criteria: a meta-analysis. BMC Gastroenterol. Jun 13 2016;16(1):62.
  523. Zhao Y, Yu YB. Intestinal microbiota and chronic constipation. Springerplus. 2016;5(1):1130.
  524. Zheng H, Liang H, Wang Y, Miao M, Shi T, Yang F, . . . Li DK. Altered Gut Microbiota Composition Associated with Eczema in Infants. PloS one. 2016;11(11):e0166026.
  525. Zhou L, Foster JA. Psychobiotics and the gut-brain axis: in the pursuit of happiness. Neuropsychiatr Dis Treat. 2015;11:715-723.
  526. Zoccali G, Cinque B, La Torre C, Lombardi F, Palumbo P, Romano L, . . . Giuliani M. Improving the outcome of fractional CO2 laser resurfacing using a probiotic skin cream: Preliminary clinical evaluation. Lasers in medical science. Nov 2016;31(8):1607-1611.
  527. Zocco MA, dal Verme LZ, Cremonini F, Piscaglia AC, Nista EC, Candelli M, . . . Gasbarrini A. Efficacy of Lactobacillus GG in maintaining remission of ulcerative colitis. Alimentary pharmacology & therapeutics. Jun 1 2006;23(11):1567-1574.
  528. Zukiewicz-Sobczak W, Wroblewska P, Adamczuk P, Silny W. Probiotic lactic acid bacteria and their potential in the prevention and treatment of allergic diseases. Central-European journal of immunology / Polish Society for Immunology and eleven other Central-European immunological societies. 2014;39(1):104-108.
  529. Zupancic K, Kriksic V, Kovacevic I, Kovacevic D. Influence of Oral Probiotic Streptococcus salivarius K12 on Ear and Oral Cavity Health in Humans: Systematic Review. Probiotics and antimicrobial proteins. Jun 2017;9(2):102-110.

Купить добавки из статей можно в международном онлайн магазине iHerb,
специализирующийся на продукции высокого качества из натуральных органических
ингредиентов

используя промокод WNT909 журнала PUSHKAR при заказе,
вы получите 5% скидку, а также благодарите и поддерживаете журнал.
применить код можно перейдя в магазин по этой ссылке перед оформлением заказа

1 комментарий: